RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311101.9

PARL-201, Transcript of presenilin associated rhomboid like, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PARL, Length 1,240 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARL-201ENST00000311101 TMEM240Q5SV17 173 aa22.64■■□□□ 1.21
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PARL-201ENST00000311101 ZNF697Q5TEC3 545 aa22.58■■□□□ 1.21
PARL-201ENST00000311101 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
PARL-201ENST00000311101 AFAP1L1Q8TED9 768 aa22.58■■□□□ 1.21
PARL-201ENST00000311101 WASF1Q92558 559 aa22.58■■□□□ 1.21
PARL-201ENST00000311101 ERAP1Q9NZ08 941 aa22.58■■□□□ 1.21
PARL-201ENST00000311101 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
PARL-201ENST00000311101 TANC1Q9C0D5 1861 aa22.58■■□□□ 1.2
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PARL-201ENST00000311101 SELPP16109 830 aa22.57■■□□□ 1.2
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PARL-201ENST00000311101 CCDC83Q8IWF9 413 aa22.57■■□□□ 1.2
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PARL-201ENST00000311101 LMBR1Q8WVP7 490 aa22.57■■□□□ 1.2
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PARL-201ENST00000311101 MSH4O15457 936 aa22.56■■□□□ 1.2
PARL-201ENST00000311101 TDP2O95551 362 aa22.56■■□□□ 1.2
PARL-201ENST00000311101 RFC2P35250 354 aa22.56■■□□□ 1.2
PARL-201ENST00000311101 FOSBP53539 338 aa22.56■■□□□ 1.2
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PARL-201ENST00000311101 ZNF618Q5T7W0 954 aa22.56■■□□□ 1.2
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PARL-201ENST00000311101 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
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PARL-201ENST00000311101 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
PARL-201ENST00000311101 TBC1D22BQ9NU19 505 aa22.55■■□□□ 1.2
PARL-201ENST00000311101 NRCAMQ92823 1304 aa22.55■■□□□ 1.2
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