RNA–Protein interactions for RNA: YER167W

BCK2, Transcript of Serine/threonine-rich protein involved in PKC1 signaling pathway, yeast

Gene BCK2, Length 2,556 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BCK2	YER167W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	YDR239C	Q03780	787 aa		3.87	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	YPR078C	Q06813	372 aa		3.87	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	RXT3	Q07458	294 aa		3.87	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	MFG1	Q07684	458 aa		3.87	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	EMP46	Q12396	444 aa		3.87	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	WIP1	Q2V2P8	89 aa		3.87	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	MAS1	P10507	462 aa		3.87	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	SPO7	P18410	259 aa		3.87	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	APL1	P27351	700 aa		3.87	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	EMP70	P32802	667 aa		3.87	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	SPT10	P35208	640 aa		3.87	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	FLR1	P38124	548 aa		3.87	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	MAL33	P38157	468 aa		3.87	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	SKN7	P38889	622 aa		3.87	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	ALP1	P38971	573 aa		3.87	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	AIM22	P47051	409 aa		3.87	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	YNL165W	P53891	406 aa		3.87	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	STD1	Q02794	444 aa		3.87	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	HER2	Q03557	464 aa		3.87	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	YMR209C	Q03648	457 aa		3.87	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	EKI1	Q03764	534 aa		3.87	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	TRI1	Q05024	226 aa		3.87	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	GLO2	Q05584	274 aa		3.87	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	MCM21	Q06675	368 aa		3.87	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.87	□□□□□ -1.79	not detected
BCK2	YER167W	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		3.87	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	GAL80	P04387	435 aa		3.86	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	CLN3	P13365	580 aa		3.86	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	URA4	P20051	364 aa		3.86	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	MLF3	P32047	452 aa		3.86	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	ICS2	P38284	255 aa		3.86	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	EXO5	P38289	585 aa		3.86	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	MIC12	P38341	106 aa		3.86	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	YGR201C	P42936	225 aa		3.86	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	YGR149W	P48236	432 aa		3.86	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	HNT2	P49775	206 aa		3.86	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	YIP5	P53108	310 aa		3.86	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	YNL260C	P53846	198 aa		3.86	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	BCH1	Q05029	724 aa		3.86	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	VTA1	Q06263	330 aa		3.86	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	YPL150W	Q12152	901 aa		3.86	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	SNF8	Q12483	233 aa		3.86	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		3.86	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	MDS3	P53094	1487 aa		3.86	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	YSR3	P23501	404 aa		3.86	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	YCL002C	P25565	263 aa		3.86	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	FUN26	P31381	517 aa		3.86	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	NUD1	P32336	851 aa		3.86	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	CSG2	P35206	410 aa		3.86	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	SRL3	P36167	246 aa		3.86	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	MMS21	P38632	267 aa		3.86	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	BIG1	P38813	335 aa		3.86	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	NUP60	P39705	539 aa		3.86	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	BDH1	P39714	382 aa		3.86	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	YMR134W	P40207	237 aa		3.86	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	BUD8	P41698	603 aa		3.86	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	BAP3	P41815	604 aa		3.86	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	TDA10	P42938	290 aa		3.86	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	TAH11	P47112	604 aa		3.86	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	YJR054W	P47114	497 aa		3.86	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	YPT11	P48559	417 aa		3.86	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	LSC2	P53312	427 aa		3.86	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	YLR407W	Q06070	228 aa		3.86	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	NSE1	Q07913	336 aa		3.86	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	RUP1	Q12242	671 aa		3.86	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	HTB2	P02294	131 aa		3.85	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	DST1	P07273	309 aa		3.85	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	FRE1	P32791	686 aa		3.85	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.85	□□□□□ -1.79	not detected
BCK2	YER167W	SPT23	P35210	1082 aa		3.85	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	SDH8	P38345	138 aa		3.85	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	SRP14	P38985	146 aa		3.85	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	YER130C	P39959	443 aa		3.85	□□□□□ -1.79
BCK2	YER167W	MAF1	P41910	395 aa		3.85	□□□□□ -1.79

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