RNA–Protein interactions for RNA: YAL059W

ECM1, Transcript of Pre-ribosomal factor involved in 60S ribosomal protein subunit export, yeast

Gene ECM1, Length 639 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ECM1	YAL059W	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
ECM1	YAL059W	OCT1	P35999	772 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	MAL32	P38158	584 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	UIP3	P39547	235 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	BIO3	P50277	480 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	MAL12	P53341	584 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	YDR109C	Q04585	715 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	THI7	Q05998	598 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	MRPL35	Q06678	367 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	BSC6	Q08280	497 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	INP53	Q12271	1107 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	GLE1	Q12315	538 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	COX1	P00401	534 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	YUR1	P26725	428 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	HXT1	P32465	570 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	HOT13	P36078	116 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	ALP1	P38971	573 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	YER130C	P39959	443 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	YFL015C	P43578	164 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	TOS3	P43637	560 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	YNL260C	P53846	198 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	RTC4	P53850	401 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	STD1	Q02794	444 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	LOT6	Q07923	191 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	YOS9	Q99220	542 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ECM1	YAL059W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ECM1	YAL059W	YPK2	P18961	677 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ECM1	YAL059W	SPE2	P21182	396 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ECM1	YAL059W	HXT2	P23585	541 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ECM1	YAL059W	ELO2	P25358	347 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ECM1	YAL059W	GAC1	P28006	793 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ECM1	YAL059W	PSO2	P30620	661 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ECM1	YAL059W	YPS1	P32329	569 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ECM1	YAL059W	ATP11	P32453	318 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ECM1	YAL059W	ACP1	P32463	125 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ECM1	YAL059W	CDC5	P32562	705 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ECM1	YAL059W	ECT1	P33412	323 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ECM1	YAL059W	LHS1	P36016	881 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ECM1	YAL059W	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ECM1	YAL059W	ELO1	P39540	310 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ECM1	YAL059W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ECM1	YAL059W	LOH1	P47055	219 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ECM1	YAL059W	MSY1	P48527	492 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ECM1	YAL059W	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ECM1	YAL059W	TAF12	Q03761	539 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ECM1	YAL059W	URH1	Q04179	340 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ECM1	YAL059W	GGA1	Q06336	557 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ECM1	YAL059W	CTS2	Q06350	511 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ECM1	YAL059W	GET4	Q12125	312 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ECM1	YAL059W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.83	□□□□□ -1.64	not detected
ECM1	YAL059W	AAC1	P04710	309 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECM1	YAL059W	MAS1	P10507	462 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECM1	YAL059W	RAP1	P11938	827 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECM1	YAL059W	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ECM1	YAL059W	GSY2	P27472	705 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECM1	YAL059W	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ECM1	YAL059W	RPC25	P35718	212 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECM1	YAL059W	HES1	P35843	434 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECM1	YAL059W	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ECM1	YAL059W	NUP133	P36161	1157 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECM1	YAL059W	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ECM1	YAL059W	VHC1	P38329	1120 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECM1	YAL059W	PCA1	P38360	1216 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECM1	YAL059W	YMR262W	P38430	313 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECM1	YAL059W	YHR210C	P38893	341 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECM1	YAL059W	STN1	P38960	494 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECM1	YAL059W	YGL108C	P53139	140 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECM1	YAL059W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ECM1	YAL059W	SLT2	Q00772	484 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECM1	YAL059W	COQ9	Q05779	260 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECM1	YAL059W	PDR8	Q06149	701 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECM1	YAL059W	CYK3	Q07533	885 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECM1	YAL059W	PEX27	Q08580	376 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECM1	YAL059W	ATG9	Q12142	997 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ECM1	YAL059W	RHO2	P06781	192 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECM1	YAL059W	AQY1	P0CD91	305 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECM1	YAL059W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ECM1	YAL059W	DAL2	P25335	343 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECM1	YAL059W	KRE2	P27809	442 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECM1	YAL059W	PRR1	P28708	518 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECM1	YAL059W	MRPL9	P31334	269 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECM1	YAL059W	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ECM1	YAL059W	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ECM1	YAL059W	SPC97	P38863	823 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECM1	YAL059W	GPI16	P38875	610 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECM1	YAL059W	CIN4	P39110	191 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ECM1	YAL059W	ECM10	P39987	644 aa		4.81	□□□□□ -1.64

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