RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635231.1

QARS-238, Transcript of glutaminyl-tRNA synthetase, human

TSL 4

Gene QARS, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
QARS-238	ENST00000635231	HOXC8	P31273	242 aa		12.05	□□□□□ -0.48
QARS-238	ENST00000635231	ICAM3	P32942	547 aa		12.05	□□□□□ -0.48
QARS-238	ENST00000635231	HIC1	Q14526	733 aa		12.05	□□□□□ -0.48
QARS-238	ENST00000635231	METTL7B	Q6UX53	244 aa		12.05	□□□□□ -0.48
QARS-238	ENST00000635231	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		12.05	□□□□□ -0.48
QARS-238	ENST00000635231	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
QARS-238	ENST00000635231	GJD3	Q8N144	294 aa		12.05	□□□□□ -0.48
QARS-238	ENST00000635231	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
QARS-238	ENST00000635231	APBB2	Q92870	758 aa		12.05	□□□□□ -0.48
QARS-238	ENST00000635231	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
QARS-238	ENST00000635231	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		12.05	□□□□□ -0.48
QARS-238	ENST00000635231	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
QARS-238	ENST00000635231	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
QARS-238	ENST00000635231	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		12.04	□□□□□ -0.48
QARS-238	ENST00000635231	TREH	O43280	583 aa		12.04	□□□□□ -0.48
QARS-238	ENST00000635231	FIBP	O43427	364 aa		12.04	□□□□□ -0.48
QARS-238	ENST00000635231	IGHD	P01880	384 aa		12.04	□□□□□ -0.48
QARS-238	ENST00000635231	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
QARS-238	ENST00000635231	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
QARS-238	ENST00000635231	WTAP	Q15007	396 aa		12.04	□□□□□ -0.48
QARS-238	ENST00000635231	EPC2	Q52LR7	807 aa		12.04	□□□□□ -0.48
QARS-238	ENST00000635231	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		12.04	□□□□□ -0.48
QARS-238	ENST00000635231	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	12.04	□□□□□ -0.48
QARS-238	ENST00000635231	TOP1MT	Q969P6	601 aa		12.04	□□□□□ -0.48
QARS-238	ENST00000635231	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
QARS-238	ENST00000635231	FAM50B	Q9Y247	325 aa		12.04	□□□□□ -0.48
QARS-238	ENST00000635231	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		12.03	□□□□□ -0.48
QARS-238	ENST00000635231	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		12.03	□□□□□ -0.48
QARS-238	ENST00000635231		H3BNC9	293 aa		12.03	□□□□□ -0.48
QARS-238	ENST00000635231	UPP2	O95045	317 aa		12.03	□□□□□ -0.48
QARS-238	ENST00000635231	CTSH	P09668	335 aa		12.03	□□□□□ -0.48
QARS-238	ENST00000635231	ALAD	P13716	330 aa		12.03	□□□□□ -0.48
QARS-238	ENST00000635231	GPM6B	Q13491	265 aa		12.03	□□□□□ -0.48
QARS-238	ENST00000635231	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
QARS-238	ENST00000635231	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		12.03	□□□□□ -0.48
QARS-238	ENST00000635231	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		12.03	□□□□□ -0.48
QARS-238	ENST00000635231	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		12.03	□□□□□ -0.48
QARS-238	ENST00000635231	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		12.03	□□□□□ -0.48
QARS-238	ENST00000635231	TMEM192	Q8IY95	271 aa		12.03	□□□□□ -0.48
QARS-238	ENST00000635231	BANK1	Q8NDB2	785 aa		12.03	□□□□□ -0.48
QARS-238	ENST00000635231	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
QARS-238	ENST00000635231	CUL5	Q93034	780 aa		12.03	□□□□□ -0.48
QARS-238	ENST00000635231	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
QARS-238	ENST00000635231	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
QARS-238	ENST00000635231	MUC3A	Q02505	3323 aa		12.02	□□□□□ -0.49
QARS-238	ENST00000635231	NCK2	O43639	380 aa		12.02	□□□□□ -0.49
QARS-238	ENST00000635231	CYTH3	O43739	400 aa		12.02	□□□□□ -0.49
QARS-238	ENST00000635231	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
QARS-238	ENST00000635231	ARHGAP4	P98171	946 aa		12.02	□□□□□ -0.49
QARS-238	ENST00000635231	TROAP	Q12815	778 aa		12.02	□□□□□ -0.49
QARS-238	ENST00000635231	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		12.02	□□□□□ -0.49
QARS-238	ENST00000635231	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
QARS-238	ENST00000635231	NLRX1	Q86UT6	975 aa		12.02	□□□□□ -0.49
QARS-238	ENST00000635231	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
QARS-238	ENST00000635231	NCOA7	Q8NI08	942 aa		12.02	□□□□□ -0.49
QARS-238	ENST00000635231	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		12.02	□□□□□ -0.49
QARS-238	ENST00000635231	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	12.02	□□□□□ -0.49
QARS-238	ENST00000635231	GPR20	Q99678	358 aa		12.02	□□□□□ -0.49
QARS-238	ENST00000635231	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		12.02	□□□□□ -0.49
QARS-238	ENST00000635231	CD320	Q9NPF0	282 aa		12.02	□□□□□ -0.49
QARS-238	ENST00000635231	SETD4	Q9NVD3	440 aa		12.02	□□□□□ -0.49
QARS-238	ENST00000635231	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		12.02	□□□□□ -0.49
QARS-238	ENST00000635231	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		12.02	□□□□□ -0.49
QARS-238	ENST00000635231	TRANK1	O15050	2925 aa		12.02	□□□□□ -0.49
QARS-238	ENST00000635231	LAMA4	Q16363	1823 aa		12.02	□□□□□ -0.49
QARS-238	ENST00000635231	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		12.01	□□□□□ -0.49
QARS-238	ENST00000635231	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
QARS-238	ENST00000635231	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		12.01	□□□□□ -0.49
QARS-238	ENST00000635231	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		12.01	□□□□□ -0.49
QARS-238	ENST00000635231	RB1	P06400	928 aa		12.01	□□□□□ -0.49
QARS-238	ENST00000635231	IL9	P15248	144 aa		12.01	□□□□□ -0.49
QARS-238	ENST00000635231	KIF5B	P33176	963 aa		12.01	□□□□□ -0.49
QARS-238	ENST00000635231	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
QARS-238	ENST00000635231	FAM26D	Q5JW98	314 aa		12.01	□□□□□ -0.49
QARS-238	ENST00000635231	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		12.01	□□□□□ -0.49
QARS-238	ENST00000635231	RSPH3	Q86UC2	560 aa		12.01	□□□□□ -0.49
QARS-238	ENST00000635231	FIBCD1	Q8N539	461 aa		12.01	□□□□□ -0.49
QARS-238	ENST00000635231	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
QARS-238	ENST00000635231	NEK9	Q8TD19	979 aa		12.01	□□□□□ -0.49
QARS-238	ENST00000635231	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
QARS-238	ENST00000635231	IL17RA	Q96F46	866 aa		12.01	□□□□□ -0.49
QARS-238	ENST00000635231	CDHR1	Q96JP9	859 aa		12.01	□□□□□ -0.49
QARS-238	ENST00000635231	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
QARS-238	ENST00000635231	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		12.01	□□□□□ -0.49
QARS-238	ENST00000635231	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		12.01	□□□□□ -0.49
QARS-238	ENST00000635231	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
QARS-238	ENST00000635231	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		12.01	□□□□□ -0.49
QARS-238	ENST00000635231	NRCAM	Q92823	1304 aa		12.01	□□□□□ -0.49
QARS-238	ENST00000635231	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
QARS-238	ENST00000635231	PRR33	A8MZF0	331 aa		12	□□□□□ -0.49
QARS-238	ENST00000635231	CYP21A2	P08686	494 aa		12	□□□□□ -0.49
QARS-238	ENST00000635231	CTNNB1	P35222	781 aa		12	□□□□□ -0.49
QARS-238	ENST00000635231	GNAQ	P50148	359 aa		12	□□□□□ -0.49
QARS-238	ENST00000635231	SEMA3F	Q13275	785 aa		12	□□□□□ -0.49
QARS-238	ENST00000635231	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		12	□□□□□ -0.49
QARS-238	ENST00000635231	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		12	□□□□□ -0.49
QARS-238	ENST00000635231	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		12	□□□□□ -0.49
QARS-238	ENST00000635231	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		12	□□□□□ -0.49
QARS-238	ENST00000635231	RPAIN	Q86UA6	219 aa		12	□□□□□ -0.49
QARS-238	ENST00000635231	TRIM50	Q86XT4	487 aa		12	□□□□□ -0.49

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