RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493706.1

XRCC5-210, Transcript of X-ray repair cross complementing 5, human

TSL 2

Gene XRCC5, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
XRCC5-210	ENST00000493706	ANKRD62	A6NC57	917 aa		4.94	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706		B4E1Z4	1266 aa		4.94	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706		M0R2C6	588 aa		4.94	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	TRAF5	O00463	557 aa		4.94	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	KCNK3	O14649	394 aa		4.94	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	KPNA6	O60684	536 aa		4.94	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	APP	P05067	770 aa		4.94	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	KRT15	P19012	456 aa		4.94	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	SLC6A11	P48066	632 aa		4.94	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	MAPKAPK2	P49137	400 aa		4.94	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	JAM2	P57087	298 aa		4.94	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	YBX1	P67809	324 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	PRR5	P85299	388 aa		4.94	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		4.94	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	NR1I3	Q14994	352 aa		4.94	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	CRY1	Q16526	586 aa		4.94	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	TMEM177	Q53S58	311 aa		4.94	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		4.94	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		4.94	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	EMC4	Q5J8M3	183 aa		4.94	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		4.94	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	UBE2R2	Q712K3	238 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	MILR1	Q7Z6M3	343 aa		4.94	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	ZNF605	Q86T29	641 aa		4.94	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	DCP2	Q8IU60	420 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	UBR7	Q8N806	425 aa		4.94	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	SEC14L1	Q92503	715 aa		4.94	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	PEX11G	Q96HA9	241 aa		4.94	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	DIRC2	Q96SL1	478 aa		4.94	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	SPC25	Q9HBM1	224 aa		4.94	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	PALD1	Q9ULE6	856 aa		4.94	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		4.94	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		4.93	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	KRIT1	O00522	736 aa		4.93	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	SLC27A2	O14975	620 aa		4.93	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	GSTA4	O15217	222 aa		4.93	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	DNAJC6	O75061	913 aa		4.93	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	NPTXR	O95502	500 aa		4.93	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	LTF	P02788	710 aa		4.93	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	VIPR1	P32241	457 aa		4.93	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	FLT3	P36888	993 aa		4.93	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	GPR19	Q15760	415 aa		4.93	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	PLEKHN1	Q494U1	663 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		4.93	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	RNF180	Q86T96	592 aa		4.93	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		4.93	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		4.93	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		4.93	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	DSE	Q9UL01	958 aa		4.93	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		4.93	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	MYOCOS	A0A1B0GUC4	107 aa		4.92	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		4.92	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	STAT3	P40763	770 aa		4.92	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	CHRNA2	Q15822	529 aa		4.92	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		4.92	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		4.92	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		4.92	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	TMC6	Q7Z403	805 aa		4.92	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		4.92	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	AHI1	Q8N157	1196 aa		4.92	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	NXPE1	Q8N323	547 aa		4.92	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		4.92	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		4.92	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		4.92	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		4.92	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	CD244	Q9BZW8	370 aa		4.92	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		4.92	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		4.92	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	MYOT	Q9UBF9	498 aa		4.92	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		4.92	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		4.92	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		4.92	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	CBX4	O00257	560 aa		4.91	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	MAN2B1	O00754	1011 aa		4.91	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	ABLIM1	O14639	778 aa		4.91	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	ZBTB7A	O95365	584 aa		4.91	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	C1QTNF9	P0C862	333 aa		4.91	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		4.91	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	TUSC3	Q13454	348 aa		4.91	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		4.91	□□□□□ -1.62
XRCC5-210	ENST00000493706	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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