RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493436.5

SH3BP4-211, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 481 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-211ENST00000493436 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
SH3BP4-211ENST00000493436 TEX2Q8IWB9 1127 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP4-211ENST00000493436 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
SH3BP4-211ENST00000493436 CAGE1Q8TC20 777 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP4-211ENST00000493436 VWCEQ96DN2 955 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP4-211ENST00000493436 CDHR1Q96JP9 859 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP4-211ENST00000493436 GPR20Q99678 358 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP4-211ENST00000493436 SEMA6BQ9H3T3 888 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP4-211ENST00000493436 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP4-211ENST00000493436 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
SH3BP4-211ENST00000493436 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP4-211ENST00000493436 GRXCR1A8MXD5 290 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP4-211ENST00000493436 H3BRB1 525 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP4-211ENST00000493436 FOSP01100 380 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
SH3BP4-211ENST00000493436 SCG2P13521 617 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP4-211ENST00000493436 DNAJB2P25686 324 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP4-211ENST00000493436 RFC2P35250 354 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP4-211ENST00000493436 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
SH3BP4-211ENST00000493436 PGBD1Q96JS3 809 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP4-211ENST00000493436 GUCD1Q96NT3 240 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP4-211ENST00000493436 GLT8D2Q9H1C3 349 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP4-211ENST00000493436 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
SH3BP4-211ENST00000493436 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
SH3BP4-211ENST00000493436 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP4-211ENST00000493436 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP4-211ENST00000493436 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
SH3BP4-211ENST00000493436 ATP9AO75110 1047 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP4-211ENST00000493436 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
SH3BP4-211ENST00000493436 MTMR1Q13613 665 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP4-211ENST00000493436 AFAP1L1Q8TED9 768 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP4-211ENST00000493436 ANO3Q9BYT9 981 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP4-211ENST00000493436 TM6SF1Q9BZW5 370 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP4-211ENST00000493436 JADE2Q9NQC1 790 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP4-211ENST00000493436 TELO2Q9Y4R8 837 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP4-211ENST00000493436 TMEM265A0A087WTH1 108 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 ZBBXA8MT70 800 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 MAFGO15525 162 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 KCNA2P16389 499 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 EVCP57679 992 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 CCT2P78371 535 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 PTK7Q13308 1070 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 AP3B2Q13367 1082 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 PHKBQ93100 1093 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 PBX4Q9BYU1 374 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP19.14■□□□□ 0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 TMEM260Q9NX78 707 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 PKD2L1Q9P0L9 805 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 CKBP12277 381 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 ACTN1P12814 892 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 SELPP16109 830 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 PBX2P40425 430 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 CLK2P49760 499 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 RBL2Q08999 1139 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 HIC1Q14526 733 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 NTRK3Q16288 839 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 PKN1Q16512 942 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 LRRC8DQ7L1W4 858 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 TRIM50Q86XT4 487 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 TIFAQ96CG3 184 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 MXRA8Q9BRK3 442 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 C17orf102A2RUQ5 167 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 PPFIA3O75145 1194 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 IFNAR1P17181 557 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 SLC26A6Q9BXS9 759 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 ZMYND12Q9H0C1 365 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 RNPEPQ9H4A4 650 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 ESYT2A0FGR8 921 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 SREBF1P36956 1147 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 RAB30Q15771 203 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 CYP2W1Q8TAV3 490 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 SEPT1Q8WYJ6 367 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 ATP6V0A1Q93050 837 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 WNT8BQ93098 351 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF576Q9H609 170 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 C6orf50Q9HD87 102 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 KCNH7Q9NS40 1196 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 PDRG1Q9NUG6 133 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 MSRAQ9UJ68 235 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 PARNO95453 639 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 HOXC8P31273 242 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF76P36508 570 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP4-211ENST00000493436 ARHGAP4P98171 946 aa19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.7 ms