RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442720.5

SGO1-209, Transcript of shugoshin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SGO1, Length 2,266 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO1-209ENST00000442720 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa21.45■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 RCCD1A6NED2 376 aa21.44■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 GNA14O95837 355 aa21.44■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 CIITAP33076 1130 aa21.44■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 PLA2G4AP47712 749 aa21.44■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa21.44■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 NEK11Q8NG66 645 aa21.44■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 LENG9Q96B70 501 aa21.44■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa21.44■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 EDEM3Q9BZQ6 932 aa21.44■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 LACRTQ9GZZ8 138 aa21.44■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa21.44■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 EMILIN3Q9NT22 766 aa21.44■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 PRR12Q9ULL5 1215 aa21.44■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 POTEFA5A3E0 1075 aa21.44■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 CCDC151A5D8V7 595 aa21.44■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 POTEIP0CG38 1075 aa21.44■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 RPA1P27694 616 aa21.44■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 VAV2P52735 878 aa21.44■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 ARSHQ5FYA8 562 aa21.44■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 POTEGQ6S5H5 508 aa21.44■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 POTEEQ6S8J3 1075 aa21.44■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 MSANTD4Q8NCY6 345 aa21.44■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 TSGA10Q9BZW7 698 aa21.44■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa21.44■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 DNM3Q9UQ16 869 aa21.44■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 FRMD3A2A2Y4 597 aa21.43■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 TCP10L2B9ZVM9 353 aa21.43■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 FAM86B1E9PN63 330 aa21.43■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 TFRCP02786 760 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 FAM86B2P0C5J1 330 aa21.43■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 CYP27A1Q02318 531 aa21.43■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 KIF5AQ12840 1032 aa21.43■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 RRAGAQ7L523 313 aa21.43■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 NELFCDQ8IXH7 590 aa21.43■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 OPLAHO14841 1288 aa21.43■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 C21orf2O43822 256 aa21.43■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 TBC1D8O95759 1140 aa21.43■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 ERCC3P19447 782 aa21.43■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 SPICE1Q8N0Z3 855 aa21.43■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 SCFD1Q8WVM8 642 aa21.43■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa21.43■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 ENC1O14682 589 aa21.42■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 CYP3A4P08684 503 aa21.42■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa21.42■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 ZNF76P36508 570 aa21.42■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa21.42■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 KCNMA1Q12791 1236 aa21.42■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 TRAF1Q13077 416 aa21.42■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 SLC15A2Q16348 729 aa21.42■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 KCTD10Q9H3F6 313 aa21.42■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 ZHX3Q9H4I2 956 aa21.42■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 RAB21Q9UL25 225 aa21.42■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 SAR1BQ9Y6B6 198 aa21.42■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 PIK3CDO00329 1044 aa21.41■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 ZNF263O14978 683 aa21.41■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 MSH4O15457 936 aa21.41■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 USO1O60763 962 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa21.41■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa21.41■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 BAP1Q92560 729 aa21.41■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 SPDYE2BA6NHP3 402 aa21.41■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 LRRC53A6NM62 1247 aa21.41■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 SPDYE6P0CI01 402 aa21.41■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 STAT2P52630 851 aa21.41■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 MARSP56192 900 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 PSMC6P62333 389 aa21.41■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 GIT2Q14161 759 aa21.41■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 PDXDC1Q6P996 788 aa21.41■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 DEF6Q9H4E7 631 aa21.41■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 HDAC6Q9UBN7 1215 aa21.41■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa21.41■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 MEIS1O00470 390 aa21.4■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 LCA5LO95447 670 aa21.4■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 ECE1P42892 770 aa21.4■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa21.4■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 CCDC155Q8N6L0 562 aa21.4■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 FAM151AQ8WW52 585 aa21.4■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 TMX2Q9Y320 296 aa21.4■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 DUSP10Q9Y6W6 482 aa21.4■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 CLRN2A0PK11 232 aa21.4■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 KIF11P52732 1056 aa21.4■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP21.4■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 GRIPAP1Q4V328 841 aa21.4■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 KRT26Q7Z3Y9 468 aa21.4■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 GOPCQ9HD26 462 aa21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms