RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423339.2

CCDC82-202, Transcript of coiled-coil domain containing 82, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC82, Length 1,878 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82-202ENST00000423339 USP53Q70EK8 1073 aa4.47□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 SCUBE1Q8IWY4 988 aa4.47□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa4.47□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 Q8N1X5 172 aa4.47□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 LZTR1Q8N653 840 aa4.47□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 RCBTB1Q8NDN9 531 aa4.47□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 EXOC2Q96KP1 924 aa4.47□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 DHRS4Q9BTZ2 278 aa4.47□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 PCED1AQ9H1Q7 454 aa4.47□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 RXFP1Q9HBX9 757 aa4.47□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 MARCH2Q9P0N8 246 aa4.47□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa4.46□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 BLACEA4D250 179 aa4.46□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 ASMTLO95671 621 aa4.46□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 FUCA1P04066 466 aa4.46□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 LTBRP36941 435 aa4.46□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 HTRA3P83110 453 aa4.46□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 PURAQ00577 322 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 TKFCQ3LXA3 575 aa4.46□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 FAM209AQ5JX71 171 aa4.46□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 IQCEQ6IPM2 695 aa4.46□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 TEX2Q8IWB9 1127 aa4.46□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 USP33Q8TEY7 942 aa4.46□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 CDC6Q99741 560 aa4.46□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 MTA3Q9BTC8 594 aa4.46□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 VPS11Q9H270 941 aa4.46□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 PLD2O14939 933 aa4.45□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 RFPL3O75679 317 aa4.45□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 DBHP09172 617 aa4.45□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 BCL6P41182 706 aa4.45□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 GYS2P54840 703 aa4.45□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 KCNAB2Q13303 367 aa4.45□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 NTRK3Q16288 839 aa4.45□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 BRINP2Q9C0B6 783 aa4.45□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 FBXL7Q9UJT9 491 aa4.45□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 PLAAQ9Y263 795 aa4.45□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa4.45□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa4.45□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 FPR2P25090 351 aa4.45□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 KCNT2Q6UVM3 1135 aa4.45□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 CEP68Q76N32 757 aa4.45□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 SPRED1Q7Z699 444 aa4.45□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 PLEKHO2Q8TD55 490 aa4.45□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 CHAMP1Q96JM3 812 aa4.45□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP4.45□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 NTMQ9P121 344 aa4.45□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa4.45□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 C22orf46C9J442 243 aa4.44□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 F8W031 263 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 KCNQ2O43526 872 aa4.44□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 MSCO60682 206 aa4.44□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 DNAJC6O75061 913 aa4.44□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 NTRK1P04629 796 aa4.44□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 GLI4P10075 376 aa4.44□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 SARSP49591 514 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 RPL11P62913 178 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 TESK1Q15569 626 aa4.44□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 PAQR3Q6TCH7 311 aa4.44□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 GLB1LQ6UWU2 654 aa4.44□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 NLRP10Q86W26 655 aa4.44□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 PHF20Q9BVI0 1012 aa4.44□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 SRGAP3O43295 1099 aa4.43□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 MYO1BO43795 1136 aa4.43□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 CYBBP04839 570 aa4.43□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 NCAM1P13591 858 aa4.43□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 KIAA2012Q0VF49 1180 aa4.43□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 TRIM61Q5EBN2 209 aa4.43□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 WWC2Q6AWC2 1192 aa4.43□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 TTLL7Q6ZT98 887 aa4.43□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 CABP7Q86V35 215 aa4.43□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 DCAF4Q8WV16 495 aa4.43□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 NINJ1Q92982 152 aa4.43□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 TMEM169Q96HH4 297 aa4.43□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF747Q9BV97 191 aa4.43□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 GPR27Q9NS67 375 aa4.43□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 SIT1Q9Y3P8 196 aa4.43□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 CD2APQ9Y5K6 639 aa4.43□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 ASXL2Q76L83 1435 aa4.43□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 GTF2A2P52657 109 aa4.43□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 TGFB2P61812 414 aa4.43□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 LSAMPQ13449 338 aa4.43□□□□□ -1.7
CCDC82-202ENST00000423339 TM4SF20Q53R12 229 aa4.43□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.5 ms