RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 P2RX5Q93086 422 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 PPME1Q9Y570 386 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 KLRF2D3W0D1 207 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 MMP1P03956 469 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 STX1BP61266 288 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 ZBED6P86452 979 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 KRT81Q14533 505 aa9.61□□□□□ -0.87
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PTPRM-202ENST00000400053 NXNQ6DKJ4 435 aa9.61□□□□□ -0.87
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PTPRM-202ENST00000400053 CPXCR1Q8N123 301 aa9.6□□□□□ -0.87
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PTPRM-202ENST00000400053 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
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