RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233330.6

RTKN-201, Transcript of rhotekin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RTKN, Length 2,220 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKN-201ENST00000233330 STK24Q9Y6E0 443 aa21.87■■□□□ 1.09
RTKN-201ENST00000233330 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
RTKN-201ENST00000233330 CXCL9Q07325 125 aa21.87■■□□□ 1.09
RTKN-201ENST00000233330 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa21.87■■□□□ 1.09
RTKN-201ENST00000233330 TBC1D7Q9P0N9 293 aa21.87■■□□□ 1.09
RTKN-201ENST00000233330 SIK3Q9Y2K2 1263 aa21.87■■□□□ 1.09
RTKN-201ENST00000233330 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa21.86■■□□□ 1.09
RTKN-201ENST00000233330 PLA2G6O60733 806 aa21.86■■□□□ 1.09
RTKN-201ENST00000233330 CFBP00751 764 aa21.86■■□□□ 1.09
RTKN-201ENST00000233330 ZNF76P36508 570 aa21.86■■□□□ 1.09
RTKN-201ENST00000233330 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
RTKN-201ENST00000233330 PPP2R3AQ06190 1150 aa21.86■■□□□ 1.09
RTKN-201ENST00000233330 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
RTKN-201ENST00000233330 CCDC174Q6PII3 467 aa21.86■■□□□ 1.09
RTKN-201ENST00000233330 MYO1AQ9UBC5 1043 aa21.86■■□□□ 1.09
RTKN-201ENST00000233330 PSMC6P62333 389 aa21.86■■□□□ 1.09
RTKN-201ENST00000233330 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
RTKN-201ENST00000233330 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
RTKN-201ENST00000233330 TBC1D5Q92609 795 aa21.86■■□□□ 1.09
RTKN-201ENST00000233330 SH2D4AQ9H788 454 aa21.86■■□□□ 1.09
RTKN-201ENST00000233330 WNT10BO00744 389 aa21.85■■□□□ 1.09
RTKN-201ENST00000233330 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
RTKN-201ENST00000233330 MAP3K10Q02779 954 aa21.85■■□□□ 1.09
RTKN-201ENST00000233330 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa21.85■■□□□ 1.09
RTKN-201ENST00000233330 NBPF9Q3BBW0 867 aa21.85■■□□□ 1.09
RTKN-201ENST00000233330 SLC35F6Q8N357 371 aa21.85■■□□□ 1.09
RTKN-201ENST00000233330 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
RTKN-201ENST00000233330 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
RTKN-201ENST00000233330 DNM3Q9UQ16 869 aa21.85■■□□□ 1.09
RTKN-201ENST00000233330 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa21.85■■□□□ 1.09
RTKN-201ENST00000233330 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
RTKN-201ENST00000233330 MEIS1O00470 390 aa21.84■■□□□ 1.09
RTKN-201ENST00000233330 KRT18P05783 430 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
RTKN-201ENST00000233330 FAM160B2Q86V87 743 aa21.84■■□□□ 1.09
RTKN-201ENST00000233330 SCFD1Q8WVM8 642 aa21.84■■□□□ 1.09
RTKN-201ENST00000233330 FEZ1Q99689 392 aa21.84■■□□□ 1.09
RTKN-201ENST00000233330 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
RTKN-201ENST00000233330 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa21.84■■□□□ 1.09
RTKN-201ENST00000233330 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
RTKN-201ENST00000233330 TRAF5O00463 557 aa21.84■■□□□ 1.09
RTKN-201ENST00000233330 POLR2MP0CAP2 368 aa21.84■■□□□ 1.09
RTKN-201ENST00000233330 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP21.84■■□□□ 1.09
RTKN-201ENST00000233330 HERVK_113P62684 666 aa21.83■■□□□ 1.09
RTKN-201ENST00000233330 CDK17Q00537 523 aa21.83■■□□□ 1.09
RTKN-201ENST00000233330 GIT2Q14161 759 aa21.83■■□□□ 1.09
RTKN-201ENST00000233330 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
RTKN-201ENST00000233330 CEP63Q96MT8 703 aa21.83■■□□□ 1.09
RTKN-201ENST00000233330 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
RTKN-201ENST00000233330 WDR18Q9BV38 432 aa21.83■■□□□ 1.09
RTKN-201ENST00000233330 KCTD10Q9H3F6 313 aa21.83■■□□□ 1.09
RTKN-201ENST00000233330 EMILIN3Q9NT22 766 aa21.83■■□□□ 1.09
RTKN-201ENST00000233330 PIM2Q9P1W9 311 aa21.83■■□□□ 1.09
RTKN-201ENST00000233330 CTAGE9A4FU28 777 aa21.83■■□□□ 1.08
RTKN-201ENST00000233330 KIF20AO95235 890 aa21.83■■□□□ 1.08
RTKN-201ENST00000233330 ASNSP08243 561 aa21.83■■□□□ 1.08
RTKN-201ENST00000233330 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
RTKN-201ENST00000233330 NELFCDQ8IXH7 590 aa21.83■■□□□ 1.08
RTKN-201ENST00000233330 CCDC170Q8IYT3 715 aa21.83■■□□□ 1.08
RTKN-201ENST00000233330 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
RTKN-201ENST00000233330 MYOZ2Q9NPC6 264 aa21.83■■□□□ 1.08
RTKN-201ENST00000233330 FEM1BQ9UK73 627 aa21.83■■□□□ 1.08
RTKN-201ENST00000233330 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
RTKN-201ENST00000233330 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
RTKN-201ENST00000233330 EML1O00423 815 aa21.82■■□□□ 1.08
RTKN-201ENST00000233330 EPHB6O15197 1021 aa21.82■■□□□ 1.08
RTKN-201ENST00000233330 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
RTKN-201ENST00000233330 CYP4A11Q02928 519 aa21.82■■□□□ 1.08
RTKN-201ENST00000233330 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
RTKN-201ENST00000233330 HAUS4Q9H6D7 363 aa21.82■■□□□ 1.08
RTKN-201ENST00000233330 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
RTKN-201ENST00000233330 FBXO28Q9NVF7 368 aa21.82■■□□□ 1.08
RTKN-201ENST00000233330 ERCC3P19447 782 aa21.82■■□□□ 1.08
RTKN-201ENST00000233330 KRT83P78385 493 aa21.82■■□□□ 1.08
RTKN-201ENST00000233330 CIAPIN1Q6FI81 312 aa21.82■■□□□ 1.08
RTKN-201ENST00000233330 ZNF662Q6ZS27 426 aa21.82■■□□□ 1.08
RTKN-201ENST00000233330 REEP2Q9BRK0 252 aa21.82■■□□□ 1.08
RTKN-201ENST00000233330 ZHX3Q9H4I2 956 aa21.82■■□□□ 1.08
RTKN-201ENST00000233330 CDC23Q9UJX2 597 aa21.82■■□□□ 1.08
RTKN-201ENST00000233330 PLAGL2Q9UPG8 496 aa21.82■■□□□ 1.08
RTKN-201ENST00000233330 SHTN1A0MZ66 631 aa21.81■■□□□ 1.08
RTKN-201ENST00000233330 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
RTKN-201ENST00000233330 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
RTKN-201ENST00000233330 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
RTKN-201ENST00000233330 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
RTKN-201ENST00000233330 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
RTKN-201ENST00000233330 TRIM10Q9UDY6 481 aa21.81■■□□□ 1.08
RTKN-201ENST00000233330 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
RTKN-201ENST00000233330 GNA14O95837 355 aa21.8■■□□□ 1.08
RTKN-201ENST00000233330 MARSP56192 900 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
RTKN-201ENST00000233330 TGFB2P61812 414 aa21.8■■□□□ 1.08
RTKN-201ENST00000233330 TUBB2AQ13885 445 aa21.8■■□□□ 1.08
RTKN-201ENST00000233330 CCDC40Q4G0X9 1142 aa21.8■■□□□ 1.08
RTKN-201ENST00000233330 OTOP1Q7RTM1 612 aa21.8■■□□□ 1.08
RTKN-201ENST00000233330 KCTD17Q8N5Z5 321 aa21.8■■□□□ 1.08
RTKN-201ENST00000233330 TUBB2BQ9BVA1 445 aa21.8■■□□□ 1.08
RTKN-201ENST00000233330 MMRN2Q9H8L6 949 aa21.8■■□□□ 1.08
RTKN-201ENST00000233330 SPDYE4A6NLX3 237 aa21.8■■□□□ 1.08
RTKN-201ENST00000233330 PSMD10O75832 226 aa21.8■■□□□ 1.08
RTKN-201ENST00000233330 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa21.8■■□□□ 1.08
RTKN-201ENST00000233330 LDHDQ86WU2 507 aa21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms