RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222753.5

HOXA13-201, Transcript of homeobox A13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA13, Length 5,030 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13-201ENST00000222753 LMNAP02545 664 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 ZNF710Q8N1W2 664 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 CCDC127Q96BQ5 260 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 MXD3Q9BW11 206 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 EDEM3Q9BZQ6 932 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 ST7Q9NRC1 585 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 H0YIN7 160 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 FGGP02679 453 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 TMED2Q15363 201 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 SGMS1Q86VZ5 419 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 L2HGDHQ9H9P8 463 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 ZBED4O75132 1171 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 FAM102BQ5T8I3 360 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 RASGRP2Q7LDG7 609 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 DEPTORQ8TB45 409 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 CLTCL1P53675 1640 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 MADDQ8WXG6 1647 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 HEG1Q9ULI3 1381 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 USPL1Q5W0Q7 1092 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 CYP4F22Q6NT55 531 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 CLEC11AQ9Y240 323 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 LIG4P49917 911 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 BRIP1Q9BX63 1249 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 ITIH6Q6UXX5 1313 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 DCTN3O75935 186 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 COG7P83436 770 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 HVCN1Q96D96 273 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 FAM170AA1A519 330 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 RNF8O76064 485 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 ATP2B4P23634 1241 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 SERPINB6P35237 376 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 DBN1Q16643 649 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 CAPN11Q9UMQ6 739 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 MCAMP43121 646 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 LY9Q9HBG7 655 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 CFAP73A6NFT4 308 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 LRRC53A6NM62 1247 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 PLA2G4BP0C869 781 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 SLC12A2P55011 1212 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP20.1■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 KRT81Q14533 505 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 SLFN13Q68D06 897 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 CYB5R4Q7L1T6 521 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 NLRP10Q86W26 655 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 CDKL2Q92772 493 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 TMOD4Q9NZQ9 345 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 TRIM49BA6NDI0 452 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 MAP3K7O43318 606 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 XKR9Q5GH70 373 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 ZNF804BA4D1E1 1349 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 UBN2Q6ZU65 1347 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 PLEKHA8P1O95397 391 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 RASGRF1Q13972 1273 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 NSMFQ6X4W1 530 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 SPATA4Q8NEY3 305 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 GSDMBQ8TAX9 411 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 MSH2P43246 934 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 SAAL1Q96ER3 474 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 TMEM206Q9H813 350 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 MLXIPQ9HAP2 919 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 MTF1Q14872 753 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 CPXCR1Q8N123 301 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 HDAC6Q9UBN7 1215 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 KRT19P08727 400 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 CASP1P29466 404 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 DLATP10515 647 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 KAZNQ674X7 775 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 PIGSQ96S52 555 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 KIF28PB7ZC32 967 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 PPP1R37O75864 691 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 TCP10Q12799 353 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 LARGE2Q8N3Y3 721 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 WDR11Q9BZH6 1224 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
HOXA13-201ENST00000222753 RWDD2BP57060 319 aa20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms