RNA–Protein interactions for RNA: YMR088C

VBA1, Transcript of Permease of basic amino acids in the vacuolar membrane, yeast

Gene VBA1, Length 1,689 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VBA1	YMR088C	NBP35	P52920	328 aa		5.36	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	YGL159W	P53110	370 aa		5.36	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	TYW3	P53177	273 aa		5.36	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	GET1	P53192	235 aa		5.36	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	YGR017W	P53210	297 aa		5.36	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	MTQ1	P53944	314 aa		5.36	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.36	□□□□□ -1.55	not detected
VBA1	YMR088C	OST6	Q03723	332 aa		5.36	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	YLR297W	Q05899	129 aa		5.36	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	BUR2	Q05949	395 aa		5.36	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	NEJ1	Q06148	342 aa		5.36	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	TCO89	Q08921	799 aa		5.36	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	PSK1	P31374	1356 aa		5.36	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	STU1	P38198	1513 aa		5.35	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	HTB2	P02294	131 aa		5.35	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	URA3	P03962	267 aa		5.35	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	QCR2	P07257	368 aa		5.35	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	TOP3	P13099	656 aa		5.35	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	VPS33	P20795	691 aa		5.35	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	GSY1	P23337	708 aa		5.35	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	PPH22	P23595	377 aa		5.35	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	ADK2	P26364	225 aa		5.35	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	ADE1	P27616	306 aa		5.35	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	KKQ8	P36004	724 aa		5.35	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	FMP23	P38231	175 aa		5.35	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	YBR062C	P38239	180 aa		5.35	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	TRM5	P38793	499 aa		5.35	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	GIP2	P40036	548 aa		5.35	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	YAR1	P46683	200 aa		5.35	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	TAF6	P53040	516 aa		5.35	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	PPT1	P53043	513 aa		5.35	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	SAE3	P89114	91 aa		5.35	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	YPL080C	Q02826	108 aa		5.35	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	MRPL1	Q04599	285 aa		5.35	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	AIM32	Q04689	311 aa		5.35	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	ROY1	Q04847	553 aa		5.35	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	DAL4	Q04895	635 aa		5.35	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	MFB1	Q04922	465 aa		5.35	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.35	□□□□□ -1.55	not detected
VBA1	YMR088C	ATG31	Q12421	196 aa		5.35	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	RGS2	Q99188	309 aa		5.35	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	TY1B-H	O13535	1793 aa		5.35	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	TY1B-DR5	P0C2I2	1755 aa		5.35	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	TY1B-DR6	P0C2I3	1755 aa		5.35	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	TY1B-LR2	P0C2I5	1755 aa		5.35	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	TY1B-LR3	P0C2I6	1755 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	TY1B-PR1	P0C2I9	1755 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	TY1B-PR2	P0C2J0	1756 aa		5.35	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	TY1B-PR3	P0C2J1	1755 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	TY1B-JR1	P47098	1755 aa		5.35	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	TY1B-ML2	Q03434	1755 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	TY1B-ER1	Q03612	1755 aa		5.35	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	TY1B-ML1	Q04711	1755 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	TY1B-GR2	Q12269	1755 aa		5.35	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	TY1B-OL	Q12273	1755 aa		5.35	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	TY1B-PL	Q12414	1755 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	CBS2	P14905	389 aa		5.34	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	FPS1	P23900	669 aa		5.34	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	YIM1	P28625	365 aa		5.34	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	CLG1	P35190	452 aa		5.34	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	OAR1	P35731	278 aa		5.34	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	DUG2	P38149	878 aa		5.34	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	SHG1	P38337	142 aa		5.34	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	MGS1	P40151	587 aa		5.34	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	CFD1	P40558	293 aa		5.34	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	YIR007W	P40566	764 aa		5.34	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	CIN1	P40987	1014 aa		5.34	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	YGR201C	P42936	225 aa		5.34	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	SGF73	P53165	657 aa		5.34	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	TIM44	Q01852	431 aa		5.34	□□□□□ -1.55

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 19.5 ms