RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	GJB5	O95377	273 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	NT5C2	P49902	561 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	NUCB1	Q02818	461 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	SEC23A	Q15436	765 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	13.91	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	MTMR8	Q96EF0	704 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	COG5	Q9UP83	839 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	LINC01553	A4QN01	128 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	SP2	Q02086	613 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	PTK7	Q13308	1070 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	LAMC2	Q13753	1193 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	13.9	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	HLA-C	Q95604	372 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	AMN	Q9BXJ7	453 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	KLRF2	D3W0D1	207 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	GGPS1	O95749	300 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	PGM5	Q15124	567 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	13.89	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	KRT23	Q9C075	422 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	SENP2	Q9HC62	589 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	ZBTB5	O15062	677 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	ERVK-21	P61565	698 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	SERINC5	Q86VE9	423 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	HOMER1	Q86YM7	354 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	SPATA33	Q96N06	139 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	RAD9A	Q99638	391 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	COL4A6	Q14031	1691 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	HIP1	O00291	1037 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	CYTH3	O43739	400 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	PPFIA4	O75335	1185 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	LGR5	O75473	907 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	HOXC8	P31273	242 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	PLA2G5	P39877	138 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	IKBKE	Q14164	716 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	PIGS	Q96S52	555 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	CD320	Q9NPF0	282 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	EFCAB14	O75071	495 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	THPO	P40225	353 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	GRM4	Q14833	912 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	LGALS2	P05162	132 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	CTSH	P09668	335 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	RSPH10B	P0C881	870 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	CCND2	P30279	289 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	SEMA3F	Q13275	785 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	AAMP	Q13685	434 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TTLL3-233	ENST00000602338	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		13.85	□□□□□ -0.19

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.9 ms