RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528920.5

TSTA3-208, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 5

Gene TSTA3, Length 964 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-208ENST00000528920 A0A1W2PPC1 479 aa16.72■□□□□ 0.27
TSTA3-208ENST00000528920 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa16.72■□□□□ 0.27
TSTA3-208ENST00000528920 FIBPO43427 364 aa16.72■□□□□ 0.27
TSTA3-208ENST00000528920 JAK2O60674 1132 aa16.72■□□□□ 0.27
TSTA3-208ENST00000528920 ASGR1P07306 291 aa16.72■□□□□ 0.27
TSTA3-208ENST00000528920 SREBF1P36956 1147 aa16.72■□□□□ 0.27
TSTA3-208ENST00000528920 ARHGAP1Q07960 439 aa16.72■□□□□ 0.27
TSTA3-208ENST00000528920 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
TSTA3-208ENST00000528920 PCDHA4Q9UN74 947 aa16.72■□□□□ 0.27
TSTA3-208ENST00000528920 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa16.72■□□□□ 0.27
TSTA3-208ENST00000528920 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
TSTA3-208ENST00000528920 A0A1W2PQY0 241 aa16.71■□□□□ 0.27
TSTA3-208ENST00000528920 A6NJR5 290 aa16.71■□□□□ 0.27
TSTA3-208ENST00000528920 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
TSTA3-208ENST00000528920 ZEB2O60315 1214 aa16.71■□□□□ 0.27
TSTA3-208ENST00000528920 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
TSTA3-208ENST00000528920 XBP1P17861 261 aa16.71■□□□□ 0.27
TSTA3-208ENST00000528920 ITGB5P18084 799 aa16.71■□□□□ 0.27
TSTA3-208ENST00000528920 CPT1AP50416 773 aa16.71■□□□□ 0.27
TSTA3-208ENST00000528920 SEMA3FQ13275 785 aa16.71■□□□□ 0.27
TSTA3-208ENST00000528920 NPY5RQ15761 445 aa16.71■□□□□ 0.27
TSTA3-208ENST00000528920 LRRC26Q2I0M4 334 aa16.71■□□□□ 0.27
TSTA3-208ENST00000528920 GALNT17Q6IS24 598 aa16.71■□□□□ 0.27
TSTA3-208ENST00000528920 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa16.71■□□□□ 0.27
TSTA3-208ENST00000528920 NLRX1Q86UT6 975 aa16.71■□□□□ 0.27
TSTA3-208ENST00000528920 DAGLBQ8NCG7 672 aa16.71■□□□□ 0.27
TSTA3-208ENST00000528920 RASGRP4Q8TDF6 673 aa16.71■□□□□ 0.27
TSTA3-208ENST00000528920 CRYGNQ8WXF5 182 aa16.71■□□□□ 0.27
TSTA3-208ENST00000528920 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
TSTA3-208ENST00000528920 GPRASP2Q96D09 838 aa16.71■□□□□ 0.27
TSTA3-208ENST00000528920 ALG1Q9BT22 464 aa16.71■□□□□ 0.27
TSTA3-208ENST00000528920 PHF20Q9BVI0 1012 aa16.71■□□□□ 0.27
TSTA3-208ENST00000528920 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
TSTA3-208ENST00000528920 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 MCM2P49736 904 aa16.7■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 ARHGAP4P98171 946 aa16.7■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 SP2Q02086 613 aa16.7■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 LAMC2Q13753 1193 aa16.7■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 SNX17Q15036 470 aa16.7■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 CXCL17Q6UXB2 119 aa16.7■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 BLIDQ8IZY5 108 aa16.7■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 LRCH3Q96II8 777 aa16.7■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 CDHR1Q96JP9 859 aa16.7■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 GLT1D1Q96MS3 346 aa16.7■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 JADE2Q9NQC1 790 aa16.7■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 STARD7Q9NQZ5 370 aa16.7■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 GJB4Q9NTQ9 266 aa16.7■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 KCNJ14Q9UNX9 436 aa16.7■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 ELP1O95163 1332 aa16.7■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 M0R2N6 131 aa16.69■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 CABYRO75952 493 aa16.69■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 GGPS1O95749 300 aa16.69■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 CYP3A4P08684 503 aa16.69■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 C1orf53Q5VUE5 145 aa16.69■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 MYSM1Q5VVJ2 828 aa16.69■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 AFG1LQ8WV93 481 aa16.69■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 MXRA8Q9BRK3 442 aa16.69■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 POLR3EQ9NVU0 708 aa16.69■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa16.69■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 MAFGO15525 162 aa16.68■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 KPNA6O60684 536 aa16.68■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 MMP3P08254 477 aa16.68■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 SYN1P17600 705 aa16.68■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 PURAQ00577 322 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 MTMR1Q13613 665 aa16.68■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 NEDD9Q14511 834 aa16.68■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 CEP55Q53EZ4 464 aa16.68■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 TMX3Q96JJ7 454 aa16.68■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 SENP7Q9BQF6 1050 aa16.68■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 MEIS1O00470 390 aa16.67■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 MYL3P08590 195 aa16.67■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 ZNF76P36508 570 aa16.67■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 RTP1P59025 263 aa16.67■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 NIPA1Q7RTP0 329 aa16.67■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 PPTC7Q8NI37 304 aa16.67■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 CYP2W1Q8TAV3 490 aa16.67■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 VTI1AQ96AJ9 217 aa16.67■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 GDF15Q99988 308 aa16.67■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 BCAS3Q9H6U6 928 aa16.67■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 MLXIPQ9HAP2 919 aa16.67■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 SORBS3O60504 671 aa16.66■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 ATP9AO75110 1047 aa16.66■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 KCNA2P16389 499 aa16.66■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 BMP8BP34820 402 aa16.66■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 HSDL1Q3SXM5 330 aa16.66■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 TRIM60Q495X7 471 aa16.66■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 METTL7BQ6UX53 244 aa16.66■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 KRT25Q7Z3Z0 450 aa16.66■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 SLC17A8Q8NDX2 589 aa16.66■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 SPATA33Q96N06 139 aa16.66■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
TSTA3-208ENST00000528920 KCNH7Q9NS40 1196 aa16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.9 ms