RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 NFKBIEO00221 500 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 TBX3O15119 743 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 CCDC42Q96M95 316 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 AGBL1Q96MI9 1066 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 NUP58Q9BVL2 599 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 BHMT2Q9H2M3 363 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 LAMB4A4D0S4 1761 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 PSMD2Q13200 908 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 MTERF2Q49AM1 385 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 VWA3BQ502W6 1294 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 MTMR14Q8NCE2 650 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 DAGLBQ8NCG7 672 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 EHBP1Q8NDI1 1231 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 TRPM4Q8TD43 1214 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 NBPF3Q9H094 633 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 RIOX1Q9H6W3 641 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 LTBP3Q9NS15 1303 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 ERLIN2O94905 339 aa9.15□□□□□ -0.95
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PTPRD-211ENST00000486161 SKILP12757 684 aa9.15□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 PDIA5Q14554 519 aa9.15□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.95
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PTPRD-211ENST00000486161 ZDHHC9Q9Y397 364 aa9.15□□□□□ -0.95
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PTPRD-211ENST00000486161 CCDC102AQ96A19 550 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 SYNCQ9H7C4 482 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 CEP83Q9Y592 693 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 AK9Q5TCS8 1911 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 MAFGO15525 162 aa9.14□□□□□ -0.95
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PTPRD-211ENST00000486161 QARSP47897 775 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
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PTPRD-211ENST00000486161 SPATA1Q5VX52 437 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 ARMCX5Q6P1M9 558 aa9.14□□□□□ -0.95
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PTPRD-211ENST00000486161 MKL1Q969V6 931 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 AKT3Q9Y243 479 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF541Q9H0D2 1346 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa9.14□□□□□ -0.95
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PTPRD-211ENST00000486161 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
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PTPRD-211ENST00000486161 PAGE5Q96GU1 130 aa9.14□□□□□ -0.95
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PTPRD-211ENST00000486161 CYP2J2P51589 502 aa9.14□□□□□ -0.95
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PTPRD-211ENST00000486161 MROH8Q9H579 483 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 TAB2Q9NYJ8 693 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 PTPRAP18433 802 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 PSMC5P62195 406 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 MSANTD4Q8NCY6 345 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 KIF18AQ8NI77 898 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 TNNI1P19237 187 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 RPS6P62753 249 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 FKBP1BP68106 108 aa9.13□□□□□ -0.95
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PTPRD-211ENST00000486161 PAF1Q8N7H5 531 aa9.13□□□□□ -0.95
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PTPRD-211ENST00000486161 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
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PTPRD-211ENST00000486161 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa9.13□□□□□ -0.95
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PTPRD-211ENST00000486161 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 SLC9A2Q9UBY0 812 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 KCNJ18B7U540 433 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 FZD9O00144 591 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
PTPRD-211ENST00000486161 TXNP10599 105 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
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