RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478954.1

STRADBP1-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene STRADBP1, Length 1,281 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADBP1-201ENST00000478954 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 PXDNQ92626 1479 aa7.36□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 CCNB3Q8WWL7 1395 aa7.35□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 GPR39O43194 453 aa7.35□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 AKAP10O43572 662 aa7.35□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 KPNA6O60684 536 aa7.35□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 FOSL1P15407 271 aa7.35□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 CD247P20963 164 aa7.35□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 CD97P48960 835 aa7.35□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 NEK4P51957 841 aa7.35□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 NTRK3Q16288 839 aa7.35□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 MSMPQ1L6U9 139 aa7.35□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 ANKRD39Q53RE8 183 aa7.35□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 DUSP27Q5VZP5 1158 aa7.35□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 NECAB2Q7Z6G3 386 aa7.35□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 C14orf80Q86SX3 495 aa7.35□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 AHI1Q8N157 1196 aa7.35□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 ADCY4Q8NFM4 1077 aa7.35□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 GIMAP7Q8NHV1 300 aa7.35□□□□□ -1.23
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STRADBP1-201ENST00000478954 BTN2A2Q8WVV5 523 aa7.35□□□□□ -1.23
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STRADBP1-201ENST00000478954 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 ZIM2Q9NZV7 527 aa7.35□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 EMC9Q9Y3B6 208 aa7.35□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 RIMS2Q9UQ26 1411 aa7.35□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 CYP26A1O43174 497 aa7.34□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 CPEP16870 476 aa7.34□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 CYP27A1Q02318 531 aa7.34□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 DHCR24Q15392 516 aa7.34□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP7.34□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 CYP27C1Q4G0S4 372 aa7.34□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 LETMD1Q6P1Q0 360 aa7.34□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 TRIM59Q8IWR1 403 aa7.34□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 MFSD2AQ8NA29 543 aa7.34□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 BRF1Q92994 677 aa7.34□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 MTMR8Q96EF0 704 aa7.34□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 GBP3Q9H0R5 595 aa7.34□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 AKT3Q9Y243 479 aa7.34□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa7.34□□□□□ -1.23
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STRADBP1-201ENST00000478954 MAP3K5Q99683 1374 aa7.33□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 ABCA3Q99758 1704 aa7.33□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 SCO2A0A1W2PP80 73 aa7.33□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 OPA1O60313 960 aa7.33□□□□□ -1.24
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STRADBP1-201ENST00000478954 ASLP04424 464 aa7.33□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 GABREP78334 506 aa7.33□□□□□ -1.24
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STRADBP1-201ENST00000478954 CDH24Q86UP0 819 aa7.33□□□□□ -1.24
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STRADBP1-201ENST00000478954 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa7.33□□□□□ -1.24
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STRADBP1-201ENST00000478954 WHRNQ9P202 907 aa7.33□□□□□ -1.24
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STRADBP1-201ENST00000478954 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa7.33□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 ADGRL2O95490 1459 aa7.32□□□□□ -1.24
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STRADBP1-201ENST00000478954 ADAMTS4O75173 837 aa7.32□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 PPM1BO75688 479 aa7.32□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 JMJD7P0C870 316 aa7.32□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 SPINK2P20155 84 aa7.32□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 ID4P47928 161 aa7.32□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 OXCT1P55809 520 aa7.32□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 LRP8Q14114 963 aa7.32□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 UBE4AQ14139 1066 aa7.32□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 CHPFQ8IZ52 775 aa7.32□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 MYO1HQ8N1T3 1032 aa7.32□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 COG1Q8WTW3 980 aa7.32□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC39A13Q96H72 371 aa7.32□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 RPS6KC1Q96S38 1066 aa7.32□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 YIPF4Q9BSR8 244 aa7.32□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa7.32□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa7.31□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa7.31□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 NEMP1O14524 444 aa7.31□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 EFCAB14O75071 495 aa7.31□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 KCNH1O95259 989 aa7.31□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 IGFALSP35858 605 aa7.31□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 GFRA1P56159 465 aa7.31□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 BIRC2Q13490 618 aa7.31□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 AUHQ13825 339 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
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