RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466861.1

SUMO3-205, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

TSL 2

Gene SUMO3, Length 753 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-205ENST00000466861 ST3GAL1Q11201 340 aa26.62■■□□□ 1.85
SUMO3-205ENST00000466861 NEDD9Q14511 834 aa26.62■■□□□ 1.85
SUMO3-205ENST00000466861 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
SUMO3-205ENST00000466861 CRYGNQ8WXF5 182 aa26.62■■□□□ 1.85
SUMO3-205ENST00000466861 JADE2Q9NQC1 790 aa26.62■■□□□ 1.85
SUMO3-205ENST00000466861 NR2E3Q9Y5X4 410 aa26.62■■□□□ 1.85
SUMO3-205ENST00000466861 FDPSP14324 419 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
SUMO3-205ENST00000466861 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
SUMO3-205ENST00000466861 BEX3Q00994 111 aa26.61■■□□□ 1.85
SUMO3-205ENST00000466861 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
SUMO3-205ENST00000466861 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa26.61■■□□□ 1.85
SUMO3-205ENST00000466861 NIPA1Q7RTP0 329 aa26.61■■□□□ 1.85
SUMO3-205ENST00000466861 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
SUMO3-205ENST00000466861 BLIDQ8IZY5 108 aa26.61■■□□□ 1.85
SUMO3-205ENST00000466861 DPF3Q92784 378 aa26.61■■□□□ 1.85
SUMO3-205ENST00000466861 COPS5Q92905 334 aa26.61■■□□□ 1.85
SUMO3-205ENST00000466861 PHF20Q9BVI0 1012 aa26.61■■□□□ 1.85
SUMO3-205ENST00000466861 STARD7Q9NQZ5 370 aa26.61■■□□□ 1.85
SUMO3-205ENST00000466861 TMEM260Q9NX78 707 aa26.61■■□□□ 1.85
SUMO3-205ENST00000466861 EVI5O60447 810 aa26.6■■□□□ 1.85
SUMO3-205ENST00000466861 ARHGAP4P98171 946 aa26.6■■□□□ 1.85
SUMO3-205ENST00000466861 CCDC83Q8IWF9 413 aa26.6■■□□□ 1.85
SUMO3-205ENST00000466861 PPTC7Q8NI37 304 aa26.6■■□□□ 1.85
SUMO3-205ENST00000466861 AIFM3Q96NN9 605 aa26.6■■□□□ 1.85
SUMO3-205ENST00000466861 MXRA8Q9BRK3 442 aa26.6■■□□□ 1.85
SUMO3-205ENST00000466861 ALG1Q9BT22 464 aa26.6■■□□□ 1.85
SUMO3-205ENST00000466861 RTEL1Q9NZ71 1219 aa26.6■■□□□ 1.85
SUMO3-205ENST00000466861 M0R2N6 131 aa26.59■■□□□ 1.85
SUMO3-205ENST00000466861 ITGB5P18084 799 aa26.59■■□□□ 1.85
SUMO3-205ENST00000466861 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
SUMO3-205ENST00000466861 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
SUMO3-205ENST00000466861 SEMA3FQ13275 785 aa26.59■■□□□ 1.85
SUMO3-205ENST00000466861 NPY5RQ15761 445 aa26.59■■□□□ 1.85
SUMO3-205ENST00000466861 LRRC26Q2I0M4 334 aa26.59■■□□□ 1.85
SUMO3-205ENST00000466861 MYSM1Q5VVJ2 828 aa26.59■■□□□ 1.85
SUMO3-205ENST00000466861 FERMT2Q96AC1 680 aa26.59■■□□□ 1.85
SUMO3-205ENST00000466861 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
SUMO3-205ENST00000466861 MTMR1Q13613 665 aa26.58■■□□□ 1.85
SUMO3-205ENST00000466861 CEP55Q53EZ4 464 aa26.58■■□□□ 1.85
SUMO3-205ENST00000466861 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa26.58■■□□□ 1.85
SUMO3-205ENST00000466861 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
SUMO3-205ENST00000466861 MEIS1O00470 390 aa26.57■■□□□ 1.84
SUMO3-205ENST00000466861 GGPS1O95749 300 aa26.57■■□□□ 1.84
SUMO3-205ENST00000466861 MMP3P08254 477 aa26.57■■□□□ 1.84
SUMO3-205ENST00000466861 PTGS1P23219 599 aa26.57■■□□□ 1.84
SUMO3-205ENST00000466861 CIITAP33076 1130 aa26.57■■□□□ 1.84
SUMO3-205ENST00000466861 USP11P51784 963 aa26.57■■□□□ 1.84
SUMO3-205ENST00000466861 PURAQ00577 322 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
SUMO3-205ENST00000466861 SP2Q02086 613 aa26.57■■□□□ 1.84
SUMO3-205ENST00000466861 METTL7BQ6UX53 244 aa26.57■■□□□ 1.84
SUMO3-205ENST00000466861 CXCL17Q6UXB2 119 aa26.57■■□□□ 1.84
SUMO3-205ENST00000466861 AFG1LQ8WV93 481 aa26.57■■□□□ 1.84
SUMO3-205ENST00000466861 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
SUMO3-205ENST00000466861 PGBD1Q96JS3 809 aa26.57■■□□□ 1.84
SUMO3-205ENST00000466861 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
SUMO3-205ENST00000466861 MLXIPQ9HAP2 919 aa26.57■■□□□ 1.84
SUMO3-205ENST00000466861 MROH7Q68CQ1 1323 aa26.57■■□□□ 1.84
SUMO3-205ENST00000466861 JAK2O60674 1132 aa26.56■■□□□ 1.84
SUMO3-205ENST00000466861 PPFIA4O75335 1185 aa26.56■■□□□ 1.84
SUMO3-205ENST00000466861 RTP1P59025 263 aa26.56■■□□□ 1.84
SUMO3-205ENST00000466861 DGKDQ16760 1214 aa26.56■■□□□ 1.84
SUMO3-205ENST00000466861 KRT25Q7Z3Z0 450 aa26.56■■□□□ 1.84
SUMO3-205ENST00000466861 TMX3Q96JJ7 454 aa26.56■■□□□ 1.84
SUMO3-205ENST00000466861 TOX2Q96NM4 488 aa26.56■■□□□ 1.84
SUMO3-205ENST00000466861 ADAMTS3O15072 1205 aa26.55■■□□□ 1.84
SUMO3-205ENST00000466861 ZNF76P36508 570 aa26.55■■□□□ 1.84
SUMO3-205ENST00000466861 CDK7P50613 346 aa26.55■■□□□ 1.84
SUMO3-205ENST00000466861 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
SUMO3-205ENST00000466861 TRIM29Q14134 588 aa26.55■■□□□ 1.84
SUMO3-205ENST00000466861 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa26.55■■□□□ 1.84
SUMO3-205ENST00000466861 SLC43A3Q8NBI5 491 aa26.55■■□□□ 1.84
SUMO3-205ENST00000466861 RASGRP4Q8TDF6 673 aa26.55■■□□□ 1.84
SUMO3-205ENST00000466861 SPATA33Q96N06 139 aa26.55■■□□□ 1.84
SUMO3-205ENST00000466861 BRMS1Q9HCU9 246 aa26.55■■□□□ 1.84
SUMO3-205ENST00000466861 ARVCFO00192 962 aa26.54■■□□□ 1.84
SUMO3-205ENST00000466861 KCNA2P16389 499 aa26.54■■□□□ 1.84
SUMO3-205ENST00000466861 SETQ01105 290 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
SUMO3-205ENST00000466861 VTI1AQ96AJ9 217 aa26.54■■□□□ 1.84
SUMO3-205ENST00000466861 KCNH7Q9NS40 1196 aa26.54■■□□□ 1.84
SUMO3-205ENST00000466861 KCNJ14Q9UNX9 436 aa26.54■■□□□ 1.84
SUMO3-205ENST00000466861 NFASCO94856 1347 aa26.54■■□□□ 1.84
SUMO3-205ENST00000466861 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
SUMO3-205ENST00000466861 MYL3P08590 195 aa26.53■■□□□ 1.84
SUMO3-205ENST00000466861 MOXD1Q6UVY6 613 aa26.53■■□□□ 1.84
SUMO3-205ENST00000466861 KIF3AQ9Y496 699 aa26.53■■□□□ 1.84
SUMO3-205ENST00000466861 ITGA7Q13683 1181 aa26.52■■□□□ 1.84
SUMO3-205ENST00000466861 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP26.52■■□□□ 1.844e-8■■■■■ 28
SUMO3-205ENST00000466861 HSDL1Q3SXM5 330 aa26.52■■□□□ 1.84
SUMO3-205ENST00000466861 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
SUMO3-205ENST00000466861 KATNAL1Q9BW62 490 aa26.52■■□□□ 1.84
SUMO3-205ENST00000466861 DOCK5Q9H7D0 1870 aa26.51■■□□□ 1.83
SUMO3-205ENST00000466861 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa26.51■■□□□ 1.83
SUMO3-205ENST00000466861 FAM86B1E9PN63 330 aa26.51■■□□□ 1.83
SUMO3-205ENST00000466861 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
SUMO3-205ENST00000466861 MMP1P03956 469 aa26.51■■□□□ 1.83
SUMO3-205ENST00000466861 FAM86B2P0C5J1 330 aa26.51■■□□□ 1.83
SUMO3-205ENST00000466861 KRT2P35908 639 aa26.51■■□□□ 1.83
SUMO3-205ENST00000466861 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
SUMO3-205ENST00000466861 TRIM60Q495X7 471 aa26.51■■□□□ 1.83
SUMO3-205ENST00000466861 CYFIP1Q7L576 1253 aa26.51■■□□□ 1.83
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