RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 HDAC8Q9BY41 377 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 C4AP0C0L4 1744 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa8.65□□□□□ -1.02
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PTPRK-211ENST00000429595 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
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PTPRK-211ENST00000429595 SLC22A31A6NKX4 558 aa8.62□□□□□ -1.03
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PTPRK-211ENST00000429595 EPHX2P34913 555 aa8.62□□□□□ -1.03
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PTPRK-211ENST00000429595 TMC3Q7Z5M5 1100 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRK-211ENST00000429595 C2CD5Q86YS7 1000 aa8.62□□□□□ -1.03
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PTPRK-211ENST00000429595 CTSWP56202 376 aa8.61□□□□□ -1.03
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PTPRK-211ENST00000429595 ADGRF1Q5T601 910 aa8.6□□□□□ -1.03
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PTPRK-211ENST00000429595 KCNQ5Q9NR82 932 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-211ENST00000429595 KCTD3Q9Y597 815 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-211ENST00000429595 ADAMTS20P59510 1910 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-211ENST00000429595 OR14I1A6ND48 311 aa8.59□□□□□ -1.03
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PTPRK-211ENST00000429595 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-211ENST00000429595 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
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PTPRK-211ENST00000429595 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-211ENST00000429595 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-211ENST00000429595 CD163L1Q9NR16 1453 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-211ENST00000429595 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-211ENST00000429595 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-211ENST00000429595 CYP27B1O15528 508 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-211ENST00000429595 NRDCO43847 1150 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-211ENST00000429595 BMP7P18075 431 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-211ENST00000429595 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-211ENST00000429595 AEBP1Q8IUX7 1158 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-211ENST00000429595 KCNC2Q96PR1 638 aa8.58□□□□□ -1.04
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