RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 ATP8B3O60423 1300 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 AFF2P51816 1311 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 MED7O43513 233 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 AP3M2P53677 418 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 LAMC2Q13753 1193 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 PRPSAP1Q14558 356 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 PRR23CQ6ZRP0 262 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 PRUNE1Q86TP1 453 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 NEK9Q8TD19 979 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 TSC22D3Q99576 134 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 ZHX3Q9H4I2 956 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 BAG5Q9UL15 447 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 CCDC93Q567U6 631 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 PALB2Q86YC2 1186 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 MFN1Q8IWA4 741 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 DNAJC10Q8IXB1 793 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF280CQ8ND82 737 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 GIPC2Q8TF65 315 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM206Q9H813 350 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 KCND2Q9NZV8 630 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 TNS3Q68CZ2 1445 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 CHL1O00533 1208 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 PSMD3O43242 534 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 KLHL41O60662 606 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 BBOX1O75936 387 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 KRT4P19013 534 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 PEX19P40855 299 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 OCA2Q04671 838 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 STK3Q13188 491 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 KLHL38Q2WGJ6 581 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 DNAL1Q4LDG9 190 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 PRR16Q569H4 304 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 LPIN2Q92539 896 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 BHMT2Q9H2M3 363 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 BCS1LQ9Y276 419 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 GJA3Q9Y6H8 435 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 E7EVH7 732 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 PYGMP11217 842 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 NSFP46459 744 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 GUCY1B3Q02153 619 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 TSGA10IPQ3SY00 556 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 KRT71Q3SY84 523 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 FAM89AQ96GI7 184 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
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PTPRD-201ENST00000355233 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 ENOPH1Q9UHY7 261 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 GUCA1BQ9UMX6 200 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 PAX3P23760 479 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 CCND1P24385 295 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 HK2P52789 917 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 ZBED6P86452 979 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 TERF2Q15554 542 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 ANO5Q75V66 913 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 RPS6KC1Q96S38 1066 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 ZEB2O60315 1214 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 SERPING1P05155 500 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
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PTPRD-201ENST00000355233 TTKP33981 857 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 GRIN1Q05586 938 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 AKNAD1Q5T1N1 836 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 TCERG1LQ5VWI1 586 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 KAZNQ674X7 775 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
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PTPRD-201ENST00000355233 ERVV-1B6SEH8 477 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 SPOPO43791 374 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 GRIN3BO60391 1043 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 RPS8P62241 208 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 TUBA4AP68366 448 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 NEK8Q86SG6 692 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 TRIM63Q969Q1 353 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 CSADQ9Y600 493 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 ADGRB2O60241 1585 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 ZBED4O75132 1171 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 VAMP4O75379 141 aa5.32□□□□□ -1.56
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