RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215794.7

USP18-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 18, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP18, Length 2,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18-201ENST00000215794 CLMNQ96JQ2 1002 aa20.26■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 RAB34Q9BZG1 259 aa20.26■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 ZNF112Q9UJU3 913 aa20.26■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 DOCK1Q14185 1865 aa20.26■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 ZSCAN12O43309 604 aa20.26■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 ETF1P62495 437 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 VGLL4Q14135 290 aa20.26■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 RAD9BQ6WBX8 426 aa20.26■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 RAD54LQ92698 747 aa20.26■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 SLC39A2Q9NP94 309 aa20.26■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 STK17AQ9UEE5 414 aa20.26■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 DNAI1Q9UI46 699 aa20.26■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 MARCH6O60337 910 aa20.25■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 UBXN1Q04323 297 aa20.25■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 TMEM119Q4V9L6 283 aa20.25■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 SYDE2Q5VT97 1194 aa20.25■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 ANKRD40Q6AI12 368 aa20.25■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 P2RX5Q93086 422 aa20.25■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 BMP3P12645 472 aa20.24■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 SEMA3FQ13275 785 aa20.24■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 SCYL3Q8IZE3 742 aa20.24■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 ANKRD7Q92527 254 aa20.24■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 HOOK2Q96ED9 719 aa20.24■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 ARID3AQ99856 593 aa20.24■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 AMNQ9BXJ7 453 aa20.24■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 THAP9Q9H5L6 903 aa20.24■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP20.24■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 V9GYY5 206 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 CCNE1P24864 410 aa20.24■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 FBXO11Q86XK2 927 aa20.24■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa20.24■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 PCDHA12Q9UN75 941 aa20.24■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 A0A0U1RQJ8 604 aa20.23■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP20.23■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 PTPRAP18433 802 aa20.23■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 NF2P35240 595 aa20.23■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 ATRIPQ8WXE1 791 aa20.23■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 PICK1Q9NRD5 415 aa20.23■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa20.23■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 PES1O00541 588 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 CNNM4Q6P4Q7 775 aa20.23■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 UNC13DQ70J99 1090 aa20.23■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 CNGA4Q8IV77 575 aa20.23■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 FEZ1Q99689 392 aa20.23■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 GLT8D2Q9H1C3 349 aa20.23■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 ELP3Q9H9T3 547 aa20.23■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa20.23■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP20.23■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 ZHX2Q9Y6X8 837 aa20.23■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 STAT3P40763 770 aa20.22■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 SPP2Q13103 211 aa20.22■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 MTMR2Q13614 643 aa20.22■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 MB21D1Q8N884 522 aa20.22■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 LRRN4CLQ8ND94 238 aa20.22■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 DDX12PQ92771 950 aa20.22■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 SEMA6BQ9H3T3 888 aa20.22■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 KCNMB3Q9NPA1 279 aa20.22■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 ABHD10Q9NUJ1 306 aa20.22■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa20.22■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa20.22■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 LGALS16A8MUM7 142 aa20.21■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 OPLAHO14841 1288 aa20.21■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 MAP3K9P80192 1104 aa20.21■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 ARHGAP4P98171 946 aa20.21■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 GLIS3Q8NEA6 775 aa20.21■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 ZNF507Q8TCN5 953 aa20.21■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 CRYGNQ8WXF5 182 aa20.21■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 L2HGDHQ9H9P8 463 aa20.21■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 PRR12Q9ULL5 1215 aa20.21■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 B4DLN1 442 aa20.21■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 CELF2O95319 508 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 IDEP14735 1019 aa20.21■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 USP11P51784 963 aa20.21■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 ERVK-24P63145 666 aa20.21■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 TMX2Q9Y320 296 aa20.21■□□□□ 0.83
USP18-201ENST00000215794 SMCHD1A6NHR9 2005 aa20.2■□□□□ 0.82
USP18-201ENST00000215794 BICDL2A1A5D9 508 aa20.2■□□□□ 0.82
USP18-201ENST00000215794 IREB2P48200 963 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
USP18-201ENST00000215794 AP3B2Q13367 1082 aa20.2■□□□□ 0.82
USP18-201ENST00000215794 BTNL9Q6UXG8 535 aa20.2■□□□□ 0.82
USP18-201ENST00000215794 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
USP18-201ENST00000215794 WDR24Q96S15 920 aa20.2■□□□□ 0.82
USP18-201ENST00000215794 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
USP18-201ENST00000215794 ADGRG1Q9Y653 693 aa20.2■□□□□ 0.82
USP18-201ENST00000215794 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa20.2■□□□□ 0.82
USP18-201ENST00000215794 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa20.2■□□□□ 0.82
USP18-201ENST00000215794 POTEB3A0JP26 581 aa20.2■□□□□ 0.82
USP18-201ENST00000215794 E9PMD0 336 aa20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms