RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021424.4

Sptlc2-201, Transcript of Serine palmitoyltransferase 2, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sptlc2, Length 6,710 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Nuf2Q99P69 463 aa16.55■□□□□ 0.24
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Cyp2c40P56657 491 aa16.55■□□□□ 0.24
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Fuca2Q99KR8 461 aa16.54■□□□□ 0.24
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Uhmk1P97343 419 aa16.54■□□□□ 0.24
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Miga1Q4QQM5 600 aa16.54■□□□□ 0.24
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Tas2r124Q7M718 309 aa16.54■□□□□ 0.24
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Trim17Q7TPM3 477 aa16.54■□□□□ 0.24
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Dr1Q91WV0 176 aa16.54■□□□□ 0.24
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Gja10Q9WUS4 505 aa16.54■□□□□ 0.24
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Sec24cG3X972 1096 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 HdlbpQ8VDJ3 1268 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Kdm6aO70546 1401 aa16.54■□□□□ 0.24
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Samsn1P57725 372 aa16.54■□□□□ 0.24
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Ulk3Q3U3Q1 472 aa16.54■□□□□ 0.24
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Cbwd1Q8VEH6 393 aa16.54■□□□□ 0.24
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 LrgukQ9D5S7 820 aa16.54■□□□□ 0.24
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 SyncQ9EPM5 470 aa16.54■□□□□ 0.24
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Tbc1d23Q8K0F1 684 aa16.53■□□□□ 0.24
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Yipf3Q3UDR8 347 aa16.53■□□□□ 0.24
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Ttc13A0A1L1SSC7 844 aa16.53■□□□□ 0.24
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Pde8bE9Q4S1 865 aa16.53■□□□□ 0.24
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Nccrp1G3X9C2 266 aa16.53■□□□□ 0.24
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Snx2Q9CWK8 519 aa16.53■□□□□ 0.24
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Surf6P70279 355 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Ankrd2Q9WV06 328 aa16.53■□□□□ 0.24
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Dnaaf5B9EJR8 853 aa16.53■□□□□ 0.24
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Dsg3O35902 993 aa16.53■□□□□ 0.24
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Asap2Q7SIG6 958 aa16.53■□□□□ 0.24
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 TxlngQ8BHN1 524 aa16.53■□□□□ 0.24
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Snx16Q8C080 344 aa16.53■□□□□ 0.24
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Pls3Q99K51 630 aa16.53■□□□□ 0.24
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Rpa3Q9CQ71 121 aa16.53■□□□□ 0.24
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Cyp2c23E9Q5K4 494 aa16.52■□□□□ 0.24
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Myo1eE9Q634 1107 aa16.52■□□□□ 0.24
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Sv2cQ69ZS6 727 aa16.52■□□□□ 0.24
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Scaf8Q6DID3 1268 aa16.52■□□□□ 0.24
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Hip1Q8VD75 1029 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Prpf6Q91YR7 941 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 DgkkE9Q7N4 1118 aa16.52■□□□□ 0.24
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Sult1d1Q3UZZ6 295 aa16.52■□□□□ 0.24
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Ccdc24E9PUW8 296 aa16.52■□□□□ 0.23
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Ap1m1P35585 423 aa16.52■□□□□ 0.23
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 VdrP48281 422 aa16.52■□□□□ 0.23
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 S100a5P63084 93 aa16.52■□□□□ 0.23
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 NeblQ0II04 452 aa16.52■□□□□ 0.23
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 PsdQ5DTT2 1024 aa16.52■□□□□ 0.23
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