Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39.47■■■■□ 3.91
Lrch2Q3UMG5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Lrch2Q3UMG5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Lrch2Q3UMG5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Lrch2Q3UMG5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Lrch2Q3UMG5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Lrch2Q3UMG5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
Lrch2Q3UMG5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Lrch2Q3UMG5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Lrch2Q3UMG5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Lrch2Q3UMG5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Lrch2Q3UMG5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Lrch2Q3UMG5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Lrch2Q3UMG5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
Lrch2Q3UMG5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Lrch2Q3UMG5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Lrch2Q3UMG5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Lrch2Q3UMG5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Lrch2Q3UMG5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Lrch2Q3UMG5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Lrch2Q3UMG5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Lrch2Q3UMG5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Lrch2Q3UMG5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Lrch2Q3UMG5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Lrch2Q3UMG5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Lrch2Q3UMG5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Lrch2Q3UMG5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
Lrch2Q3UMG5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Lrch2Q3UMG5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Lrch2Q3UMG5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Lrch2Q3UMG5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Lrch2Q3UMG5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Lrch2Q3UMG5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Lrch2Q3UMG5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Lrch2Q3UMG5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Lrch2Q3UMG5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Lrch2Q3UMG5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Lrch2Q3UMG5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Lrch2Q3UMG5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Lrch2Q3UMG5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Lrch2Q3UMG5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Lrch2Q3UMG5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Lrch2Q3UMG5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Lrch2Q3UMG5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Lrch2Q3UMG5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Lrch2Q3UMG5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Lrch2Q3UMG5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Lrch2Q3UMG5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Lrch2Q3UMG5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
Lrch2Q3UMG5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Lrch2Q3UMG5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Lrch2Q3UMG5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Lrch2Q3UMG5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Lrch2Q3UMG5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Lrch2Q3UMG5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Lrch2Q3UMG5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Lrch2Q3UMG5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Lrch2Q3UMG5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Lrch2Q3UMG5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Lrch2Q3UMG5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
Lrch2Q3UMG5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Lrch2Q3UMG5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Lrch2Q3UMG5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Lrch2Q3UMG5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Lrch2Q3UMG5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Lrch2Q3UMG5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Lrch2Q3UMG5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Lrch2Q3UMG5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Lrch2Q3UMG5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Lrch2Q3UMG5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Lrch2Q3UMG5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Lrch2Q3UMG5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Lrch2Q3UMG5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Lrch2Q3UMG5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Lrch2Q3UMG5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Lrch2Q3UMG5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Lrch2Q3UMG5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Lrch2Q3UMG5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Lrch2Q3UMG5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Lrch2Q3UMG5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Lrch2Q3UMG5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Lrch2Q3UMG5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Lrch2Q3UMG5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Lrch2Q3UMG5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Lrch2Q3UMG5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Lrch2Q3UMG5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Lrch2Q3UMG5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Lrch2Q3UMG5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Lrch2Q3UMG5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Lrch2Q3UMG5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Lrch2Q3UMG5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Lrch2Q3UMG5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Lrch2Q3UMG5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Lrch2Q3UMG5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Lrch2Q3UMG5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Lrch2Q3UMG5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Lrch2Q3UMG5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Lrch2Q3UMG5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Lrch2Q3UMG5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Lrch2Q3UMG5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms