Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
Snx16Q8C080 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Snx16Q8C080 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Snx16Q8C080 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Snx16Q8C080 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Snx16Q8C080 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
Snx16Q8C080 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
Snx16Q8C080 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Snx16Q8C080 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Snx16Q8C080 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Snx16Q8C080 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Snx16Q8C080 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Snx16Q8C080 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
Snx16Q8C080 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Snx16Q8C080 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Snx16Q8C080 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Snx16Q8C080 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Snx16Q8C080 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Snx16Q8C080 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Snx16Q8C080 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Snx16Q8C080 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Snx16Q8C080 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Snx16Q8C080 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Snx16Q8C080 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Snx16Q8C080 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Snx16Q8C080 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Snx16Q8C080 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Snx16Q8C080 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Snx16Q8C080 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Snx16Q8C080 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Snx16Q8C080 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Snx16Q8C080 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Snx16Q8C080 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Snx16Q8C080 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Snx16Q8C080 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Snx16Q8C080 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Snx16Q8C080 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Snx16Q8C080 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Snx16Q8C080 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Snx16Q8C080 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Snx16Q8C080 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Snx16Q8C080 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Snx16Q8C080 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Snx16Q8C080 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Snx16Q8C080 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Snx16Q8C080 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Snx16Q8C080 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Snx16Q8C080 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Snx16Q8C080 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Snx16Q8C080 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Snx16Q8C080 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Snx16Q8C080 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Snx16Q8C080 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Snx16Q8C080 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Snx16Q8C080 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Snx16Q8C080 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Snx16Q8C080 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Snx16Q8C080 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Snx16Q8C080 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Snx16Q8C080 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Snx16Q8C080 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Snx16Q8C080 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Snx16Q8C080 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Snx16Q8C080 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Snx16Q8C080 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Snx16Q8C080 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Snx16Q8C080 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Snx16Q8C080 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Snx16Q8C080 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Snx16Q8C080 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Snx16Q8C080 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Snx16Q8C080 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Snx16Q8C080 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Snx16Q8C080 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Snx16Q8C080 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Snx16Q8C080 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Snx16Q8C080 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Snx16Q8C080 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Snx16Q8C080 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Snx16Q8C080 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Snx16Q8C080 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Snx16Q8C080 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Snx16Q8C080 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Snx16Q8C080 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Snx16Q8C080 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Snx16Q8C080 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Snx16Q8C080 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Snx16Q8C080 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Snx16Q8C080 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Snx16Q8C080 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Snx16Q8C080 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Snx16Q8C080 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Snx16Q8C080 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Snx16Q8C080 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Snx16Q8C080 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Snx16Q8C080 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Snx16Q8C080 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Snx16Q8C080 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Snx16Q8C080 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Snx16Q8C080 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
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