Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
NeblQ0II04 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
NeblQ0II04 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.33
NeblQ0II04 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
NeblQ0II04 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
NeblQ0II04 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NeblQ0II04 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
NeblQ0II04 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NeblQ0II04 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
NeblQ0II04 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NeblQ0II04 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NeblQ0II04 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
NeblQ0II04 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NeblQ0II04 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
NeblQ0II04 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
NeblQ0II04 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NeblQ0II04 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
NeblQ0II04 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
NeblQ0II04 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NeblQ0II04 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NeblQ0II04 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
NeblQ0II04 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NeblQ0II04 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NeblQ0II04 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.73
NeblQ0II04 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NeblQ0II04 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
NeblQ0II04 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NeblQ0II04 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NeblQ0II04 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
NeblQ0II04 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
NeblQ0II04 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
NeblQ0II04 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
NeblQ0II04 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
NeblQ0II04 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
NeblQ0II04 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
NeblQ0II04 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NeblQ0II04 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NeblQ0II04 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
NeblQ0II04 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
NeblQ0II04 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NeblQ0II04 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
NeblQ0II04 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
NeblQ0II04 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
NeblQ0II04 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
NeblQ0II04 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NeblQ0II04 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NeblQ0II04 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
NeblQ0II04 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NeblQ0II04 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NeblQ0II04 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
NeblQ0II04 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NeblQ0II04 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
NeblQ0II04 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NeblQ0II04 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
NeblQ0II04 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NeblQ0II04 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NeblQ0II04 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NeblQ0II04 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NeblQ0II04 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NeblQ0II04 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NeblQ0II04 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NeblQ0II04 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
NeblQ0II04 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NeblQ0II04 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
NeblQ0II04 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
NeblQ0II04 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NeblQ0II04 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NeblQ0II04 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NeblQ0II04 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NeblQ0II04 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NeblQ0II04 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NeblQ0II04 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NeblQ0II04 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NeblQ0II04 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NeblQ0II04 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NeblQ0II04 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NeblQ0II04 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NeblQ0II04 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NeblQ0II04 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NeblQ0II04 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NeblQ0II04 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NeblQ0II04 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
NeblQ0II04 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NeblQ0II04 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NeblQ0II04 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NeblQ0II04 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NeblQ0II04 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NeblQ0II04 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NeblQ0II04 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NeblQ0II04 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NeblQ0II04 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NeblQ0II04 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NeblQ0II04 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NeblQ0II04 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NeblQ0II04 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NeblQ0II04 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NeblQ0II04 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NeblQ0II04 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NeblQ0II04 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NeblQ0II04 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.5 ms