Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWK8

Snx2, Sorting nexin-2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx2Q9CWK8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
Snx2Q9CWK8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Snx2Q9CWK8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Snx2Q9CWK8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Snx2Q9CWK8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Snx2Q9CWK8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Snx2Q9CWK8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Snx2Q9CWK8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
Snx2Q9CWK8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
Snx2Q9CWK8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Snx2Q9CWK8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
Snx2Q9CWK8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Snx2Q9CWK8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Snx2Q9CWK8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
Snx2Q9CWK8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Snx2Q9CWK8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Snx2Q9CWK8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Snx2Q9CWK8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Snx2Q9CWK8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Snx2Q9CWK8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Snx2Q9CWK8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Snx2Q9CWK8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Snx2Q9CWK8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Snx2Q9CWK8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Snx2Q9CWK8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
Snx2Q9CWK8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Snx2Q9CWK8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Snx2Q9CWK8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Snx2Q9CWK8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Snx2Q9CWK8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Snx2Q9CWK8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Snx2Q9CWK8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Snx2Q9CWK8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Snx2Q9CWK8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Snx2Q9CWK8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Snx2Q9CWK8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Snx2Q9CWK8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Snx2Q9CWK8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Snx2Q9CWK8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Snx2Q9CWK8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Snx2Q9CWK8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Snx2Q9CWK8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Snx2Q9CWK8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Snx2Q9CWK8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Snx2Q9CWK8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Snx2Q9CWK8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Snx2Q9CWK8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Snx2Q9CWK8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Snx2Q9CWK8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Snx2Q9CWK8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Snx2Q9CWK8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Snx2Q9CWK8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Snx2Q9CWK8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Snx2Q9CWK8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Snx2Q9CWK8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Snx2Q9CWK8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Snx2Q9CWK8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Snx2Q9CWK8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Snx2Q9CWK8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Snx2Q9CWK8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Snx2Q9CWK8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Snx2Q9CWK8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Snx2Q9CWK8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Snx2Q9CWK8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Snx2Q9CWK8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Snx2Q9CWK8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Snx2Q9CWK8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Snx2Q9CWK8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Snx2Q9CWK8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Snx2Q9CWK8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Snx2Q9CWK8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Snx2Q9CWK8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Snx2Q9CWK8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Snx2Q9CWK8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Snx2Q9CWK8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Snx2Q9CWK8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Snx2Q9CWK8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Snx2Q9CWK8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Snx2Q9CWK8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Snx2Q9CWK8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Snx2Q9CWK8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Snx2Q9CWK8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Snx2Q9CWK8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Snx2Q9CWK8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Snx2Q9CWK8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Snx2Q9CWK8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Snx2Q9CWK8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Snx2Q9CWK8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Snx2Q9CWK8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Snx2Q9CWK8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Snx2Q9CWK8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Snx2Q9CWK8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Snx2Q9CWK8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Snx2Q9CWK8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Snx2Q9CWK8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Snx2Q9CWK8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Snx2Q9CWK8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Snx2Q9CWK8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Snx2Q9CWK8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Snx2Q9CWK8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms