RNA–Protein interactions for RNA: YMR088C

VBA1, Transcript of Permease of basic amino acids in the vacuolar membrane, yeast

Gene VBA1, Length 1,689 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VBA1	YMR088C	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	BZZ1	P38822	633 aa		5.38	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	WSS1	P38838	269 aa		5.38	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	CYC2	P38909	366 aa		5.38	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	ERR3	P42222	437 aa		5.38	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	RSM27	P53305	110 aa		5.38	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	5.38	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	5.38	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	NUP116	Q02630	1113 aa		5.38	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	CIA1	Q05583	330 aa		5.38	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	CDC123	Q05791	360 aa		5.38	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	APC9	Q12107	265 aa		5.38	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	DFG16	Q99234	619 aa		5.38	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	MSF1	P08425	469 aa		5.37	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	GAL3	P13045	520 aa		5.37	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	URA6	P15700	204 aa		5.37	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	RBK1	P25332	333 aa		5.37	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	PTC1	P35182	281 aa		5.37	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	TAF14	P35189	244 aa		5.37	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	JEN1	P36035	616 aa		5.37	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	ICS2	P38284	255 aa		5.37	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	YBR259W	P38338	688 aa		5.37	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	TAE1	P38340	232 aa		5.37	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	YHR112C	P38716	378 aa		5.37	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	LYS9	P38999	446 aa		5.37	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	MRPS18	P42847	217 aa		5.37	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	YGR122W	P53272	402 aa		5.37	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	CUZ1	P53899	274 aa		5.37	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	YSA1	Q01976	231 aa		5.37	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	EEB1	Q02891	456 aa		5.37	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	URH1	Q04179	340 aa		5.37	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.37	□□□□□ -1.55	not detected
VBA1	YMR088C	FEX1	Q08913	375 aa		5.37	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	YOR214C	Q12282	236 aa		5.37	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	LTE1	P07866	1435 aa		5.37	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	CCP1	P00431	361 aa		5.37	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	SPS4	P09937	338 aa		5.37	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	INO1	P11986	533 aa		5.37	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	SNF6	P18888	332 aa		5.37	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	DCC1	P25559	380 aa		5.37	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	CPR3	P25719	182 aa		5.37	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	ECM25	P32525	599 aa		5.37	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	SEF1	P34228	1148 aa		5.37	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	RMD6	P39975	231 aa		5.37	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	IRC5	P43610	853 aa		5.37	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	VPS62	P53285	467 aa		5.37	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	PEX13	P80667	386 aa		5.37	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	MRP51	Q02950	344 aa		5.37	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	GPI17	Q04080	534 aa		5.37	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	CRF1	Q04930	467 aa		5.37	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	YLR456W	Q06199	204 aa		5.37	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	LDB18	Q07887	179 aa		5.37	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	YOL075C	Q08234	1294 aa		5.37	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	YLR053C	Q12026	108 aa		5.37	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	SFM1	Q12314	213 aa		5.37	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	DGK1	Q12382	290 aa		5.37	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	ZRT2	Q12436	422 aa		5.37	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	SNF8	Q12483	233 aa		5.37	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	HIR3	P47171	1648 aa		5.36	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	MSS18	P08593	268 aa		5.36	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	SIR1	P21691	654 aa		5.36	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	PER1	P25625	357 aa		5.36	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	CSM1	P25651	190 aa		5.36	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	PRE4	P30657	266 aa		5.36	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	STB6	P36085	766 aa		5.36	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	ECM13	P38195	257 aa		5.36	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	FAT1	P38225	669 aa		5.36	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	MSC7	P38694	644 aa		5.36	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	YJL206C	P39529	758 aa		5.36	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	DOT5	P40553	215 aa		5.36	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	MET28	P40573	187 aa		5.36	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	THI6	P41835	540 aa		5.36	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	IDP2	P41939	412 aa		5.36	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	MIC19	P43594	170 aa		5.36	□□□□□ -1.55

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 22 ms