RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566515.5

CCNDBP1-208, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 1,634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-208ENST00000566515 KCNJ14Q9UNX9 436 aa24■■□□□ 1.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 IFFO2Q5TF58 517 aa23.99■■□□□ 1.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 RASGRP4Q8TDF6 673 aa23.99■■□□□ 1.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 WASF1Q92558 559 aa23.99■■□□□ 1.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 RGS20O76081 388 aa23.99■■□□□ 1.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 FOSP01100 380 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 PCNX4Q63HM2 1172 aa23.99■■□□□ 1.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 BICD2Q8TD16 824 aa23.99■■□□□ 1.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 SCFD2Q8WU76 684 aa23.99■■□□□ 1.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 ANO3Q9BYT9 981 aa23.99■■□□□ 1.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 RTEL1Q9NZ71 1219 aa23.99■■□□□ 1.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa23.98■■□□□ 1.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 ARIH2O95376 493 aa23.98■■□□□ 1.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 FOSBP53539 338 aa23.98■■□□□ 1.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 AP3B2Q13367 1082 aa23.98■■□□□ 1.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 PCDHA4Q9UN74 947 aa23.98■■□□□ 1.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 TXNP10599 105 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 DUSP28Q4G0W2 176 aa23.97■■□□□ 1.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 PHF20Q9BVI0 1012 aa23.97■■□□□ 1.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 EHMT1Q9H9B1 1298 aa23.97■■□□□ 1.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 MYH7BA7E2Y1 1941 aa23.96■■□□□ 1.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 CAPN2P17655 700 aa23.96■■□□□ 1.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 XBP1P17861 261 aa23.96■■□□□ 1.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 TTLL4Q14679 1199 aa23.96■■□□□ 1.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 LRRC41Q15345 812 aa23.96■■□□□ 1.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 NPY5RQ15761 445 aa23.96■■□□□ 1.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCDC62Q6P9F0 684 aa23.96■■□□□ 1.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 ANKLE1Q8NAG6 615 aa23.96■■□□□ 1.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 ARRDC4Q8NCT1 418 aa23.96■■□□□ 1.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 MYADML2A6NDP7 307 aa23.95■■□□□ 1.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 ADAMTS4O75173 837 aa23.95■■□□□ 1.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 LY6KQ17RY6 165 aa23.95■■□□□ 1.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 XRRA1Q6P2D8 792 aa23.95■■□□□ 1.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 TLK2Q86UE8 772 aa23.95■■□□□ 1.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 BLIDQ8IZY5 108 aa23.95■■□□□ 1.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 COPS5Q92905 334 aa23.95■■□□□ 1.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
CCNDBP1-208ENST00000566515 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa23.95■■□□□ 1.42
CCNDBP1-208ENST00000566515 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
CCNDBP1-208ENST00000566515 MRVI1Q9Y6F6 885 aa23.95■■□□□ 1.42
CCNDBP1-208ENST00000566515 STAM2O75886 525 aa23.94■■□□□ 1.42
CCNDBP1-208ENST00000566515 SREBF1P36956 1147 aa23.94■■□□□ 1.42
CCNDBP1-208ENST00000566515 RGS19P49795 217 aa23.94■■□□□ 1.42
CCNDBP1-208ENST00000566515 GJA9P57773 515 aa23.94■■□□□ 1.42
CCNDBP1-208ENST00000566515 MCTP2Q6DN12 878 aa23.94■■□□□ 1.42
CCNDBP1-208ENST00000566515 GALNT17Q6IS24 598 aa23.94■■□□□ 1.42
CCNDBP1-208ENST00000566515 RNF180Q86T96 592 aa23.94■■□□□ 1.42
CCNDBP1-208ENST00000566515 DAGLBQ8NCG7 672 aa23.94■■□□□ 1.42
CCNDBP1-208ENST00000566515 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
CCNDBP1-208ENST00000566515 AP5M1Q9H0R1 490 aa23.94■■□□□ 1.42
CCNDBP1-208ENST00000566515 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
CCNDBP1-208ENST00000566515 DNM1LO00429 736 aa23.93■■□□□ 1.42
CCNDBP1-208ENST00000566515 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
CCNDBP1-208ENST00000566515 BEX3Q00994 111 aa23.93■■□□□ 1.42
CCNDBP1-208ENST00000566515 GNPTABQ3T906 1256 aa23.93■■□□□ 1.42
CCNDBP1-208ENST00000566515 SPC25Q9HBM1 224 aa23.93■■□□□ 1.42
CCNDBP1-208ENST00000566515 Q9Y3F1 56 aa23.93■■□□□ 1.42
CCNDBP1-208ENST00000566515 KBTBD13C9JR72 458 aa23.92■■□□□ 1.42
CCNDBP1-208ENST00000566515 M0R2N6 131 aa23.92■■□□□ 1.42
CCNDBP1-208ENST00000566515 CTAGE5O15320 804 aa23.92■■□□□ 1.42
CCNDBP1-208ENST00000566515 ITGB5P18084 799 aa23.92■■□□□ 1.42
CCNDBP1-208ENST00000566515 ARHGAP4P98171 946 aa23.92■■□□□ 1.42
CCNDBP1-208ENST00000566515 KLHDC9Q8NEP7 349 aa23.92■■□□□ 1.42
CCNDBP1-208ENST00000566515 DOCK5Q9H7D0 1870 aa23.92■■□□□ 1.42
CCNDBP1-208ENST00000566515 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP23.92■■□□□ 1.42
CCNDBP1-208ENST00000566515 SP2Q02086 613 aa23.92■■□□□ 1.42
CCNDBP1-208ENST00000566515 TRIM29Q14134 588 aa23.92■■□□□ 1.42
CCNDBP1-208ENST00000566515 GNASQ5JWF2 1037 aa23.92■■□□□ 1.42
CCNDBP1-208ENST00000566515 NECAB2Q7Z6G3 386 aa23.92■■□□□ 1.42
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM184AQ8NB25 1140 aa23.92■■□□□ 1.42
CCNDBP1-208ENST00000566515 OR6J1Q8NGC5 347 aa23.92■■□□□ 1.42
CCNDBP1-208ENST00000566515 OXER1Q8TDS5 423 aa23.92■■□□□ 1.42
CCNDBP1-208ENST00000566515 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa23.92■■□□□ 1.42
CCNDBP1-208ENST00000566515 DNAH12Q6ZR08 3092 aa23.91■■□□□ 1.42
CCNDBP1-208ENST00000566515 SORBS3O60504 671 aa23.91■■□□□ 1.42
CCNDBP1-208ENST00000566515 GUCY1B3Q02153 619 aa23.91■■□□□ 1.42
CCNDBP1-208ENST00000566515 SEMA3FQ13275 785 aa23.91■■□□□ 1.42
CCNDBP1-208ENST00000566515 KCNA10Q16322 511 aa23.91■■□□□ 1.42
CCNDBP1-208ENST00000566515 KRT40Q6A162 431 aa23.91■■□□□ 1.42
CCNDBP1-208ENST00000566515 KCNV1Q6PIU1 500 aa23.91■■□□□ 1.42
CCNDBP1-208ENST00000566515 CYP2W1Q8TAV3 490 aa23.91■■□□□ 1.42
CCNDBP1-208ENST00000566515 CRYGNQ8WXF5 182 aa23.91■■□□□ 1.42
CCNDBP1-208ENST00000566515 C11orf49Q9H6J7 331 aa23.91■■□□□ 1.42
CCNDBP1-208ENST00000566515 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa23.9■■□□□ 1.42
CCNDBP1-208ENST00000566515 FIBPO43427 364 aa23.9■■□□□ 1.42
CCNDBP1-208ENST00000566515 ICAM3P32942 547 aa23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.2 ms