RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560971.1

GCSHP2-201, Transcript of glycine cleavage system protein H pseudogene 2, humanhuman

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Gene GCSHP2, Length 527 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP2-201ENST00000560971 STXBP3O00186 592 aa21.4■■□□□ 1.02
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GCSHP2-201ENST00000560971 STK3Q13188 491 aa21.4■■□□□ 1.02
GCSHP2-201ENST00000560971 CXCL17Q6UXB2 119 aa21.4■■□□□ 1.02
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
GCSHP2-201ENST00000560971 BARHL2Q9NY43 387 aa21.4■■□□□ 1.02
GCSHP2-201ENST00000560971 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP21.39■■□□□ 1.01
GCSHP2-201ENST00000560971 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
GCSHP2-201ENST00000560971 PKN1Q16512 942 aa21.39■■□□□ 1.01
GCSHP2-201ENST00000560971 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
GCSHP2-201ENST00000560971 VTI1AQ96AJ9 217 aa21.39■■□□□ 1.01
GCSHP2-201ENST00000560971 GLT1D1Q96MS3 346 aa21.39■■□□□ 1.01
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GCSHP2-201ENST00000560971 C1orf53Q5VUE5 145 aa21.38■■□□□ 1.01
GCSHP2-201ENST00000560971 PPP1R18Q6NYC8 613 aa21.38■■□□□ 1.01
GCSHP2-201ENST00000560971 SLC26A6Q9BXS9 759 aa21.38■■□□□ 1.01
GCSHP2-201ENST00000560971 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
GCSHP2-201ENST00000560971 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
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GCSHP2-201ENST00000560971 ZEB2O60315 1214 aa21.37■■□□□ 1.01
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GCSHP2-201ENST00000560971 AK2P54819 239 aa21.37■■□□□ 1.01
GCSHP2-201ENST00000560971 TLE2Q04725 743 aa21.37■■□□□ 1.01
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GCSHP2-201ENST00000560971 RTEL1Q9NZ71 1219 aa21.37■■□□□ 1.01
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GCSHP2-201ENST00000560971 hCG_1984214I3L0E3 225 aa21.36■■□□□ 1.01
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GCSHP2-201ENST00000560971 ADCY7P51828 1080 aa21.36■■□□□ 1.01
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GCSHP2-201ENST00000560971 ARHGAP1Q07960 439 aa21.36■■□□□ 1.01
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
GCSHP2-201ENST00000560971 PCDHA6Q9UN73 950 aa21.36■■□□□ 1.01
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GCSHP2-201ENST00000560971 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa21.36■■□□□ 1.01
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GCSHP2-201ENST00000560971 A6NJR5 290 aa21.35■■□□□ 1.01
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GCSHP2-201ENST00000560971 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
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GCSHP2-201ENST00000560971 ANKRD1Q15327 319 aa21.33■■□□□ 1.01
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GCSHP2-201ENST00000560971 PFKFB2O60825 505 aa21.32■■□□□ 1
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GCSHP2-201ENST00000560971 FAAP100Q0VG06 881 aa21.32■■□□□ 1
GCSHP2-201ENST00000560971 SEMA3FQ13275 785 aa21.32■■□□□ 1
GCSHP2-201ENST00000560971 ITGA7Q13683 1181 aa21.32■■□□□ 1
GCSHP2-201ENST00000560971 GNPTABQ3T906 1256 aa21.32■■□□□ 1
GCSHP2-201ENST00000560971 XRRA1Q6P2D8 792 aa21.32■■□□□ 1
GCSHP2-201ENST00000560971 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
GCSHP2-201ENST00000560971 LARGE1O95461 756 aa21.31■■□□□ 1
GCSHP2-201ENST00000560971 GGPS1O95749 300 aa21.31■■□□□ 1
GCSHP2-201ENST00000560971 MMP3P08254 477 aa21.31■■□□□ 1
GCSHP2-201ENST00000560971 CLTBP09497 229 aa21.31■■□□□ 1
GCSHP2-201ENST00000560971 TGFB3P10600 412 aa21.31■■□□□ 1
GCSHP2-201ENST00000560971 ICAM3P32942 547 aa21.31■■□□□ 1
GCSHP2-201ENST00000560971 CLK2P49760 499 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
GCSHP2-201ENST00000560971 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
GCSHP2-201ENST00000560971 LAMC2Q13753 1193 aa21.31■■□□□ 1
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