RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510921.5

CCNH-208, Transcript of cyclin H, human

TSL 4

Gene CCNH, Length 549 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCNH-208	ENST00000510921	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	C22orf46	C9J442	243 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	C8B	P07358	591 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	SLC6A11	P48066	632 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62	6e-7	■■□□□ 11.9
CCNH-208	ENST00000510921	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921		Q8N1Y9	231 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	KY	Q8NBH2	561 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	SEC14L1	Q92503	715 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	CCDC140	Q96MF4	163 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	C8orf37	Q96NL8	207 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	SCG5	P05408	212 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	GJA9	P57773	515 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	TESK1	Q15569	626 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	MROH9	Q5TGP6	573 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	CCDC103	Q8IW40	242 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	TINF2	Q9BSI4	451 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	LGR4	Q9BXB1	951 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	PALD1	Q9ULE6	856 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921		X6R8D5	127 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921		K7ESM1	405 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	CP	P00450	1065 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	CAPNS1	P04632	268 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	ITGB3	P05106	788 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	ITGAV	P06756	1048 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	CNR2	P34972	360 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	THBS2	P35442	1172 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	GTF2A2	P52657	109 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	CEP68	Q76N32	757 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	MILR1	Q7Z6M3	343 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	TTLL6	Q8N841	843 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	ADAMTS17	Q8TE56	1095 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	SYT3	Q9BQG1	590 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	CAPN10	Q9HC96	672 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	OVOL3	O00110	214 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	TNNI3K	Q59H18	835 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	PRR31	Q5SQ13	230 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	VPS37D	Q86XT2	251 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	DIO2	Q92813	273 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	BTG4	Q9NY30	223 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCNH-208	ENST00000510921	TBX1	O43435	398 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	FPR2	P25090	351 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	BCL6	P41182	706 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	ITGA1	P56199	1179 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	KCNAB2	Q13303	367 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	CR1L	Q2VPA4	569 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	RGL3	Q3MIN7	710 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	SV2C	Q496J9	727 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	ZNF227	Q86WZ6	799 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	TMEM169	Q96HH4	297 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921		H7BY64	318 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	MYO1B	O43795	1136 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	SUSD5	O60279	629 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	ECI1	P42126	302 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	NLRP10	Q86W26	655 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	MROH6	A6NGR9	719 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNH-208	ENST00000510921	TADA3	O75528	432 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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