RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507116.5

PDE4D-216, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 3,350 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-216ENST00000507116 SIGIRRQ6IA17 410 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 PDXDC1Q6P996 788 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 DSTYKQ6XUX3 929 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 DPH6Q7L8W6 267 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 CARNMT1Q8N4J0 409 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 AGAP11Q8TF27 550 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 RUNDC1Q96C34 613 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 MED30Q96HR3 178 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 NSMCE3Q96MG7 304 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 GBP5Q96PP8 586 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 HAPLN3Q96S86 360 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 PNKPQ96T60 521 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 MPHOSPH9Q99550 1183 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 CCSER1Q9C0I3 900 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 TRPC7Q9HCX4 862 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 PLCB1Q9NQ66 1216 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 CYLDQ9NQC7 956 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 NDUFA13Q9P0J0 144 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 NOX1Q9Y5S8 564 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF536O15090 1300 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 PARD3Q8TEW0 1356 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 GOLGA8TH3BQL2 631 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 MATN2O00339 956 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 CETN3O15182 167 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 KMOO15229 486 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 DGKIO75912 1065 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 ASLP04424 464 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 GOLGA8HP0CJ92 632 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 PCNAP12004 261 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 SERPINB6P35237 376 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF165P49910 485 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 TUBP50607 506 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 ADARP55265 1226 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 MCL1Q07820 350 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 NIPAL4Q0D2K0 466 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 HSPA14Q0VDF9 509 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 SLC27A3Q5K4L6 730 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 ATL3Q6DD88 541 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 MTMR9Q96QG7 549 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 CARD14Q9BXL6 1004 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 FAM129AQ9BZQ8 928 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 SPC25Q9HBM1 224 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 ARAP1Q96P48 1450 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 FAM135AQ9P2D6 1515 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 A0A1W2PQ67 120 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 NOTOA8MTQ0 251 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 KIF28PB7ZC32 967 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 RPN1P04843 607 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 GBP1P32455 592 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 THOP1P52888 689 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 SPCS2Q15005 226 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 TOMM20Q15388 145 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 PPP1R7Q15435 360 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 NCAPH2Q6IBW4 605 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 OR52E8Q6IFG1 317 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 WDR93Q6P2C0 686 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 CCDC81Q6ZN84 652 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 EHBP1Q8NDI1 1231 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 CCDC127Q96BQ5 260 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 CFAP36Q96G28 342 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 ERP44Q9BS26 406 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 KLHL4Q9C0H6 718 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 NUP62CLQ9H1M0 184 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 FANCFQ9NPI8 374 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 CNGB3Q9NQW8 809 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 PAG1Q9NWQ8 432 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 MOCS1Q9NZB8 636 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 TRIM17Q9Y577 477 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 PLXNC1O60486 1568 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 KANSL1LA0AUZ9 987 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 DNM1LO00429 736 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 TMCC2O75069 709 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 SERPINB7O75635 380 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 S100A6P06703 90 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 WEE1P30291 646 aa6.74□□□□□ -1.33
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