RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469271.1

NOM1-203, Transcript of nucleolar protein with MIF4G domain 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NOM1, Length 1,209 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1-203ENST00000469271 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
NOM1-203ENST00000469271 GNASQ5JWF2 1037 aa23.53■■□□□ 1.36
NOM1-203ENST00000469271 SEPT14Q6ZU15 432 aa23.53■■□□□ 1.36
NOM1-203ENST00000469271 CCDC148Q8NFR7 591 aa23.53■■□□□ 1.36
NOM1-203ENST00000469271 DEXIO95424 95 aa23.52■■□□□ 1.36
NOM1-203ENST00000469271 SCRN1Q12765 414 aa23.52■■□□□ 1.36
NOM1-203ENST00000469271 PKN1Q16512 942 aa23.52■■□□□ 1.36
NOM1-203ENST00000469271 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
NOM1-203ENST00000469271 GNPTABQ3T906 1256 aa23.52■■□□□ 1.36
NOM1-203ENST00000469271 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
NOM1-203ENST00000469271 MCTP2Q6DN12 878 aa23.52■■□□□ 1.36
NOM1-203ENST00000469271 TYW1BQ6NUM6 668 aa23.52■■□□□ 1.36
NOM1-203ENST00000469271 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
NOM1-203ENST00000469271 SH3GLB2Q9NR46 395 aa23.52■■□□□ 1.36
NOM1-203ENST00000469271 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 EVI5O60447 810 aa23.51■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 GNA11P29992 359 aa23.51■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 CPT1AP50416 773 aa23.51■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 AP3B2Q13367 1082 aa23.51■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 KCNA10Q16322 511 aa23.51■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 PCNX4Q63HM2 1172 aa23.51■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 ZMYND12Q9H0C1 365 aa23.51■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 C6orf50Q9HD87 102 aa23.51■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 NR2E3Q9Y5X4 410 aa23.51■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 MRVI1Q9Y6F6 885 aa23.51■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 TGFB3P10600 412 aa23.5■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 ACLYP53396 1101 aa23.5■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 RABEP1Q15276 862 aa23.5■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 UBE2SQ16763 222 aa23.5■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 CCDC62Q6P9F0 684 aa23.5■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 IL31RAQ8NI17 732 aa23.5■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 BICD2Q8TD16 824 aa23.5■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 KIF2CQ99661 725 aa23.5■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 A0A1W2PQY0 241 aa23.49■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 MYADML2A6NDP7 307 aa23.49■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 ME3Q16798 604 aa23.49■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 C1orf53Q5VUE5 145 aa23.49■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 OR6J1Q8NGC5 347 aa23.49■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 GTF3C6Q969F1 213 aa23.49■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 GLT1D1Q96MS3 346 aa23.49■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 PCDHA6Q9UN73 950 aa23.49■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa23.49■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa23.49■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 CTAGE5O15320 804 aa23.48■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 CABYRO75952 493 aa23.48■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 GH1P01241 217 aa23.48■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 ASGR1P07306 291 aa23.48■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 FERMT2Q96AC1 680 aa23.48■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 ELP1O95163 1332 aa23.48■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 STK36Q9NRP7 1315 aa23.48■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 PPFIA3O75145 1194 aa23.47■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 ARIH2O95376 493 aa23.47■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa23.47■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 WASF1Q92558 559 aa23.47■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 STARD7Q9NQZ5 370 aa23.47■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa23.47■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 ST18O60284 1047 aa23.46■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 KPNA6O60684 536 aa23.46■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 RGS20O76081 388 aa23.46■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 XBP1P17861 261 aa23.46■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 CLK2P49760 499 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 BEX3Q00994 111 aa23.46■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 SNX17Q15036 470 aa23.46■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 LY6KQ17RY6 165 aa23.46■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 LRRC26Q2I0M4 334 aa23.46■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 TMEM63BQ5T3F8 832 aa23.46■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 NLRX1Q86UT6 975 aa23.46■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 CDHR1Q96JP9 859 aa23.46■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 TBC1D32Q96NH3 1257 aa23.46■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 POLR3EQ9NVU0 708 aa23.46■■□□□ 1.35
NOM1-203ENST00000469271 A6NJR5 290 aa23.45■■□□□ 1.34
NOM1-203ENST00000469271 FIBPO43427 364 aa23.45■■□□□ 1.34
NOM1-203ENST00000469271 ICAM3P32942 547 aa23.45■■□□□ 1.34
NOM1-203ENST00000469271 LAMC2Q13753 1193 aa23.45■■□□□ 1.34
NOM1-203ENST00000469271 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
NOM1-203ENST00000469271 GALNT17Q6IS24 598 aa23.45■■□□□ 1.34
NOM1-203ENST00000469271 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa23.45■■□□□ 1.34
NOM1-203ENST00000469271 ANO3Q9BYT9 981 aa23.45■■□□□ 1.34
NOM1-203ENST00000469271 BACH2Q9BYV9 841 aa23.45■■□□□ 1.34
NOM1-203ENST00000469271 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
NOM1-203ENST00000469271 VPS54Q9P1Q0 977 aa23.45■■□□□ 1.34
NOM1-203ENST00000469271 DNAH12Q6ZR08 3092 aa23.45■■□□□ 1.34
NOM1-203ENST00000469271 NLRP5P59047 1200 aa23.44■■□□□ 1.34
NOM1-203ENST00000469271 NECAB1Q8N987 351 aa23.44■■□□□ 1.34
NOM1-203ENST00000469271 VTI1AQ96AJ9 217 aa23.44■■□□□ 1.34
NOM1-203ENST00000469271 GPRASP2Q96D09 838 aa23.44■■□□□ 1.34
NOM1-203ENST00000469271 RTEL1Q9NZ71 1219 aa23.44■■□□□ 1.34
NOM1-203ENST00000469271 MROH7Q68CQ1 1323 aa23.43■■□□□ 1.34
NOM1-203ENST00000469271 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa23.43■■□□□ 1.34
NOM1-203ENST00000469271 MAFGO15525 162 aa23.43■■□□□ 1.34
NOM1-203ENST00000469271 PTGS1P23219 599 aa23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.1 ms