RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VWCEQ96DN2 955 aa30.4■■■□□ 2.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PIGSQ96S52 555 aa30.4■■■□□ 2.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP30.4■■■□□ 2.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NOD1Q9Y239 953 aa30.4■■■□□ 2.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MRVI1Q9Y6F6 885 aa30.4■■■□□ 2.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa30.4■■■□□ 2.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CASTP20810 708 aaKnown RBP30.39■■■□□ 2.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM67Q5HYA8 995 aa30.39■■■□□ 2.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHD9Q3L8U1 2897 aa30.39■■■□□ 2.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZBBXA8MT70 800 aa30.38■■■□□ 2.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP30.38■■■□□ 2.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TROAPQ12815 778 aa30.38■■■□□ 2.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DEFB128Q7Z7B8 93 aa30.38■■■□□ 2.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CATIPQ7Z7H3 387 aa30.38■■■□□ 2.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RETREG2Q8NC44 543 aa30.38■■■□□ 2.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PDCD2LQ9BRP1 358 aa30.38■■■□□ 2.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PITPNM1O00562 1244 aa30.37■■■□□ 2.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP30.37■■■□□ 2.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RFC2P35250 354 aa30.37■■■□□ 2.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DGKDQ16760 1214 aa30.37■■■□□ 2.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP30.37■■■□□ 2.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP30.37■■■□□ 2.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa30.36■■■□□ 2.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CYTH3O43739 400 aa30.36■■■□□ 2.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANTXR2P58335 489 aa30.36■■■□□ 2.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BFSP2Q13515 415 aa30.36■■■□□ 2.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LAMC2Q13753 1193 aa30.36■■■□□ 2.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa30.36■■■□□ 2.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa30.35■■■□□ 2.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POLR2MP0CAP2 368 aa30.35■■■□□ 2.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PTGISQ16647 500 aa30.35■■■□□ 2.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SESTD1Q86VW0 696 aa30.35■■■□□ 2.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa30.35■■■□□ 2.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KAT2BQ92831 832 aa30.35■■■□□ 2.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRDM12Q9H4Q4 367 aa30.35■■■□□ 2.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC28A3Q9HAS3 691 aa30.35■■■□□ 2.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SCN5AQ14524 2016 aa30.34■■■□□ 2.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GBF1Q92538 1859 aa30.34■■■□□ 2.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IQCF3P0C7M6 154 aa30.34■■■□□ 2.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PGM5Q15124 567 aa30.34■■■□□ 2.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCNV1Q6PIU1 500 aa30.34■■■□□ 2.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VSIG10LQ86VR7 867 aa30.34■■■□□ 2.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RGS20O76081 388 aa30.33■■■□□ 2.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ACTN1P12814 892 aa30.33■■■□□ 2.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP30.33■■■□□ 2.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC155Q8N6L0 562 aa30.33■■■□□ 2.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPTC7Q8NI37 304 aa30.33■■■□□ 2.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TANC1Q9C0D5 1861 aa30.32■■■□□ 2.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP30.32■■■□□ 2.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCND2P30279 289 aa30.32■■■□□ 2.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RABGGTBP53611 331 aa30.32■■■□□ 2.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FCHSD1Q86WN1 690 aa30.32■■■□□ 2.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IL31RAQ8NI17 732 aa30.32■■■□□ 2.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KATNAL1Q9BW62 490 aa30.32■■■□□ 2.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PSEN2P49810 448 aa30.31■■■□□ 2.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C7orf31Q8N865 590 aa30.31■■■□□ 2.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CAGE1Q8TC20 777 aa30.31■■■□□ 2.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PIBF1Q8WXW3 757 aa30.31■■■□□ 2.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAP3K14Q99558 947 aa30.31■■■□□ 2.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP30.31■■■□□ 2.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa30.31■■■□□ 2.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYSM1Q5VVJ2 828 aa30.3■■■□□ 2.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CASC1Q6TDU7 716 aa30.3■■■□□ 2.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF654Q8IZM8 581 aa30.3■■■□□ 2.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LY9Q9HBG7 655 aa30.3■■■□□ 2.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa30.3■■■□□ 2.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYH7BA7E2Y1 1941 aa30.3■■■□□ 2.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 F2P00734 622 aa30.29■■■□□ 2.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF286BP0CG31 522 aa30.29■■■□□ 2.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TGFB3P10600 412 aa30.29■■■□□ 2.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP30.29■■■□□ 2.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 USP38Q8NB14 1042 aa30.29■■■□□ 2.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AFAP1L1Q8TED9 768 aa30.29■■■□□ 2.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CTAGE1Q96RT6 745 aa30.29■■■□□ 2.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ALG1Q9BT22 464 aa30.29■■■□□ 2.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MTA3Q9BTC8 594 aa30.29■■■□□ 2.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HDAC6Q9UBN7 1215 aa30.29■■■□□ 2.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRC1O43663 620 aa30.28■■■□□ 2.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SORBS3O60504 671 aa30.28■■■□□ 2.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DDAH1O94760 285 aa30.28■■■□□ 2.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GGPS1O95749 300 aa30.28■■■□□ 2.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIF5BP33176 963 aa30.28■■■□□ 2.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MFSD10Q14728 455 aa30.28■■■□□ 2.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPP2R2DQ66LE6 453 aa30.28■■■□□ 2.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP30.28■■■□□ 2.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPATA33Q96N06 139 aa30.28■■■□□ 2.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYL10Q9BUA6 226 aa30.28■■■□□ 2.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPFIA4O75335 1185 aa30.27■■■□□ 2.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP30.27■■■□□ 2.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYOGP15173 224 aa30.27■■■□□ 2.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MCM5P33992 734 aa30.27■■■□□ 2.44
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