RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423339.2

CCDC82-202, Transcript of coiled-coil domain containing 82, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC82, Length 1,878 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82-202ENST00000423339 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa4.56□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF227Q86WZ6 799 aa4.56□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 BTN2A2Q8WVV5 523 aa4.56□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 SGSM3Q96HU1 749 aa4.56□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 BACE2Q9Y5Z0 518 aa4.56□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 C2orf71A6NGG8 1288 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 SEPHS1P49903 392 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 CRB2Q5IJ48 1285 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 SH3TC2Q8TF17 1288 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 LOXL4Q96JB6 756 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 PTCHD1Q96NR3 888 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 PLCD4Q9BRC7 762 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 GPRC5CQ9NQ84 441 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 TAF6LQ9Y6J9 622 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 SDHBP21912 280 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 CNR2P34972 360 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 GJA9P57773 515 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 SCRN1Q12765 414 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 SF1Q15637 639 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 LONRF2Q1L5Z9 754 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 EEF1DP3Q658K8 133 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 SPATC1Q76KD6 591 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 SLCO6A1Q86UG4 719 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 JMJD8Q96S16 334 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 A0A1W2PQU0 124 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 A0A1W2PQY0 241 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 TBC1D8O95759 1140 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 SLPIP03973 132 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 GRIA2P42262 883 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 CYP4F3Q08477 520 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 RCSD1Q6JBY9 416 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 JAMLQ86YT9 394 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 COPS5Q92905 334 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 SPATA25Q9BR10 227 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 SPATA9Q9BWV2 254 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 CYP26B1Q9NR63 512 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 TMEM260Q9NX78 707 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 KDM2BQ8NHM5 1336 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 AGRPO00253 132 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 FZD7O75084 574 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 THBDP07204 575 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 ACVRL1P37023 503 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 PPP2R2AP63151 447 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 SQSTM1Q13501 440 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 NR1I3Q14994 352 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 PRSS53Q2L4Q9 553 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 CYP2R1Q6VVX0 501 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 HOMER1Q86YM7 354 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 CPNE8Q86YQ8 564 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 CHST13Q8NET6 341 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 KANSL2Q9H9L4 492 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 CLEC1BQ9P126 229 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 IMPACTQ9P2X3 320 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 PFDN2Q9UHV9 154 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 IRS2Q9Y4H2 1338 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC82-202ENST00000423339 SH3D21A4FU49 640 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 ADCY3O60266 1144 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 CLSTN1O94985 981 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 MSL3P1P0C860 447 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 PLS3P13797 630 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 PRKCAP17252 672 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 ECI1P42126 302 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 KCNJ6P48051 423 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 SYNPOQ8N3V7 929 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 NUP43Q8NFH3 380 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP4.52□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 ESYT3A0FGR9 886 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 NUDT19A8MXV4 375 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 CDC45O75419 566 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 CAPNS1P04632 268 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 PAMP19021 973 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 HOXC12P31275 282 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 MAPKAPK2P49137 400 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 VWA3BQ502W6 1294 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 FRS2Q8WU20 508 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 APPBP2Q92624 585 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 C8orf49Q96NF6 230 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 FANCLQ9NW38 375 aa4.52□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 102.2 ms