RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330334.7

HDDC3-201, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HDDC3, Length 1,047 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-201ENST00000330334 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
HDDC3-201ENST00000330334 SLC17A8Q8NDX2 589 aa20.55■□□□□ 0.88
HDDC3-201ENST00000330334 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
HDDC3-201ENST00000330334 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
HDDC3-201ENST00000330334 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa20.55■□□□□ 0.88
HDDC3-201ENST00000330334 MYH6P13533 1939 aa20.55■□□□□ 0.88
HDDC3-201ENST00000330334 UMODL1Q5DID0 1318 aa20.54■□□□□ 0.88
HDDC3-201ENST00000330334 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
HDDC3-201ENST00000330334 FGBP02675 491 aa20.54■□□□□ 0.88
HDDC3-201ENST00000330334 MMP3P08254 477 aa20.54■□□□□ 0.88
HDDC3-201ENST00000330334 ACRP10323 421 aa20.54■□□□□ 0.88
HDDC3-201ENST00000330334 CASTP20810 708 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
HDDC3-201ENST00000330334 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
HDDC3-201ENST00000330334 DGKDQ16760 1214 aa20.54■□□□□ 0.88
HDDC3-201ENST00000330334 SESTD1Q86VW0 696 aa20.54■□□□□ 0.88
HDDC3-201ENST00000330334 WNT8AQ9H1J5 351 aa20.54■□□□□ 0.88
HDDC3-201ENST00000330334 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
HDDC3-201ENST00000330334 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
HDDC3-201ENST00000330334 ANO2Q9NQ90 1003 aa20.54■□□□□ 0.88
HDDC3-201ENST00000330334 MRVI1Q9Y6F6 885 aa20.54■□□□□ 0.88
HDDC3-201ENST00000330334 RGS20O76081 388 aa20.53■□□□□ 0.88
HDDC3-201ENST00000330334 PFKMP08237 780 aa20.53■□□□□ 0.88
HDDC3-201ENST00000330334 CALM1P0DP23 149 aa20.53■□□□□ 0.88
HDDC3-201ENST00000330334 CALM2P0DP24 149 aa20.53■□□□□ 0.88
HDDC3-201ENST00000330334 CALM3P0DP25 149 aa20.53■□□□□ 0.88
HDDC3-201ENST00000330334 PGM5Q15124 567 aa20.53■□□□□ 0.88
HDDC3-201ENST00000330334 RNF20Q5VTR2 975 aa20.53■□□□□ 0.88
HDDC3-201ENST00000330334 PPTC7Q8NI37 304 aa20.53■□□□□ 0.88
HDDC3-201ENST00000330334 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
HDDC3-201ENST00000330334 FAM161BQ96MY7 647 aa20.53■□□□□ 0.88
HDDC3-201ENST00000330334 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
HDDC3-201ENST00000330334 CDH23Q9H251 3354 aa20.52■□□□□ 0.88
HDDC3-201ENST00000330334 CCDC69A6NI79 296 aa20.52■□□□□ 0.88
HDDC3-201ENST00000330334 PITPNM1O00562 1244 aa20.52■□□□□ 0.88
HDDC3-201ENST00000330334 STAM2O75886 525 aa20.52■□□□□ 0.88
HDDC3-201ENST00000330334 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
HDDC3-201ENST00000330334 DNAJB2P25686 324 aa20.52■□□□□ 0.88
HDDC3-201ENST00000330334 CCL23P55773 120 aa20.52■□□□□ 0.88
HDDC3-201ENST00000330334 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
HDDC3-201ENST00000330334 PIK3CDO00329 1044 aa20.51■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 PPFIA4O75335 1185 aa20.51■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 CYP2C9P11712 490 aa20.51■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 CCND2P30279 289 aa20.51■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 TSGA10IPQ3SY00 556 aa20.51■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 FAM47CQ5HY64 1035 aa20.51■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 MYSM1Q5VVJ2 828 aa20.51■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 NFXL1Q6ZNB6 911 aa20.51■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 SGMS1Q86VZ5 419 aa20.51■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 KAT2BQ92831 832 aa20.51■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 VWCEQ96DN2 955 aa20.51■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 FRMPD4Q14CM0 1322 aa20.51■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 RFC2P35250 354 aa20.5■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 FCHSD1Q86WN1 690 aa20.5■□□□□ 0.87
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HDDC3-201ENST00000330334 KATNAL1Q9BW62 490 aa20.5■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 SLC12A7Q9Y666 1083 aa20.5■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa20.5■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 BFSP2Q13515 415 aa20.49■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 XRRA1Q6P2D8 792 aa20.49■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 FANCBQ8NB91 859 aa20.49■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 IL31RAQ8NI17 732 aa20.49■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 TIFAQ96CG3 184 aa20.49■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 HAS3O00219 553 aa20.48■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 F2P00734 622 aa20.48■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 ICAM3P32942 547 aa20.48■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 SP2Q02086 613 aa20.48■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 PTGISQ16647 500 aa20.48■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 RETREG2Q8NC44 543 aa20.48■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 CAGE1Q8TC20 777 aa20.48■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 SCLYQ96I15 445 aa20.48■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 NEK1Q96PY6 1258 aa20.48■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 PBX4Q9BYU1 374 aa20.48■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 ZNF576Q9H609 170 aa20.48■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 MEIS2O14770 477 aa20.47■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 CDC45O75419 566 aa20.47■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 PLEKHA8P1O95397 391 aa20.47■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 IQCF3P0C7M6 154 aa20.47■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 RAB30Q15771 203 aa20.47■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 GNPTABQ3T906 1256 aa20.47■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 OTOP2Q7RTS6 562 aa20.47■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 SKAP1Q86WV1 359 aa20.47■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 CUL5Q93034 780 aa20.47■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 SPATA33Q96N06 139 aa20.47■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa20.47■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 NOD1Q9Y239 953 aa20.47■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 UNC80Q8N2C7 3258 aa20.47■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa20.46■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 GGPS1O95749 300 aa20.46■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 PSEN2P49810 448 aa20.46■□□□□ 0.87
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