RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325897.4

CLVS1-201, Transcript of clavesin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLVS1, Length 3,486 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-201ENST00000325897 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa5.45□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 LRRC43Q8N309 656 aa5.45□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF653Q96CK0 615 aa5.45□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 ABHD8Q96I13 439 aa5.45□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 UQCC2Q9BRT2 126 aa5.45□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 VCPKMTQ9H867 229 aa5.45□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 IL20Q9NYY1 176 aa5.45□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF148Q9UQR1 794 aa5.45□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa5.45□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 SHANK3Q9BYB0 1731 aa5.45□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 TRIM43BA6NCK2 446 aa5.45□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 CYTH3O43739 400 aa5.45□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 SNX2O60749 519 aa5.45□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 SMIM24O75264 130 aa5.45□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 LDHBP07195 334 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 UBL4AP11441 157 aa5.45□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 SYT1P21579 422 aa5.45□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 CD9P21926 228 aa5.45□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 CNGA1P29973 690 aa5.45□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 NLRP12P59046 1061 aa5.45□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 PTH1RQ03431 593 aa5.45□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 POU5F1BQ06416 359 aa5.45□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 LAPTM5Q13571 262 aa5.45□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP5.45□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 PTPN14Q15678 1187 aa5.45□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 PCNX4Q63HM2 1172 aa5.45□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 CABP7Q86V35 215 aa5.45□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 OSTM1Q86WC4 334 aa5.45□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 RASEFQ8IZ41 740 aa5.45□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 CCDC89Q8N998 374 aa5.45□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 MAIP1Q8WWC4 291 aa5.45□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 DNAI2Q9GZS0 605 aa5.45□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 CNNM1Q9NRU3 951 aa5.45□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 KCTD5Q9NXV2 234 aa5.45□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 WDR35Q9P2L0 1181 aa5.45□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa5.45□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa5.45□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 PHLPP1O60346 1717 aa5.45□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa5.44□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 MAP2K7O14733 419 aa5.44□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 MGRN1O60291 552 aa5.44□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP5.44□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 SIK1P57059 783 aa5.44□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 UBASH3AP57075 661 aa5.44□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP5.44□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 BLMHQ13867 455 aa5.44□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 CRY1Q16526 586 aa5.44□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 METTL24Q5JXM2 366 aa5.44□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa5.44□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 TMC4Q7Z404 712 aa5.44□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 MAATS1Q7Z4T9 603 aa5.44□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 NLRP10Q86W26 655 aa5.44□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 LSMEM2Q8N112 164 aa5.44□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 SLC4A9Q96Q91 983 aa5.44□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 PCMTD2Q9NV79 361 aa5.44□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa5.44□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 RPN1P04843 607 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 POTEIP0CG38 1075 aa5.44□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 PSMA5P28066 241 aa5.44□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 ARHGAP25P42331 645 aa5.44□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 CYP4A11Q02928 519 aa5.44□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 BNIP1Q12981 228 aa5.44□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 CCDC153Q494R4 210 aa5.44□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 CCDC14Q49A88 953 aa5.44□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 TTC39AQ5SRH9 613 aa5.44□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 BEND5Q7L4P6 421 aa5.44□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 ATG9AQ7Z3C6 839 aa5.44□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 CKAP2LQ8IYA6 745 aa5.44□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 HS6ST3Q8IZP7 471 aa5.44□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 ARFGAP3Q9NP61 516 aa5.44□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 PAG1Q9NWQ8 432 aa5.44□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa5.44□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa5.44□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 PAPPAQ13219 1627 aa5.44□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa5.44□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 POTEFA5A3E0 1075 aa5.44□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 WDR46O15213 610 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 CIAO1O76071 339 aa5.44□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 PCP11498 1178 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
CLVS1-201ENST00000325897 CPA1P15085 419 aa5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.1 ms