RNA–Protein interactions for RNA: YLR349W

YLR349W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLR349W, Length 507 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR349WYLR349W SUI1P32911 108 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
YLR349WYLR349W LHS1P36016 881 aa8.68□□□□□ -1.02
YLR349WYLR349W ROG1P53118 685 aa8.68□□□□□ -1.02
YLR349WYLR349W SNP1Q00916 300 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
YLR349WYLR349W ADE13Q05911 482 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
YLR349WYLR349W RRP40Q08285 240 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
YLR349WYLR349W MDM32Q12171 622 aa8.68□□□□□ -1.02
YLR349WYLR349W AI1P03875 834 aa8.67□□□□□ -1.02
YLR349WYLR349W GLK1P17709 500 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
YLR349WYLR349W CDC39P25655 2108 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
YLR349WYLR349W IME2P32581 645 aa8.67□□□□□ -1.02
YLR349WYLR349W MFT1P33441 392 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
YLR349WYLR349W NEO1P40527 1151 aa8.67□□□□□ -1.02
YLR349WYLR349W PAC11P40960 533 aa8.67□□□□□ -1.02
YLR349WYLR349W BUD32P53323 261 aa8.67□□□□□ -1.02
YLR349WYLR349W OAZ1Q02803 292 aa8.67□□□□□ -1.02
YLR349WYLR349W SPO20Q04359 397 aa8.67□□□□□ -1.02
YLR349WYLR349W BRR1Q99177 341 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
YLR349WYLR349W MSS116P15424 664 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
YLR349WYLR349W TRX2P22803 104 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
YLR349WYLR349W AMS1P22855 1083 aa8.66□□□□□ -1.02
YLR349WYLR349W YMC1P32331 307 aa8.66□□□□□ -1.02
YLR349WYLR349W CDC5P32562 705 aa8.66□□□□□ -1.02
YLR349WYLR349W YKL100CP34248 587 aa8.66□□□□□ -1.02
YLR349WYLR349W NUP120P35729 1037 aa8.66□□□□□ -1.02
YLR349WYLR349W TAT2P38967 592 aa8.66□□□□□ -1.02
YLR349WYLR349W EMP65P40085 556 aa8.66□□□□□ -1.02
YLR349WYLR349W PMT4P46971 762 aa8.66□□□□□ -1.02
YLR349WYLR349W TIM54P47045 478 aa8.66□□□□□ -1.02
YLR349WYLR349W HOL1P53389 586 aa8.66□□□□□ -1.02
YLR349WYLR349W YNL260CP53846 198 aa8.66□□□□□ -1.02
YLR349WYLR349W CYK3Q07533 885 aa8.66□□□□□ -1.02
YLR349WYLR349W YRA1Q12159 226 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
YLR349WYLR349W YMR030W-AQ3E760 96 aa8.66□□□□□ -1.02
YLR349WYLR349W COR1P07256 457 aa8.65□□□□□ -1.02
YLR349WYLR349W PHO2P07269 559 aa8.65□□□□□ -1.02
YLR349WYLR349W AAD3P25612 363 aa8.65□□□□□ -1.02
YLR349WYLR349W TPA1P40032 644 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
YLR349WYLR349W HOS4P40480 1083 aa8.65□□□□□ -1.02
YLR349WYLR349W CAB2P40506 365 aa8.65□□□□□ -1.02
YLR349WYLR349W SNO3P43544 222 aa8.65□□□□□ -1.02
YLR349WYLR349W YJR115WP47152 169 aa8.65□□□□□ -1.02
YLR349WYLR349W APT1P49435 187 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
YLR349WYLR349W ATG4P53867 494 aa8.65□□□□□ -1.02
YLR349WYLR349W COG6P53959 839 aa8.65□□□□□ -1.02
YLR349WYLR349W YPL245WQ12179 454 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
YLR349WYLR349W RPB2P08518 1224 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W CBP4P37267 147 aa8.64□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W CAJ1P39101 391 aa8.64□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W PRP39P39682 629 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W VPS52P39904 641 aa8.64□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W YEL020CP39994 560 aa8.64□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W UTP25P40498 721 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W YRB1P41920 201 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W SAE2P46946 345 aa8.64□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W BNA3P47039 444 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W STE24P47154 453 aa8.64□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W MAL11P53048 616 aa8.64□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W BSC5P53755 489 aa8.64□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W GLO4Q12320 285 aa8.64□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W SSC1P0CS90 654 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W GPA2P10823 449 aa8.63□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W SPO16P17122 198 aa8.63□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W MLS1P30952 554 aa8.63□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W RRN3P36070 627 aa8.63□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W OMA1P36163 345 aa8.63□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W ASC1P38011 319 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W DSS1P39112 969 aa8.63□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W LSM4P40070 187 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W ICE2P40499 491 aa8.63□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W SEC27P41811 889 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W GUS1P46655 708 aaKnown RBP RIP-Chip data8.63□□□□□ -1.03not detected
YLR349WYLR349W MPS1P54199 764 aa8.63□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W ATG21Q02887 496 aa8.63□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W YPS7Q06325 596 aa8.63□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W RAD34Q06665 692 aa8.63□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W BAG7Q12128 409 aa8.63□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W TRX3P25372 127 aa8.62□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W NUD1P32336 851 aa8.62□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W DCG1P32460 244 aa8.62□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W RTG1P32607 177 aa8.62□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W NFU1P32860 256 aa8.62□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W SPT20P50875 604 aa8.62□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W YDR541CQ03049 344 aa8.62□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W CSN9Q03981 162 aa8.62□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W YOR097CQ12274 175 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W MDY2Q12285 212 aa8.62□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W RPB4P20433 221 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W VPS33P20795 691 aa8.61□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W CRM1P30822 1084 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W KRE6P32486 720 aa8.61□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W NHP10Q03435 203 aa8.61□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W APC4Q04601 652 aa8.61□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W RIF2Q06208 395 aa8.61□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W HER1Q12276 1246 aa8.61□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W YPR064WQ12492 139 aa8.61□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W GUK1P15454 187 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W STP22P25604 385 aa8.6□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W PRM2P40534 656 aa8.6□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W MAD2P40958 196 aa8.6□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 47.7 ms