RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CYB5R4Q7L1T6 521 aa30.54■■■□□ 2.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP30.54■■■□□ 2.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYLIPQ8WY64 445 aa30.54■■■□□ 2.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHMLP26374 656 aa30.53■■■□□ 2.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TTLL4Q14679 1199 aa30.53■■■□□ 2.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COPS5Q92905 334 aa30.53■■■□□ 2.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TAAR1Q96RJ0 339 aa30.53■■■□□ 2.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYH6P13533 1939 aa30.52■■■□□ 2.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KPNA6O60684 536 aa30.52■■■□□ 2.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCL23P55773 120 aa30.52■■■□□ 2.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STAG2Q8N3U4 1231 aa30.52■■■□□ 2.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COL20A1Q9P218 1284 aa30.52■■■□□ 2.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP30.52■■■□□ 2.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A6NJR5 290 aa30.51■■■□□ 2.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KLRF2D3W0D1 207 aa30.51■■■□□ 2.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa30.51■■■□□ 2.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PTH1RQ03431 593 aa30.51■■■□□ 2.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TIFAQ96CG3 184 aa30.51■■■□□ 2.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RMDN3Q96TC7 470 aa30.51■■■□□ 2.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UNC80Q8N2C7 3258 aa30.5■■■□□ 2.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARIH2O95376 493 aa30.5■■■□□ 2.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FGBP02675 491 aa30.5■■■□□ 2.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CYP21A2P08686 494 aa30.5■■■□□ 2.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP30.5■■■□□ 2.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HERVK_113Q902F9 699 aa30.5■■■□□ 2.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IWS1Q96ST2 819 aa30.5■■■□□ 2.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AMNQ9BXJ7 453 aa30.5■■■□□ 2.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WNT8AQ9H1J5 351 aa30.5■■■□□ 2.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FOSL2P15408 326 aa30.49■■■□□ 2.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STXBP2Q15833 593 aa30.49■■■□□ 2.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NBPF20Q3BBV1 942 aa30.49■■■□□ 2.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM47CQ5HY64 1035 aa30.49■■■□□ 2.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC62Q6P9F0 684 aa30.49■■■□□ 2.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP30.49■■■□□ 2.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAD2L2Q9UI95 211 aa30.49■■■□□ 2.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDH23Q9H251 3354 aa30.49■■■□□ 2.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GRXCR1A8MXD5 290 aa30.48■■■□□ 2.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARHGEF16Q5VV41 709 aa30.48■■■□□ 2.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SEPT14Q6ZU15 432 aa30.48■■■□□ 2.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CUL9Q8IWT3 2517 aa30.47■■■□□ 2.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa30.47■■■□□ 2.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CFBP00751 764 aa30.47■■■□□ 2.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CYP2C9P11712 490 aa30.47■■■□□ 2.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GRIN2CQ14957 1233 aa30.47■■■□□ 2.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PBX4Q9BYU1 374 aa30.47■■■□□ 2.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF576Q9H609 170 aa30.47■■■□□ 2.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ERICH2A1L162 156 aa30.46■■■□□ 2.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP30.46■■■□□ 2.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PBX2P40425 430 aa30.46■■■□□ 2.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NFRKBQ6P4R8 1299 aa30.46■■■□□ 2.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OTOP2Q7RTS6 562 aa30.46■■■□□ 2.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MTMR8Q96EF0 704 aa30.46■■■□□ 2.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP30.46■■■□□ 2.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZBTB5O15062 677 aa30.45■■■□□ 2.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SGSM2O43147 1006 aa30.45■■■□□ 2.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GH1P01241 217 aa30.45■■■□□ 2.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LY6KQ17RY6 165 aa30.45■■■□□ 2.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SCLYQ96I15 445 aa30.45■■■□□ 2.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EYSQ5T1H1 3165 aa30.45■■■□□ 2.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 E7EWF7 191 aa30.44■■■□□ 2.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OPLAHO14841 1288 aa30.44■■■□□ 2.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HSD17B4P51659 736 aa30.44■■■□□ 2.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP30.44■■■□□ 2.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GRM4Q14833 912 aa30.44■■■□□ 2.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NCOA7Q8NI08 942 aa30.44■■■□□ 2.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa30.44■■■□□ 2.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AFG1LQ8WV93 481 aa30.44■■■□□ 2.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PXMP2Q9NR77 195 aa30.44■■■□□ 2.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa30.44■■■□□ 2.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP30.43■■■□□ 2.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GHRHRQ02643 423 aa30.43■■■□□ 2.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARHGAP1Q07960 439 aa30.43■■■□□ 2.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WTAPQ15007 396 aa30.43■■■□□ 2.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SART3Q15020 963 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MSRAQ9UJ68 235 aa30.43■■■□□ 2.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TAF6LQ9Y6J9 622 aa30.43■■■□□ 2.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa30.43■■■□□ 2.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NR3C2P08235 984 aa30.42■■■□□ 2.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MMP3P08254 477 aa30.42■■■□□ 2.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHMP4BP1P59074 171 aa30.42■■■□□ 2.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAB30Q15771 203 aa30.42■■■□□ 2.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHST3Q7LGC8 479 aa30.42■■■□□ 2.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HOMER1Q86YM7 354 aa30.42■■■□□ 2.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP30.42■■■□□ 2.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRAF1Q13077 416 aa30.41■■■□□ 2.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RIOX1Q9H6W3 641 aa30.41■■■□□ 2.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SENP2Q9HC62 589 aa30.41■■■□□ 2.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PFKMP08237 780 aa30.4■■■□□ 2.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC35G1Q2M3R5 365 aa30.4■■■□□ 2.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STOX1Q6ZVD7 989 aa30.4■■■□□ 2.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SAMD3Q8N6K7 520 aa30.4■■■□□ 2.46
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAP4K1Q92918 833 aa30.4■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms