RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 KIF28PB7ZC32 967 aa33.79■■■■□ 3
ECHS1-201ENST00000368547 FOSP01100 380 aaPredicted RBP33.79■■■■□ 3
ECHS1-201ENST00000368547 MCTP2Q6DN12 878 aa33.79■■■■□ 3
ECHS1-201ENST00000368547 SOCS4Q8WXH5 440 aa33.79■■■■□ 3
ECHS1-201ENST00000368547 MCM4P33991 863 aa33.78■■■■□ 3
ECHS1-201ENST00000368547 MAP2K5Q13163 448 aa33.78■■■■□ 3
ECHS1-201ENST00000368547 RMDN3Q96TC7 470 aa33.78■■■■□ 3
ECHS1-201ENST00000368547 ANO3Q9BYT9 981 aa33.78■■■■□ 3
ECHS1-201ENST00000368547 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa33.78■■■■□ 3
ECHS1-201ENST00000368547 BAG4O95429 457 aaKnown RBP33.77■■■■□ 3
ECHS1-201ENST00000368547 F13A1P00488 732 aa33.77■■■■□ 3
ECHS1-201ENST00000368547 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP33.77■■■■□ 32e-8■■□□□ 14.4
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF792Q3KQV3 632 aa33.77■■■■□ 3
ECHS1-201ENST00000368547 FERMT3Q86UX7 667 aa33.77■■■■□ 3
ECHS1-201ENST00000368547 USP6NLQ92738 828 aa33.77■■■■□ 3
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ECHS1-201ENST00000368547 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa33.76■■■■□ 3
ECHS1-201ENST00000368547 SOWAHBA6NEL2 793 aa33.76■■■■□ 3
ECHS1-201ENST00000368547 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP33.76■■■■□ 3
ECHS1-201ENST00000368547 KRT25Q7Z3Z0 450 aa33.76■■■■□ 3
ECHS1-201ENST00000368547 GABRQQ9UN88 632 aa33.76■■■■□ 3
ECHS1-201ENST00000368547 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP33.75■■■□□ 2.99
ECHS1-201ENST00000368547 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa33.75■■■□□ 2.99
ECHS1-201ENST00000368547 NOSTRINQ8IVI9 506 aa33.75■■■□□ 2.99
ECHS1-201ENST00000368547 DNERQ8NFT8 737 aa33.75■■■□□ 2.99
ECHS1-201ENST00000368547 FGD4Q96M96 766 aa33.75■■■□□ 2.99
ECHS1-201ENST00000368547 PXMP2Q9NR77 195 aa33.75■■■□□ 2.99
ECHS1-201ENST00000368547 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP33.75■■■□□ 2.99
ECHS1-201ENST00000368547 MYH7BA7E2Y1 1941 aa33.75■■■□□ 2.99
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ECHS1-201ENST00000368547 ARHGEF6Q15052 776 aa33.75■■■□□ 2.99
ECHS1-201ENST00000368547 ARHGEF16Q5VV41 709 aa33.75■■■□□ 2.99
ECHS1-201ENST00000368547 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP33.75■■■□□ 2.99
ECHS1-201ENST00000368547 SLC5A4Q9NY91 659 aa33.75■■■□□ 2.99
ECHS1-201ENST00000368547 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa33.74■■■□□ 2.99
ECHS1-201ENST00000368547 FAM205CA6NFA0 338 aa33.74■■■□□ 2.99
ECHS1-201ENST00000368547 DDX11L8A8MPP1 907 aa33.74■■■□□ 2.99
ECHS1-201ENST00000368547 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP33.74■■■□□ 2.99
ECHS1-201ENST00000368547 UBXN2AP68543 259 aa33.74■■■□□ 2.99
ECHS1-201ENST00000368547 PRKCZQ05513 592 aa33.74■■■□□ 2.99
ECHS1-201ENST00000368547 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP33.74■■■□□ 2.99
ECHS1-201ENST00000368547 NPLOC4Q8TAT6 608 aa33.74■■■□□ 2.99
ECHS1-201ENST00000368547 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP33.74■■■□□ 2.99
ECHS1-201ENST00000368547 RPTORQ8N122 1335 aa33.73■■■□□ 2.99
ECHS1-201ENST00000368547 GNRH1P01148 92 aa33.73■■■□□ 2.99
ECHS1-201ENST00000368547 CYP2B6P20813 491 aa33.73■■■□□ 2.99
ECHS1-201ENST00000368547 HOXD10P28358 340 aa33.73■■■□□ 2.99
ECHS1-201ENST00000368547 FLT3LGP49771 235 aa33.73■■■□□ 2.99
ECHS1-201ENST00000368547 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP33.73■■■□□ 2.99
ECHS1-201ENST00000368547 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP33.73■■■□□ 2.99
ECHS1-201ENST00000368547 EHMT1Q9H9B1 1298 aa33.73■■■□□ 2.99
ECHS1-201ENST00000368547 FRMPD4Q14CM0 1322 aa33.73■■■□□ 2.99
ECHS1-201ENST00000368547 HOXC6P09630 235 aa33.72■■■□□ 2.99
ECHS1-201ENST00000368547 SRRDQ9UH36 339 aa33.72■■■□□ 2.99
ECHS1-201ENST00000368547 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP33.72■■■□□ 2.99
ECHS1-201ENST00000368547 PTMSP20962 102 aa33.71■■■□□ 2.99
ECHS1-201ENST00000368547 TBCKQ8TEA7 893 aa33.71■■■□□ 2.99
ECHS1-201ENST00000368547 MAML3Q96JK9 1138 aa33.71■■■□□ 2.99
ECHS1-201ENST00000368547 APBA2Q99767 749 aa33.71■■■□□ 2.99
ECHS1-201ENST00000368547 PDCD2LQ9BRP1 358 aa33.71■■■□□ 2.99
ECHS1-201ENST00000368547 GOLGA6L22H0YM25 854 aa33.71■■■□□ 2.99
ECHS1-201ENST00000368547 SREBF1P36956 1147 aa33.71■■■□□ 2.99
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ECHS1-201ENST00000368547 RESTQ13127 1097 aa33.71■■■□□ 2.99
ECHS1-201ENST00000368547 PGM5Q15124 567 aa33.71■■■□□ 2.99
ECHS1-201ENST00000368547 INF2Q27J81 1249 aa33.71■■■□□ 2.99
ECHS1-201ENST00000368547 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP33.71■■■□□ 2.99
ECHS1-201ENST00000368547 LBX1P52954 281 aa33.7■■■□□ 2.99
ECHS1-201ENST00000368547 IL31RAQ8NI17 732 aa33.7■■■□□ 2.99
ECHS1-201ENST00000368547 MCM3APO60318 1980 aa33.69■■■□□ 2.98
ECHS1-201ENST00000368547 ARHGAP4P98171 946 aa33.69■■■□□ 2.98
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP33.69■■■□□ 2.98
ECHS1-201ENST00000368547 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP33.69■■■□□ 2.98
ECHS1-201ENST00000368547 BRAPQ7Z569 592 aa33.68■■■□□ 2.98
ECHS1-201ENST00000368547 CRYGNQ8WXF5 182 aa33.68■■■□□ 2.98
ECHS1-201ENST00000368547 IWS1Q96ST2 819 aa33.68■■■□□ 2.98
ECHS1-201ENST00000368547 TRIM17Q9Y577 477 aa33.68■■■□□ 2.98
ECHS1-201ENST00000368547 LRRC37A2A6NM11 1700 aa33.68■■■□□ 2.98
ECHS1-201ENST00000368547 NR3C2P08235 984 aa33.68■■■□□ 2.98
ECHS1-201ENST00000368547 OTOP1Q7RTM1 612 aa33.68■■■□□ 2.98
ECHS1-201ENST00000368547 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP33.67■■■□□ 2.98
ECHS1-201ENST00000368547 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP33.67■■■□□ 2.98
ECHS1-201ENST00000368547 CCL14Q16627 93 aa33.67■■■□□ 2.98
ECHS1-201ENST00000368547 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP33.67■■■□□ 2.98
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ECHS1-201ENST00000368547 EDNRBP24530 442 aa33.66■■■□□ 2.98
ECHS1-201ENST00000368547 NBR1Q14596 966 aa33.66■■■□□ 2.98
ECHS1-201ENST00000368547 PCNX4Q63HM2 1172 aa33.66■■■□□ 2.98
ECHS1-201ENST00000368547 FLRT1Q9NZU1 646 aa33.66■■■□□ 2.98
ECHS1-201ENST00000368547 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa33.65■■■□□ 2.98
ECHS1-201ENST00000368547 B4DLN1 442 aa33.65■■■□□ 2.98
ECHS1-201ENST00000368547 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP33.65■■■□□ 2.98
ECHS1-201ENST00000368547 NEK8Q86SG6 692 aa33.65■■■□□ 2.98
ECHS1-201ENST00000368547 VSIG10LQ86VR7 867 aa33.65■■■□□ 2.98
ECHS1-201ENST00000368547 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP33.65■■■□□ 2.98
ECHS1-201ENST00000368547 MYH15Q9Y2K3 1946 aa33.65■■■□□ 2.98
ECHS1-201ENST00000368547 EDIL3O43854 480 aa33.64■■■□□ 2.98
ECHS1-201ENST00000368547 CCND2P30279 289 aa33.64■■■□□ 2.98
ECHS1-201ENST00000368547 PDE4DQ08499 809 aa33.64■■■□□ 2.98
ECHS1-201ENST00000368547 IRF5Q13568 498 aa33.64■■■□□ 2.98
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