RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617444.4

SLC35E2B-205, Transcript of solute carrier family 35 member E2B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC35E2B, Length 6,283 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35E2B-205ENST00000617444 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa17.29■□□□□ 0.36
SLC35E2B-205ENST00000617444 APBB1O00213 710 aa17.29■□□□□ 0.36
SLC35E2B-205ENST00000617444 PDE4CQ08493 712 aa17.28■□□□□ 0.36
SLC35E2B-205ENST00000617444 KIAA2012Q0VF49 1180 aa17.27■□□□□ 0.36
SLC35E2B-205ENST00000617444 GGT6Q6P531 493 aa17.25■□□□□ 0.35
SLC35E2B-205ENST00000617444 CHMP3Q9Y3E7 222 aa17.24■□□□□ 0.35
SLC35E2B-205ENST00000617444 MORC1Q86VD1 984 aa17.24■□□□□ 0.35
SLC35E2B-205ENST00000617444 GBP4Q96PP9 640 aa17.24■□□□□ 0.35
SLC35E2B-205ENST00000617444 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa17.23■□□□□ 0.35
SLC35E2B-205ENST00000617444 PTMSP20962 102 aa17.22■□□□□ 0.35
SLC35E2B-205ENST00000617444 TMF1P82094 1093 aa17.22■□□□□ 0.35
SLC35E2B-205ENST00000617444 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
SLC35E2B-205ENST00000617444 TAF7LQ5H9L4 462 aa17.21■□□□□ 0.35
SLC35E2B-205ENST00000617444 GORABQ5T7V8 394 aa17.21■□□□□ 0.35
SLC35E2B-205ENST00000617444 DCAF11Q8TEB1 546 aa17.2■□□□□ 0.34
SLC35E2B-205ENST00000617444 SIN3AQ96ST3 1273 aa17.2■□□□□ 0.34
SLC35E2B-205ENST00000617444 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
SLC35E2B-205ENST00000617444 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
SLC35E2B-205ENST00000617444 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
SLC35E2B-205ENST00000617444 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
SLC35E2B-205ENST00000617444 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
SLC35E2B-205ENST00000617444 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
SLC35E2B-205ENST00000617444 VPS53Q5VIR6 699 aa17.16■□□□□ 0.34
SLC35E2B-205ENST00000617444 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
SLC35E2B-205ENST00000617444 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
SLC35E2B-205ENST00000617444 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
SLC35E2B-205ENST00000617444 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
SLC35E2B-205ENST00000617444 CCNB3Q8WWL7 1395 aa17.15■□□□□ 0.34
SLC35E2B-205ENST00000617444 ARID3AQ99856 593 aa17.15■□□□□ 0.34
SLC35E2B-205ENST00000617444 CEP162Q5TB80 1403 aa17.15■□□□□ 0.34
SLC35E2B-205ENST00000617444 GOLGA3Q08378 1498 aa17.14■□□□□ 0.33
SLC35E2B-205ENST00000617444 MSH5O43196 834 aa17.14■□□□□ 0.33
SLC35E2B-205ENST00000617444 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
SLC35E2B-205ENST00000617444 TPM4P67936 248 aa17.13■□□□□ 0.33
SLC35E2B-205ENST00000617444 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
SLC35E2B-205ENST00000617444 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
SLC35E2B-205ENST00000617444 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
SLC35E2B-205ENST00000617444 RASSF8Q8NHQ8 419 aa17.11■□□□□ 0.33
SLC35E2B-205ENST00000617444 EEA1Q15075 1411 aa17.11■□□□□ 0.33
SLC35E2B-205ENST00000617444 CCDC34Q96HJ3 373 aa17.11■□□□□ 0.33
SLC35E2B-205ENST00000617444 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa17.1■□□□□ 0.33
SLC35E2B-205ENST00000617444 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
SLC35E2B-205ENST00000617444 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
SLC35E2B-205ENST00000617444 CCER2I3L3R5 266 aa17.09■□□□□ 0.33
SLC35E2B-205ENST00000617444 CREBRFQ8IUR6 639 aa17.08■□□□□ 0.33
SLC35E2B-205ENST00000617444 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.33
SLC35E2B-205ENST00000617444 TOMM22Q9NS69 142 aa17.07■□□□□ 0.32
SLC35E2B-205ENST00000617444 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa17.06■□□□□ 0.32
SLC35E2B-205ENST00000617444 MARCH6O60337 910 aa17.06■□□□□ 0.32
SLC35E2B-205ENST00000617444 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
SLC35E2B-205ENST00000617444 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
SLC35E2B-205ENST00000617444 ITPRIPQ8IWB1 547 aa17.05■□□□□ 0.32
SLC35E2B-205ENST00000617444 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
SLC35E2B-205ENST00000617444 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
SLC35E2B-205ENST00000617444 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
SLC35E2B-205ENST00000617444 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP17.03■□□□□ 0.32
SLC35E2B-205ENST00000617444 GPATCH3Q96I76 525 aa17.03■□□□□ 0.32
SLC35E2B-205ENST00000617444 RCAN3Q9UKA8 241 aa17.03■□□□□ 0.32
SLC35E2B-205ENST00000617444 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa17.03■□□□□ 0.32
SLC35E2B-205ENST00000617444 EID1Q9Y6B2 187 aa17.03■□□□□ 0.32
SLC35E2B-205ENST00000617444 STK31Q9BXU1 1019 aa17.03■□□□□ 0.32
SLC35E2B-205ENST00000617444 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
SLC35E2B-205ENST00000617444 WWC1Q8IX03 1113 aa17.03■□□□□ 0.32
SLC35E2B-205ENST00000617444 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
SLC35E2B-205ENST00000617444 USP35Q9P2H5 1018 aa17.02■□□□□ 0.32
SLC35E2B-205ENST00000617444 KIF27Q86VH2 1401 aa17.02■□□□□ 0.32
SLC35E2B-205ENST00000617444 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa17.02■□□□□ 0.31
SLC35E2B-205ENST00000617444 KLHL34Q8N239 644 aa17.02■□□□□ 0.31
SLC35E2B-205ENST00000617444 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.31
SLC35E2B-205ENST00000617444 CHMP4AQ9BY43 222 aa17.01■□□□□ 0.31
SLC35E2B-205ENST00000617444 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
SLC35E2B-205ENST00000617444 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa17■□□□□ 0.31
SLC35E2B-205ENST00000617444 CEP89Q96ST8 783 aa17■□□□□ 0.31
SLC35E2B-205ENST00000617444 NUTM2FA1L443 756 aa17■□□□□ 0.31
SLC35E2B-205ENST00000617444 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
SLC35E2B-205ENST00000617444 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
SLC35E2B-205ENST00000617444 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa17■□□□□ 0.31
SLC35E2B-205ENST00000617444 SLC4A10Q6U841 1118 aa16.99■□□□□ 0.31
SLC35E2B-205ENST00000617444 RAD21O60216 631 aa16.98■□□□□ 0.31
SLC35E2B-205ENST00000617444 TPM3P06753 285 aa16.98■□□□□ 0.31
SLC35E2B-205ENST00000617444 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
SLC35E2B-205ENST00000617444 FBXO3Q9UK99 471 aa16.98■□□□□ 0.31
SLC35E2B-205ENST00000617444 EVA1CP58658 441 aa16.98■□□□□ 0.31
SLC35E2B-205ENST00000617444 HDAC5Q9UQL6 1122 aa16.97■□□□□ 0.31
SLC35E2B-205ENST00000617444 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa16.97■□□□□ 0.31
SLC35E2B-205ENST00000617444 AMPHP49418 695 aa16.97■□□□□ 0.31
SLC35E2B-205ENST00000617444 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
SLC35E2B-205ENST00000617444 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
SLC35E2B-205ENST00000617444 HMMRO75330 724 aa16.96■□□□□ 0.31
SLC35E2B-205ENST00000617444 TNIKQ9UKE5 1360 aa16.95■□□□□ 0.3
SLC35E2B-205ENST00000617444 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
SLC35E2B-205ENST00000617444 TRIM34Q9BYJ4 488 aa16.95■□□□□ 0.3
SLC35E2B-205ENST00000617444 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa16.94■□□□□ 0.3
SLC35E2B-205ENST00000617444 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa16.94■□□□□ 0.3
SLC35E2B-205ENST00000617444 PHF14O94880 888 aa16.94■□□□□ 0.3
SLC35E2B-205ENST00000617444 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
SLC35E2B-205ENST00000617444 FBXW7Q969H0 707 aa16.93■□□□□ 0.3
SLC35E2B-205ENST00000617444 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
SLC35E2B-205ENST00000617444 SMC4Q9NTJ3 1288 aa16.92■□□□□ 0.3
SLC35E2B-205ENST00000617444 RALBP1Q15311 655 aa16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.5 ms