RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 TEX35Q5T0J7 233 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-209ENST00000612229 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PTPRT-209ENST00000612229 PRM3Q9NNZ6 103 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRT-209ENST00000612229 HDAC5Q9UQL6 1122 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRT-209ENST00000612229 CARD11Q9BXL7 1154 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRT-209ENST00000612229 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PTPRT-209ENST00000612229 FHAD1B1AJZ9 1412 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRT-209ENST00000612229 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
PTPRT-209ENST00000612229 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
PTPRT-209ENST00000612229 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
PTPRT-209ENST00000612229 NACADO15069 1562 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRT-209ENST00000612229 DDX11L8A8MPP1 907 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRT-209ENST00000612229 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRT-209ENST00000612229 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
PTPRT-209ENST00000612229 TPM2P07951 284 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRT-209ENST00000612229 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
PTPRT-209ENST00000612229 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa8.71□□□□□ -1.01
PTPRT-209ENST00000612229 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
PTPRT-209ENST00000612229 DCTN1Q14203 1278 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRT-209ENST00000612229 RDXP35241 583 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
PTPRT-209ENST00000612229 CCNB3Q8WWL7 1395 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRT-209ENST00000612229 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRT-209ENST00000612229 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRT-209ENST00000612229 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.02
PTPRT-209ENST00000612229 CAGE1Q8TC20 777 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRT-209ENST00000612229 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRT-209ENST00000612229 TPM1P09493 284 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRT-209ENST00000612229 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-209ENST00000612229 KIF27Q86VH2 1401 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-209ENST00000612229 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-209ENST00000612229 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-209ENST00000612229 GPATCH3Q96I76 525 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-209ENST00000612229 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-209ENST00000612229 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-209ENST00000612229 PHLDB1Q86UU1 1377 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-209ENST00000612229 ACBD3Q9H3P7 528 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRT-209ENST00000612229 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRT-209ENST00000612229 RCAN3Q9UKA8 241 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRT-209ENST00000612229 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRT-209ENST00000612229 HDGFP51858 240 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRT-209ENST00000612229 MYO6Q9UM54 1294 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRT-209ENST00000612229 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRT-209ENST00000612229 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRT-209ENST00000612229 TMF1P82094 1093 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRT-209ENST00000612229 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRT-209ENST00000612229 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRT-209ENST00000612229 NEXNQ0ZGT2 675 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRT-209ENST00000612229 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRT-209ENST00000612229 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRT-209ENST00000612229 RALBP1Q15311 655 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRT-209ENST00000612229 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRT-209ENST00000612229 SETD5Q9C0A6 1442 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRT-209ENST00000612229 CCDC191Q8NCU4 936 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRT-209ENST00000612229 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
PTPRT-209ENST00000612229 NEUROD2Q15784 382 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRT-209ENST00000612229 C14orf37Q86TY3 774 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRT-209ENST00000612229 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP8.65□□□□□ -1.03
PTPRT-209ENST00000612229 ARID3AQ99856 593 aa8.65□□□□□ -1.03
PTPRT-209ENST00000612229 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
PTPRT-209ENST00000612229 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.03
PTPRT-209ENST00000612229 AK7Q96M32 723 aa8.65□□□□□ -1.03
PTPRT-209ENST00000612229 GSE1Q14687 1217 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRT-209ENST00000612229 DCAF8L1A6NGE4 600 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRT-209ENST00000612229 FANCIQ9NVI1 1328 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRT-209ENST00000612229 KIF16BQ96L93 1317 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRT-209ENST00000612229 STK11IPQ8N1F8 1099 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRT-209ENST00000612229 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
PTPRT-209ENST00000612229 ST18O60284 1047 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRT-209ENST00000612229 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRT-209ENST00000612229 APPP05067 770 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRT-209ENST00000612229 KANK1Q14678 1352 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRT-209ENST00000612229 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
PTPRT-209ENST00000612229 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
PTPRT-209ENST00000612229 PLEKHD1A6NEE1 506 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRT-209ENST00000612229 RGL3Q3MIN7 710 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRT-209ENST00000612229 A0A0G2JS52 829 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRT-209ENST00000612229 PDE3BQ13370 1112 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRT-209ENST00000612229 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRT-209ENST00000612229 VSIG10Q8N0Z9 540 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRT-209ENST00000612229 INCENPQ9NQS7 918 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRT-209ENST00000612229 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
PTPRT-209ENST00000612229 MAP7D2Q96T17 732 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRT-209ENST00000612229 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
PTPRT-209ENST00000612229 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
PTPRT-209ENST00000612229 RUFY1Q96T51 708 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRT-209ENST00000612229 ERCC6Q03468 1493 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
PTPRT-209ENST00000612229 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
PTPRT-209ENST00000612229 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
PTPRT-209ENST00000612229 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
PTPRT-209ENST00000612229 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRT-209ENST00000612229 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
PTPRT-209ENST00000612229 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
PTPRT-209ENST00000612229 CCDC66A2RUB6 948 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRT-209ENST00000612229 ZBTB7CA1YPR0 619 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRT-209ENST00000612229 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-209ENST00000612229 HSP90B2PQ58FF3 399 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-209ENST00000612229 CCDC173Q0VFZ6 552 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-209ENST00000612229 POGKQ9P215 609 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRT-209ENST00000612229 VPS8Q8N3P4 1428 aa8.59□□□□□ -1.03
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