RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543447.5

ATE1-209, Transcript of arginyltransferase 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATE1, Length 4,826 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1-209ENST00000543447 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.22■□□□□ 0.99
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ATE1-209ENST00000543447 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
ATE1-209ENST00000543447 CUL7Q14999 1698 aa21.19■□□□□ 0.98
ATE1-209ENST00000543447 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
ATE1-209ENST00000543447 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
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ATE1-209ENST00000543447 BCL11AQ9H165 835 aa20.89■□□□□ 0.94
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ATE1-209ENST00000543447 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
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ATE1-209ENST00000543447 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa20.88■□□□□ 0.93
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ATE1-209ENST00000543447 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
ATE1-209ENST00000543447 MORC1Q86VD1 984 aa20.73■□□□□ 0.91
ATE1-209ENST00000543447 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP20.71■□□□□ 0.91
ATE1-209ENST00000543447 ARHGEF11O15085 1522 aa20.71■□□□□ 0.91
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ATE1-209ENST00000543447 DDRGK1Q96HY6 314 aa20.7■□□□□ 0.9
ATE1-209ENST00000543447 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
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