RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497115.5

ETV1-223, Transcript of ETS variant 1, human

TSL 4

Gene ETV1, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ETV1-223	ENST00000497115	PPP1R15B	Q5SWA1	713 aa		12.7	□□□□□ -0.38
ETV1-223	ENST00000497115	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		12.7	□□□□□ -0.38
ETV1-223	ENST00000497115	OCEL1	Q9H607	264 aa		12.69	□□□□□ -0.38
ETV1-223	ENST00000497115	TMEM121B	Q9BXQ6	578 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
ETV1-223	ENST00000497115	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		12.65	□□□□□ -0.38
ETV1-223	ENST00000497115	TMC2	Q8TDI7	906 aa		12.63	□□□□□ -0.39
ETV1-223	ENST00000497115	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		12.63	□□□□□ -0.39
ETV1-223	ENST00000497115	FOXK1	P85037	733 aa		12.62	□□□□□ -0.39
ETV1-223	ENST00000497115	GABBR2	O75899	941 aa		12.61	□□□□□ -0.39
ETV1-223	ENST00000497115	PLCG2	P16885	1265 aa		12.61	□□□□□ -0.39
ETV1-223	ENST00000497115	DSG2	Q14126	1118 aa		12.61	□□□□□ -0.39
ETV1-223	ENST00000497115		G3V3G9	751 aa		12.6	□□□□□ -0.39
ETV1-223	ENST00000497115	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	12.58	□□□□□ -0.4
ETV1-223	ENST00000497115	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	12.58	□□□□□ -0.4
ETV1-223	ENST00000497115	KIF3C	O14782	793 aa		12.57	□□□□□ -0.4
ETV1-223	ENST00000497115	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		12.57	□□□□□ -0.4
ETV1-223	ENST00000497115	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	12.56	□□□□□ -0.4
ETV1-223	ENST00000497115	PDIA6	Q15084	440 aa		12.55	□□□□□ -0.4
ETV1-223	ENST00000497115	C2orf72	A6NCS6	295 aa		12.53	□□□□□ -0.4
ETV1-223	ENST00000497115	DPYSL4	O14531	572 aa		12.53	□□□□□ -0.4
ETV1-223	ENST00000497115	DCBLD2	Q96PD2	775 aa		12.53	□□□□□ -0.4
ETV1-223	ENST00000497115	PLPP6	Q8IY26	295 aa		12.52	□□□□□ -0.41
ETV1-223	ENST00000497115	SLC39A7	Q92504	469 aa		12.51	□□□□□ -0.41
ETV1-223	ENST00000497115	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
ETV1-223	ENST00000497115	SEC24B	O95487	1268 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ETV1-223	ENST00000497115	MLLT3	P42568	568 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
ETV1-223	ENST00000497115	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
ETV1-223	ENST00000497115	ZMYND10	O75800	440 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ETV1-223	ENST00000497115	C7	P10643	843 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ETV1-223	ENST00000497115	POTEH	Q6S545	545 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ETV1-223	ENST00000497115	TMEM92	Q6UXU6	159 aa		12.44	□□□□□ -0.42
ETV1-223	ENST00000497115	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		12.42	□□□□□ -0.42
ETV1-223	ENST00000497115	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		12.42	□□□□□ -0.42
ETV1-223	ENST00000497115	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		12.42	□□□□□ -0.42
ETV1-223	ENST00000497115	POTEF	A5A3E0	1075 aa		12.41	□□□□□ -0.42
ETV1-223	ENST00000497115	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	12.41	□□□□□ -0.42
ETV1-223	ENST00000497115	MAP3K9	P80192	1104 aa		12.4	□□□□□ -0.42
ETV1-223	ENST00000497115	OXER1	Q8TDS5	423 aa		12.4	□□□□□ -0.42
ETV1-223	ENST00000497115	SLC24A3	Q9HC58	644 aa		12.4	□□□□□ -0.42
ETV1-223	ENST00000497115	METRN	Q9UJH8	293 aa		12.4	□□□□□ -0.42
ETV1-223	ENST00000497115	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	12.39	□□□□□ -0.43
ETV1-223	ENST00000497115	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		12.35	□□□□□ -0.43
ETV1-223	ENST00000497115	POTEI	P0CG38	1075 aa		12.34	□□□□□ -0.43
ETV1-223	ENST00000497115	PTGER2	P43116	358 aa		12.34	□□□□□ -0.43
ETV1-223	ENST00000497115	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	12.34	□□□□□ -0.43
ETV1-223	ENST00000497115	TBC1D12	O60347	775 aa		12.31	□□□□□ -0.44
ETV1-223	ENST00000497115	GPR37	O15354	613 aa		12.3	□□□□□ -0.44
ETV1-223	ENST00000497115	NEUROD2	Q15784	382 aa		12.3	□□□□□ -0.44
ETV1-223	ENST00000497115	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	12.3	□□□□□ -0.44
ETV1-223	ENST00000497115	PTCD2	Q8WV60	388 aa	Known RBP	12.3	□□□□□ -0.44
ETV1-223	ENST00000497115	AK7	Q96M32	723 aa		12.3	□□□□□ -0.44
ETV1-223	ENST00000497115	SLC34A2	O95436	690 aa		12.29	□□□□□ -0.44
ETV1-223	ENST00000497115	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		12.28	□□□□□ -0.44
ETV1-223	ENST00000497115	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	12.27	□□□□□ -0.45
ETV1-223	ENST00000497115	EVI5	O60447	810 aa		12.26	□□□□□ -0.45
ETV1-223	ENST00000497115	OSBP	P22059	807 aa		12.26	□□□□□ -0.45
ETV1-223	ENST00000497115	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	12.25	□□□□□ -0.45
ETV1-223	ENST00000497115	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		12.25	□□□□□ -0.45
ETV1-223	ENST00000497115	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	12.23	□□□□□ -0.45
ETV1-223	ENST00000497115	NUTM2F	A1L443	756 aa		12.21	□□□□□ -0.45
ETV1-223	ENST00000497115	DDX12P	Q92771	950 aa		12.21	□□□□□ -0.45
ETV1-223	ENST00000497115	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	12.21	□□□□□ -0.45
ETV1-223	ENST00000497115	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	12.18	□□□□□ -0.46
ETV1-223	ENST00000497115	TRIM66	O15016	1216 aa		12.18	□□□□□ -0.46
ETV1-223	ENST00000497115	FCHSD2	O94868	740 aa		12.17	□□□□□ -0.46
ETV1-223	ENST00000497115	MAP2K5	Q13163	448 aa		12.17	□□□□□ -0.46
ETV1-223	ENST00000497115	HIC1	Q14526	733 aa		12.17	□□□□□ -0.46
ETV1-223	ENST00000497115	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		12.17	□□□□□ -0.46
ETV1-223	ENST00000497115	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	12.17	□□□□□ -0.46
ETV1-223	ENST00000497115	GNPAT	O15228	680 aa		12.16	□□□□□ -0.46
ETV1-223	ENST00000497115	EPAS1	Q99814	870 aa		12.14	□□□□□ -0.47
ETV1-223	ENST00000497115	PHF14	O94880	888 aa		12.13	□□□□□ -0.47
ETV1-223	ENST00000497115	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	12.13	□□□□□ -0.47
ETV1-223	ENST00000497115	PDE4D	Q08499	809 aa		12.13	□□□□□ -0.47
ETV1-223	ENST00000497115	PCDHGA4	Q9Y5G9	962 aa		12.12	□□□□□ -0.47
ETV1-223	ENST00000497115	IRF6	O14896	467 aa		12.11	□□□□□ -0.47
ETV1-223	ENST00000497115	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	12.11	□□□□□ -0.47
ETV1-223	ENST00000497115	PTGDR	Q13258	359 aa		12.11	□□□□□ -0.47
ETV1-223	ENST00000497115	CCDC102A	Q96A19	550 aa		12.11	□□□□□ -0.47
ETV1-223	ENST00000497115	KDM4C	Q9H3R0	1056 aa		12.1	□□□□□ -0.47
ETV1-223	ENST00000497115	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
ETV1-223	ENST00000497115	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ETV1-223	ENST00000497115	AMHR2	Q16671	573 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ETV1-223	ENST00000497115	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		12.08	□□□□□ -0.48
ETV1-223	ENST00000497115	JPH4	Q96JJ6	628 aa		12.06	□□□□□ -0.48
ETV1-223	ENST00000497115	PCDHGA10	Q9Y5H3	936 aa		12.06	□□□□□ -0.48
ETV1-223	ENST00000497115	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		12.05	□□□□□ -0.48
ETV1-223	ENST00000497115	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		12.05	□□□□□ -0.48
ETV1-223	ENST00000497115	FBXW7	Q969H0	707 aa		12.05	□□□□□ -0.48
ETV1-223	ENST00000497115	FECH	P22830	423 aa		12.04	□□□□□ -0.48
ETV1-223	ENST00000497115	MAP3K7	O43318	606 aa		12.03	□□□□□ -0.48
ETV1-223	ENST00000497115	DOK7	Q18PE1	504 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ETV1-223	ENST00000497115	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ETV1-223	ENST00000497115	NPDC1	Q9NQX5	325 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
ETV1-223	ENST00000497115	POTEJ	P0CG39	1038 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ETV1-223	ENST00000497115	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ETV1-223	ENST00000497115	FOSB	P53539	338 aa		12	□□□□□ -0.49
ETV1-223	ENST00000497115	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
ETV1-223	ENST00000497115	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		11.99	□□□□□ -0.49
ETV1-223	ENST00000497115	RIMBP2	O15034	1052 aa		11.98	□□□□□ -0.49

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