RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467683.5

UBE2Q1-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

TSL 5

Gene UBE2Q1, Length 370 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-202ENST00000467683 SCAPERQ9BY12 1400 aa19.27■□□□□ 0.68
UBE2Q1-202ENST00000467683 C9orf84Q5VXU9 1444 aa19.25■□□□□ 0.67
UBE2Q1-202ENST00000467683 FMN1Q68DA7 1419 aa19.25■□□□□ 0.67
UBE2Q1-202ENST00000467683 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa19.25■□□□□ 0.67
UBE2Q1-202ENST00000467683 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
UBE2Q1-202ENST00000467683 ATP10AO60312 1499 aa19.25■□□□□ 0.67
UBE2Q1-202ENST00000467683 HSPA2P54652 639 aa19.25■□□□□ 0.67
UBE2Q1-202ENST00000467683 KIF14Q15058 1648 aa19.23■□□□□ 0.67
UBE2Q1-202ENST00000467683 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa19.22■□□□□ 0.67
UBE2Q1-202ENST00000467683 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP19.22■□□□□ 0.67
UBE2Q1-202ENST00000467683 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa19.22■□□□□ 0.67
UBE2Q1-202ENST00000467683 PLPPR3Q6T4P5 718 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2Q1-202ENST00000467683 MLECQ14165 292 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2Q1-202ENST00000467683 KDM5CP41229 1560 aa19.19■□□□□ 0.66
UBE2Q1-202ENST00000467683 CERKQ8TCT0 537 aa19.18■□□□□ 0.66
UBE2Q1-202ENST00000467683 ARHGAP5Q13017 1502 aa19.16■□□□□ 0.66
UBE2Q1-202ENST00000467683 REREQ9P2R6 1566 aa19.16■□□□□ 0.66
UBE2Q1-202ENST00000467683 CLIP1P30622 1438 aa19.16■□□□□ 0.66
UBE2Q1-202ENST00000467683 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
UBE2Q1-202ENST00000467683 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa19.15■□□□□ 0.66
UBE2Q1-202ENST00000467683 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
UBE2Q1-202ENST00000467683 STRCQ7RTU9 1775 aa19.13■□□□□ 0.65
UBE2Q1-202ENST00000467683 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa19.12■□□□□ 0.65
UBE2Q1-202ENST00000467683 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa19.12■□□□□ 0.65
UBE2Q1-202ENST00000467683 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa19.12■□□□□ 0.65
UBE2Q1-202ENST00000467683 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa19.12■□□□□ 0.65
UBE2Q1-202ENST00000467683 UBTFP17480 764 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
UBE2Q1-202ENST00000467683 DMRT2Q9Y5R5 561 aa19.12■□□□□ 0.65
UBE2Q1-202ENST00000467683 PREX2Q70Z35 1606 aa19.1■□□□□ 0.65
UBE2Q1-202ENST00000467683 MLH3Q9UHC1 1453 aa19.09■□□□□ 0.65
UBE2Q1-202ENST00000467683 C3P01024 1663 aa19.08■□□□□ 0.65
UBE2Q1-202ENST00000467683 ABCA6Q8N139 1617 aa19.08■□□□□ 0.65
UBE2Q1-202ENST00000467683 AGLP35573 1532 aa19.07■□□□□ 0.64
UBE2Q1-202ENST00000467683 ITSN2Q9NZM3 1697 aa19.07■□□□□ 0.64
UBE2Q1-202ENST00000467683 AFAP1Q8N556 730 aa19.06■□□□□ 0.64
UBE2Q1-202ENST00000467683 ABCC1P33527 1531 aa19.05■□□□□ 0.64
UBE2Q1-202ENST00000467683 CCDC18Q5T9S5 1454 aa19.05■□□□□ 0.64
UBE2Q1-202ENST00000467683 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP19.05■□□□□ 0.64
UBE2Q1-202ENST00000467683 MYT1LQ9UL68 1186 aa19.05■□□□□ 0.64
UBE2Q1-202ENST00000467683 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa19.02■□□□□ 0.63
UBE2Q1-202ENST00000467683 PTPRTO14522 1441 aa19.01■□□□□ 0.63
UBE2Q1-202ENST00000467683 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
UBE2Q1-202ENST00000467683 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa19.01■□□□□ 0.63
UBE2Q1-202ENST00000467683 CNTLNQ9NXG0 1405 aa19■□□□□ 0.63
UBE2Q1-202ENST00000467683 MROH2AA6NES4 1674 aa18.99■□□□□ 0.63
UBE2Q1-202ENST00000467683 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa18.99■□□□□ 0.63
UBE2Q1-202ENST00000467683 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa18.99■□□□□ 0.63
UBE2Q1-202ENST00000467683 EHMT2Q96KQ7 1210 aa18.97■□□□□ 0.63
UBE2Q1-202ENST00000467683 IQSEC2Q5JU85 1478 aa18.96■□□□□ 0.63
UBE2Q1-202ENST00000467683 NPATQ14207 1427 aa18.93■□□□□ 0.62
UBE2Q1-202ENST00000467683 FYCO1Q9BQS8 1478 aa18.93■□□□□ 0.62
UBE2Q1-202ENST00000467683 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa18.93■□□□□ 0.62
UBE2Q1-202ENST00000467683 DISP3Q9P2K9 1392 aa18.93■□□□□ 0.62
UBE2Q1-202ENST00000467683 NCOA1Q15788 1441 aa18.92■□□□□ 0.62
UBE2Q1-202ENST00000467683 LTBP4Q8N2S1 1624 aa18.91■□□□□ 0.62
UBE2Q1-202ENST00000467683 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa18.89■□□□□ 0.61
UBE2Q1-202ENST00000467683 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
UBE2Q1-202ENST00000467683 SYCP2Q9BX26 1530 aa18.88■□□□□ 0.61
UBE2Q1-202ENST00000467683 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa18.88■□□□□ 0.61
UBE2Q1-202ENST00000467683 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
UBE2Q1-202ENST00000467683 ATP7AQ04656 1500 aa18.86■□□□□ 0.61
UBE2Q1-202ENST00000467683 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa18.86■□□□□ 0.61
UBE2Q1-202ENST00000467683 PLXNC1O60486 1568 aa18.85■□□□□ 0.61
UBE2Q1-202ENST00000467683 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
UBE2Q1-202ENST00000467683 CHIC1Q5VXU3 224 aa18.85■□□□□ 0.61
UBE2Q1-202ENST00000467683 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
UBE2Q1-202ENST00000467683 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa18.84■□□□□ 0.61
UBE2Q1-202ENST00000467683 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
UBE2Q1-202ENST00000467683 MYO3AQ8NEV4 1616 aa18.84■□□□□ 0.61
UBE2Q1-202ENST00000467683 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
UBE2Q1-202ENST00000467683 ZMYM3Q14202 1370 aa18.83■□□□□ 0.61
UBE2Q1-202ENST00000467683 SOCS7O14512 581 aa18.83■□□□□ 0.6
UBE2Q1-202ENST00000467683 ADGBQ8N7X0 1667 aa18.82■□□□□ 0.6
UBE2Q1-202ENST00000467683 PLA2R1Q13018 1463 aa18.82■□□□□ 0.6
UBE2Q1-202ENST00000467683 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP18.81■□□□□ 0.6
UBE2Q1-202ENST00000467683 A2MP01023 1474 aa18.8■□□□□ 0.6
UBE2Q1-202ENST00000467683 ILDR2Q71H61 639 aa18.8■□□□□ 0.6
UBE2Q1-202ENST00000467683 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
UBE2Q1-202ENST00000467683 PKD2Q13563 968 aa18.77■□□□□ 0.6
UBE2Q1-202ENST00000467683 PPP6R1Q9UPN7 881 aa18.77■□□□□ 0.6
UBE2Q1-202ENST00000467683 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP18.76■□□□□ 0.59
UBE2Q1-202ENST00000467683 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
UBE2Q1-202ENST00000467683 CCNB3Q8WWL7 1395 aa18.76■□□□□ 0.59
UBE2Q1-202ENST00000467683 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
UBE2Q1-202ENST00000467683 PTPRKQ15262 1439 aa18.74■□□□□ 0.59
UBE2Q1-202ENST00000467683 MTUS2Q5JR59 1369 aa18.72■□□□□ 0.59
UBE2Q1-202ENST00000467683 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa18.72■□□□□ 0.59
UBE2Q1-202ENST00000467683 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
UBE2Q1-202ENST00000467683 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
UBE2Q1-202ENST00000467683 FAM135AQ9P2D6 1515 aa18.7■□□□□ 0.58
UBE2Q1-202ENST00000467683 TIAM1Q13009 1591 aa18.7■□□□□ 0.58
UBE2Q1-202ENST00000467683 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa18.69■□□□□ 0.58
UBE2Q1-202ENST00000467683 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa18.69■□□□□ 0.58
UBE2Q1-202ENST00000467683 GGT6Q6P531 493 aa18.69■□□□□ 0.58
UBE2Q1-202ENST00000467683 A2ML1A8K2U0 1454 aa18.69■□□□□ 0.58
UBE2Q1-202ENST00000467683 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
UBE2Q1-202ENST00000467683 UBAP1LF5GYI3 381 aa18.67■□□□□ 0.58
UBE2Q1-202ENST00000467683 MBD5Q9P267 1494 aa18.65■□□□□ 0.58
UBE2Q1-202ENST00000467683 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
UBE2Q1-202ENST00000467683 CEP162Q5TB80 1403 aa18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.9 ms