RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412307.3

C10orf55-202, Transcript of chromosome 10 open reading frame 55, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene C10orf55, Length 2,360 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55-202ENST00000412307 ABCC10Q5T3U5 1492 aa30.72■■■□□ 2.51
C10orf55-202ENST00000412307 KCNH8Q96L42 1107 aa30.72■■■□□ 2.51
C10orf55-202ENST00000412307 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa30.7■■■□□ 2.51
C10orf55-202ENST00000412307 NEUROD1Q13562 356 aa30.69■■■□□ 2.5
C10orf55-202ENST00000412307 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP30.66■■■□□ 2.5
C10orf55-202ENST00000412307 ITSN2Q9NZM3 1697 aa30.66■■■□□ 2.5
C10orf55-202ENST00000412307 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa30.66■■■□□ 2.5
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C10orf55-202ENST00000412307 TRIM52Q96A61 297 aa30.61■■■□□ 2.49
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C10orf55-202ENST00000412307 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP30.57■■■□□ 2.48
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C10orf55-202ENST00000412307 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa30.55■■■□□ 2.48
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C10orf55-202ENST00000412307 GCC2Q8IWJ2 1684 aa30.54■■■□□ 2.48
C10orf55-202ENST00000412307 KDM5BQ9UGL1 1544 aa30.53■■■□□ 2.48
C10orf55-202ENST00000412307 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP30.52■■■□□ 2.48
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C10orf55-202ENST00000412307 TTC37Q6PGP7 1564 aa30.52■■■□□ 2.48
C10orf55-202ENST00000412307 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa30.49■■■□□ 2.47
C10orf55-202ENST00000412307 NCOA1Q15788 1441 aa30.47■■■□□ 2.47
C10orf55-202ENST00000412307 FOXD1Q16676 465 aa30.45■■■□□ 2.47
C10orf55-202ENST00000412307 MPHOSPH9Q99550 1183 aa30.43■■■□□ 2.46
C10orf55-202ENST00000412307 PREX2Q70Z35 1606 aa30.42■■■□□ 2.46
C10orf55-202ENST00000412307 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa30.42■■■□□ 2.46
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C10orf55-202ENST00000412307 ARHGAP5Q13017 1502 aa30.41■■■□□ 2.46
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C10orf55-202ENST00000412307 TSPY10P0CW01 314 aa30.41■■■□□ 2.46
C10orf55-202ENST00000412307 MBD5Q9P267 1494 aa30.39■■■□□ 2.46
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C10orf55-202ENST00000412307 C9orf84Q5VXU9 1444 aa30.37■■■□□ 2.45
C10orf55-202ENST00000412307 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa30.37■■■□□ 2.45
C10orf55-202ENST00000412307 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP30.36■■■□□ 2.45
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C10orf55-202ENST00000412307 ADGBQ8N7X0 1667 aa30.33■■■□□ 2.45
C10orf55-202ENST00000412307 MYO5CQ9NQX4 1742 aa30.31■■■□□ 2.44
C10orf55-202ENST00000412307 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa30.31■■■□□ 2.44
C10orf55-202ENST00000412307 SYCP2Q9BX26 1530 aa30.31■■■□□ 2.44
C10orf55-202ENST00000412307 PLCH2O75038 1416 aa30.3■■■□□ 2.44
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C10orf55-202ENST00000412307 WDR7Q9Y4E6 1490 aa30.28■■■□□ 2.44
C10orf55-202ENST00000412307 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa30.27■■■□□ 2.44
C10orf55-202ENST00000412307 CCDC141Q6ZP82 1450 aa30.27■■■□□ 2.44
C10orf55-202ENST00000412307 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa30.26■■■□□ 2.43
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C10orf55-202ENST00000412307 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa30.25■■■□□ 2.43
C10orf55-202ENST00000412307 SHANK2Q9UPX8 1470 aa30.25■■■□□ 2.43
C10orf55-202ENST00000412307 ASXL2Q76L83 1435 aa30.25■■■□□ 2.43
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C10orf55-202ENST00000412307 KIF15Q9NS87 1388 aa30.24■■■□□ 2.43
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C10orf55-202ENST00000412307 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa30.22■■■□□ 2.43
C10orf55-202ENST00000412307 MIER1Q8N108 512 aa30.21■■■□□ 2.43
C10orf55-202ENST00000412307 PZPP20742 1482 aa30.18■■■□□ 2.42
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C10orf55-202ENST00000412307 AFAP1Q8N556 730 aa30.14■■■□□ 2.42
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C10orf55-202ENST00000412307 NUP155O75694 1391 aa30.13■■■□□ 2.41
C10orf55-202ENST00000412307 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa30.13■■■□□ 2.41
C10orf55-202ENST00000412307 PKD2Q13563 968 aa30.12■■■□□ 2.41
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C10orf55-202ENST00000412307 ABCA9Q8IUA7 1624 aa30.05■■■□□ 2.4
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C10orf55-202ENST00000412307 ARAP3Q8WWN8 1544 aa29.97■■■□□ 2.39
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C10orf55-202ENST00000412307 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.93■■■□□ 2.38
C10orf55-202ENST00000412307 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.93■■■□□ 2.38
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C10orf55-202ENST00000412307 NBPF8Q3BBV2 869 aa29.85■■■□□ 2.37
C10orf55-202ENST00000412307 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa29.83■■■□□ 2.37
C10orf55-202ENST00000412307 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.82■■■□□ 2.36
C10orf55-202ENST00000412307 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa29.8■■■□□ 2.36
C10orf55-202ENST00000412307 ERBINQ96RT1 1412 aa29.8■■■□□ 2.36
C10orf55-202ENST00000412307 UNC13BO14795 1591 aa29.77■■■□□ 2.36
C10orf55-202ENST00000412307 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
C10orf55-202ENST00000412307 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.36
C10orf55-202ENST00000412307 ATP7AQ04656 1500 aa29.76■■■□□ 2.35
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C10orf55-202ENST00000412307 KIF3BO15066 747 aa29.72■■■□□ 2.35
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