RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409025.5

USP39-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 39, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP39, Length 1,946 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP39-202ENST00000409025 ABCC5O15440 1437 aa27.73■■■□□ 2.03
USP39-202ENST00000409025 ROCK1Q13464 1354 aa27.71■■■□□ 2.03
USP39-202ENST00000409025 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa27.7■■■□□ 2.02
USP39-202ENST00000409025 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
USP39-202ENST00000409025 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
USP39-202ENST00000409025 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
USP39-202ENST00000409025 OSCARQ8IYS5 282 aa27.61■■■□□ 2.01
USP39-202ENST00000409025 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.6■■■□□ 2.01
USP39-202ENST00000409025 CROCC2H7BZ55 1655 aa27.6■■■□□ 2.01
USP39-202ENST00000409025 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
USP39-202ENST00000409025 ADGBQ8N7X0 1667 aa27.59■■■□□ 2.01
USP39-202ENST00000409025 KDM6BO15054 1643 aa27.58■■■□□ 2.01
USP39-202ENST00000409025 PREX2Q70Z35 1606 aa27.58■■■□□ 2.01
USP39-202ENST00000409025 SIN3AQ96ST3 1273 aa27.55■■■□□ 2
USP39-202ENST00000409025 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.55■■■□□ 2
USP39-202ENST00000409025 ADGRL2O95490 1459 aa27.54■■■□□ 2
USP39-202ENST00000409025 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.54■■■□□ 2
USP39-202ENST00000409025 TRIM52Q96A61 297 aa27.53■■■□□ 2
USP39-202ENST00000409025 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa27.53■■■□□ 2
USP39-202ENST00000409025 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.53■■■□□ 2
USP39-202ENST00000409025 NEUROD1Q13562 356 aa27.53■■■□□ 2
USP39-202ENST00000409025 NCOA1Q15788 1441 aa27.51■■□□□ 1.99
USP39-202ENST00000409025 SHANK2Q9UPX8 1470 aa27.5■■□□□ 1.99
USP39-202ENST00000409025 ARHGEF5Q12774 1597 aa27.49■■□□□ 1.99
USP39-202ENST00000409025 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
USP39-202ENST00000409025 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa27.48■■□□□ 1.99
USP39-202ENST00000409025 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa27.48■■□□□ 1.99
USP39-202ENST00000409025 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.48■■□□□ 1.99
USP39-202ENST00000409025 KCNH8Q96L42 1107 aa27.47■■□□□ 1.99
USP39-202ENST00000409025 ARHGAP5Q13017 1502 aa27.46■■□□□ 1.99
USP39-202ENST00000409025 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.44■■□□□ 1.98
USP39-202ENST00000409025 TSPY4P0CV99 314 aa27.43■■□□□ 1.98
USP39-202ENST00000409025 TSPY10P0CW01 314 aa27.43■■□□□ 1.98
USP39-202ENST00000409025 MBD5Q9P267 1494 aa27.43■■□□□ 1.98
USP39-202ENST00000409025 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.42■■□□□ 1.98
USP39-202ENST00000409025 RSPH4AQ5TD94 716 aa27.42■■□□□ 1.98
USP39-202ENST00000409025 MPHOSPH9Q99550 1183 aa27.42■■□□□ 1.98
USP39-202ENST00000409025 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.4■■□□□ 1.98
USP39-202ENST00000409025 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
USP39-202ENST00000409025 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa27.37■■□□□ 1.97
USP39-202ENST00000409025 PLCH2O75038 1416 aa27.37■■□□□ 1.97
USP39-202ENST00000409025 TONSLQ96HA7 1378 aa27.36■■□□□ 1.97
USP39-202ENST00000409025 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.35■■□□□ 1.97
USP39-202ENST00000409025 WDR7Q9Y4E6 1490 aa27.35■■□□□ 1.97
USP39-202ENST00000409025 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa27.34■■□□□ 1.97
USP39-202ENST00000409025 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa27.34■■□□□ 1.97
USP39-202ENST00000409025 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
USP39-202ENST00000409025 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.3■■□□□ 1.96
USP39-202ENST00000409025 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
USP39-202ENST00000409025 MAST1Q9Y2H9 1570 aa27.29■■□□□ 1.96
USP39-202ENST00000409025 KIF15Q9NS87 1388 aa27.28■■□□□ 1.96
USP39-202ENST00000409025 ARAP3Q8WWN8 1544 aa27.27■■□□□ 1.96
USP39-202ENST00000409025 PZPP20742 1482 aa27.26■■□□□ 1.95
USP39-202ENST00000409025 ASXL2Q76L83 1435 aa27.24■■□□□ 1.95
USP39-202ENST00000409025 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.24■■□□□ 1.95
USP39-202ENST00000409025 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa27.22■■□□□ 1.95
USP39-202ENST00000409025 ABCA9Q8IUA7 1624 aa27.22■■□□□ 1.95
USP39-202ENST00000409025 FOXD1Q16676 465 aa27.22■■□□□ 1.95
USP39-202ENST00000409025 ABCC1P33527 1531 aa27.21■■□□□ 1.95
USP39-202ENST00000409025 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.21■■□□□ 1.95
USP39-202ENST00000409025 PLXNC1O60486 1568 aa27.17■■□□□ 1.94
USP39-202ENST00000409025 KDM5DQ9BY66 1539 aa27.16■■□□□ 1.94
USP39-202ENST00000409025 NUP155O75694 1391 aa27.15■■□□□ 1.94
USP39-202ENST00000409025 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
USP39-202ENST00000409025 FANCAO15360 1455 aa27.1■■□□□ 1.93
USP39-202ENST00000409025 PKD2Q13563 968 aa27.1■■□□□ 1.93
USP39-202ENST00000409025 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa27.1■■□□□ 1.93
USP39-202ENST00000409025 DUOX2Q9NRD8 1548 aa27.08■■□□□ 1.93
USP39-202ENST00000409025 L3MBTL2Q969R5 705 aa27.04■■□□□ 1.92
USP39-202ENST00000409025 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa27.04■■□□□ 1.92
USP39-202ENST00000409025 UNC13BO14795 1591 aa27.03■■□□□ 1.92
USP39-202ENST00000409025 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
USP39-202ENST00000409025 ERBINQ96RT1 1412 aa27.02■■□□□ 1.92
USP39-202ENST00000409025 FAM135AQ9P2D6 1515 aa27.01■■□□□ 1.91
USP39-202ENST00000409025 ADGRL1O94910 1474 aa27■■□□□ 1.91
USP39-202ENST00000409025 TEX14Q8IWB6 1497 aa27■■□□□ 1.91
USP39-202ENST00000409025 AFAP1Q8N556 730 aa26.99■■□□□ 1.91
USP39-202ENST00000409025 MIER1Q8N108 512 aa26.98■■□□□ 1.91
USP39-202ENST00000409025 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26.98■■□□□ 1.91
USP39-202ENST00000409025 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.97■■□□□ 1.91
USP39-202ENST00000409025 CD109Q6YHK3 1445 aa26.95■■□□□ 1.9
USP39-202ENST00000409025 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.94■■□□□ 1.9
USP39-202ENST00000409025 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.94■■□□□ 1.9
USP39-202ENST00000409025 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.94■■□□□ 1.9
USP39-202ENST00000409025 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.94■■□□□ 1.9
USP39-202ENST00000409025 IQGAP3Q86VI3 1631 aa26.93■■□□□ 1.9
USP39-202ENST00000409025 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
USP39-202ENST00000409025 ATP7AQ04656 1500 aa26.92■■□□□ 1.9
USP39-202ENST00000409025 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.91■■□□□ 1.9
USP39-202ENST00000409025 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.91■■□□□ 1.93e-6■□□□□ 10.3
USP39-202ENST00000409025 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.9■■□□□ 1.9
USP39-202ENST00000409025 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
USP39-202ENST00000409025 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.84■■□□□ 1.89
USP39-202ENST00000409025 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.84■■□□□ 1.89
USP39-202ENST00000409025 NBPF8Q3BBV2 869 aa26.82■■□□□ 1.88
USP39-202ENST00000409025 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.79■■□□□ 1.88
USP39-202ENST00000409025 NEO1Q92859 1461 aa26.78■■□□□ 1.88
USP39-202ENST00000409025 DEPDC5O75140 1603 aa26.77■■□□□ 1.88
USP39-202ENST00000409025 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
USP39-202ENST00000409025 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
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