RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373930.3

MEGF9-201, Transcript of multiple EGF like domains 9, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene MEGF9, Length 6,298 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEGF9-201ENST00000373930 FKBP8Q14318 412 aa22.84■■□□□ 1.25
MEGF9-201ENST00000373930 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.82■■□□□ 1.24
MEGF9-201ENST00000373930 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
MEGF9-201ENST00000373930 SMARCA2P51531 1590 aa22.82■■□□□ 1.24
MEGF9-201ENST00000373930 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.81■■□□□ 1.24
MEGF9-201ENST00000373930 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.81■■□□□ 1.24
MEGF9-201ENST00000373930 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
MEGF9-201ENST00000373930 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
MEGF9-201ENST00000373930 NCLP19338 710 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
MEGF9-201ENST00000373930 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa22.8■■□□□ 1.24
MEGF9-201ENST00000373930 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
MEGF9-201ENST00000373930 JPH4Q96JJ6 628 aa22.79■■□□□ 1.24
MEGF9-201ENST00000373930 TAF7LQ5H9L4 462 aa22.79■■□□□ 1.24
MEGF9-201ENST00000373930 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
MEGF9-201ENST00000373930 AMPHP49418 695 aa22.77■■□□□ 1.23
MEGF9-201ENST00000373930 EEA1Q15075 1411 aa22.73■■□□□ 1.23
MEGF9-201ENST00000373930 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
MEGF9-201ENST00000373930 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
MEGF9-201ENST00000373930 ATF3P18847 181 aa22.72■■□□□ 1.23
MEGF9-201ENST00000373930 FOXD1Q16676 465 aa22.72■■□□□ 1.23
MEGF9-201ENST00000373930 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.71■■□□□ 1.23
MEGF9-201ENST00000373930 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
MEGF9-201ENST00000373930 PIP4K2BP78356 416 aa22.7■■□□□ 1.22
MEGF9-201ENST00000373930 NBR1Q14596 966 aa22.7■■□□□ 1.22
MEGF9-201ENST00000373930 GORABQ5T7V8 394 aa22.69■■□□□ 1.22
MEGF9-201ENST00000373930 PKD2Q13563 968 aa22.68■■□□□ 1.22
MEGF9-201ENST00000373930 CEP162Q5TB80 1403 aa22.67■■□□□ 1.22
MEGF9-201ENST00000373930 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.66■■□□□ 1.22
MEGF9-201ENST00000373930 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa22.64■■□□□ 1.21
MEGF9-201ENST00000373930 PSME1Q06323 249 aa22.62■■□□□ 1.21
MEGF9-201ENST00000373930 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
MEGF9-201ENST00000373930 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
MEGF9-201ENST00000373930 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
MEGF9-201ENST00000373930 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
MEGF9-201ENST00000373930 FBXW7Q969H0 707 aa22.59■■□□□ 1.21
MEGF9-201ENST00000373930 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
MEGF9-201ENST00000373930 NUP155O75694 1391 aa22.58■■□□□ 1.21
MEGF9-201ENST00000373930 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.58■■□□□ 1.2
MEGF9-201ENST00000373930 APBB1O00213 710 aa22.57■■□□□ 1.2
MEGF9-201ENST00000373930 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
MEGF9-201ENST00000373930 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.56■■□□□ 1.2
MEGF9-201ENST00000373930 PTPRGP23470 1445 aa22.56■■□□□ 1.2
MEGF9-201ENST00000373930 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.54■■□□□ 1.2
MEGF9-201ENST00000373930 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
MEGF9-201ENST00000373930 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.53■■□□□ 1.2
MEGF9-201ENST00000373930 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.53■■□□□ 1.2
MEGF9-201ENST00000373930 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
MEGF9-201ENST00000373930 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.52■■□□□ 1.2
MEGF9-201ENST00000373930 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.51■■□□□ 1.19
MEGF9-201ENST00000373930 PRM3Q9NNZ6 103 aa22.5■■□□□ 1.19
MEGF9-201ENST00000373930 MS4A1P11836 297 aa22.49■■□□□ 1.19
MEGF9-201ENST00000373930 STK31Q9BXU1 1019 aa22.49■■□□□ 1.19
MEGF9-201ENST00000373930 VPS53Q5VIR6 699 aa22.48■■□□□ 1.19
MEGF9-201ENST00000373930 TRIM34Q9BYJ4 488 aa22.47■■□□□ 1.19
MEGF9-201ENST00000373930 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
MEGF9-201ENST00000373930 NGEFQ8N5V2 710 aa22.47■■□□□ 1.19
MEGF9-201ENST00000373930 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
MEGF9-201ENST00000373930 BECN1Q14457 450 aa22.45■■□□□ 1.18
MEGF9-201ENST00000373930 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.45■■□□□ 1.18
MEGF9-201ENST00000373930 RAD21O60216 631 aa22.44■■□□□ 1.18
MEGF9-201ENST00000373930 GOLGA6L22H0YM25 854 aa22.44■■□□□ 1.18
MEGF9-201ENST00000373930 USP35Q9P2H5 1018 aa22.44■■□□□ 1.18
MEGF9-201ENST00000373930 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
MEGF9-201ENST00000373930 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
MEGF9-201ENST00000373930 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.42■■□□□ 1.18
MEGF9-201ENST00000373930 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.42■■□□□ 1.18
MEGF9-201ENST00000373930 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.39■■□□□ 1.18
MEGF9-201ENST00000373930 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
MEGF9-201ENST00000373930 TOMM22Q9NS69 142 aa22.39■■□□□ 1.17
MEGF9-201ENST00000373930 SLC4A10Q6U841 1118 aa22.38■■□□□ 1.17
MEGF9-201ENST00000373930 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.37■■□□□ 1.17
MEGF9-201ENST00000373930 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.37■■□□□ 1.17
MEGF9-201ENST00000373930 FMN1Q68DA7 1419 aa22.36■■□□□ 1.17
MEGF9-201ENST00000373930 RGS3P49796 1198 aa22.36■■□□□ 1.17
MEGF9-201ENST00000373930 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.36■■□□□ 1.17
MEGF9-201ENST00000373930 COG3Q96JB2 828 aa22.35■■□□□ 1.17
MEGF9-201ENST00000373930 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
MEGF9-201ENST00000373930 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
MEGF9-201ENST00000373930 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.34■■□□□ 1.17
MEGF9-201ENST00000373930 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.33■■□□□ 1.17
MEGF9-201ENST00000373930 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
MEGF9-201ENST00000373930 PLCB2Q00722 1185 aa22.33■■□□□ 1.16
MEGF9-201ENST00000373930 MCCP23508 829 aa22.32■■□□□ 1.16
MEGF9-201ENST00000373930 STRN4Q9NRL3 753 aa22.31■■□□□ 1.16
MEGF9-201ENST00000373930 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa22.31■■□□□ 1.16
MEGF9-201ENST00000373930 NUTM2GQ5VZR2 741 aa22.3■■□□□ 1.16
MEGF9-201ENST00000373930 TEFQ10587 303 aa22.3■■□□□ 1.16
MEGF9-201ENST00000373930 MARCH6O60337 910 aa22.29■■□□□ 1.16
MEGF9-201ENST00000373930 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
MEGF9-201ENST00000373930 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa22.28■■□□□ 1.16
MEGF9-201ENST00000373930 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.28■■□□□ 1.16
MEGF9-201ENST00000373930 VPS37DQ86XT2 251 aa22.28■■□□□ 1.16
MEGF9-201ENST00000373930 GPATCH3Q96I76 525 aa22.28■■□□□ 1.16
MEGF9-201ENST00000373930 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
MEGF9-201ENST00000373930 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
MEGF9-201ENST00000373930 PTMAP06454 111 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.15
MEGF9-201ENST00000373930 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.27■■□□□ 1.15
MEGF9-201ENST00000373930 NLRP2Q9NX02 1062 aa22.26■■□□□ 1.15
MEGF9-201ENST00000373930 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.26■■□□□ 1.15
MEGF9-201ENST00000373930 ESCO1Q5FWF5 840 aa22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.3 ms