RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371935.6

REXO4-201, Transcript of REX4 homolog, 3'-5' exonuclease, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene REXO4, Length 1,899 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO4-201ENST00000371935 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa36.97■■■■□ 3.51
REXO4-201ENST00000371935 ROCK1Q13464 1354 aa36.94■■■■□ 3.5
REXO4-201ENST00000371935 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa36.94■■■■□ 3.5
REXO4-201ENST00000371935 CROCC2H7BZ55 1655 aa36.93■■■■□ 3.5
REXO4-201ENST00000371935 KDM6BO15054 1643 aa36.9■■■■□ 3.5
REXO4-201ENST00000371935 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP36.9■■■■□ 3.5
REXO4-201ENST00000371935 ADGBQ8N7X0 1667 aa36.87■■■■□ 3.49
REXO4-201ENST00000371935 PREX2Q70Z35 1606 aa36.86■■■■□ 3.49
REXO4-201ENST00000371935 KDM5BQ9UGL1 1544 aa36.85■■■■□ 3.49
REXO4-201ENST00000371935 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa36.83■■■■□ 3.49
REXO4-201ENST00000371935 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP36.82■■■■□ 3.48
REXO4-201ENST00000371935 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP36.82■■■■□ 3.48
REXO4-201ENST00000371935 TTC37Q6PGP7 1564 aa36.8■■■■□ 3.48
REXO4-201ENST00000371935 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP36.78■■■■□ 3.48
REXO4-201ENST00000371935 ADGRL2O95490 1459 aa36.77■■■■□ 3.48
REXO4-201ENST00000371935 OSCARQ8IYS5 282 aa36.73■■■■□ 3.47
REXO4-201ENST00000371935 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa36.72■■■■□ 3.47
REXO4-201ENST00000371935 SIN3AQ96ST3 1273 aa36.72■■■■□ 3.47
REXO4-201ENST00000371935 SHANK2Q9UPX8 1470 aa36.72■■■■□ 3.47
REXO4-201ENST00000371935 MYO5CQ9NQX4 1742 aa36.72■■■■□ 3.47
REXO4-201ENST00000371935 ARHGEF5Q12774 1597 aa36.71■■■■□ 3.47
REXO4-201ENST00000371935 NCOA1Q15788 1441 aa36.69■■■■□ 3.46
REXO4-201ENST00000371935 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP36.66■■■■□ 3.46
REXO4-201ENST00000371935 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP36.65■■■■□ 3.46
REXO4-201ENST00000371935 MBD5Q9P267 1494 aa36.63■■■■□ 3.45
REXO4-201ENST00000371935 NEUROD1Q13562 356 aa36.62■■■■□ 3.45
REXO4-201ENST00000371935 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa36.62■■■■□ 3.45
REXO4-201ENST00000371935 ARHGAP5Q13017 1502 aa36.62■■■■□ 3.45
REXO4-201ENST00000371935 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa36.6■■■■□ 3.45
REXO4-201ENST00000371935 TRIM52Q96A61 297 aa36.6■■■■□ 3.45
REXO4-201ENST00000371935 C9orf84Q5VXU9 1444 aa36.6■■■■□ 3.45
REXO4-201ENST00000371935 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP36.58■■■■□ 3.45
REXO4-201ENST00000371935 CCDC141Q6ZP82 1450 aa36.56■■■■□ 3.44
REXO4-201ENST00000371935 KCNH8Q96L42 1107 aa36.55■■■■□ 3.44
REXO4-201ENST00000371935 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP36.52■■■■□ 3.445e-6■■■■□ 20.3
REXO4-201ENST00000371935 SYCP2Q9BX26 1530 aa36.52■■■■□ 3.44
REXO4-201ENST00000371935 MPHOSPH9Q99550 1183 aa36.52■■■■□ 3.44
REXO4-201ENST00000371935 PLCH2O75038 1416 aa36.5■■■■□ 3.43
REXO4-201ENST00000371935 WDR7Q9Y4E6 1490 aa36.49■■■■□ 3.43
REXO4-201ENST00000371935 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa36.48■■■■□ 3.43
REXO4-201ENST00000371935 TSPY4P0CV99 314 aa36.47■■■■□ 3.43
REXO4-201ENST00000371935 TSPY10P0CW01 314 aa36.47■■■■□ 3.43
REXO4-201ENST00000371935 RSPH4AQ5TD94 716 aa36.46■■■■□ 3.43
REXO4-201ENST00000371935 MAST1Q9Y2H9 1570 aa36.46■■■■□ 3.43
REXO4-201ENST00000371935 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa36.45■■■■□ 3.43
REXO4-201ENST00000371935 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa36.44■■■■□ 3.42
REXO4-201ENST00000371935 TONSLQ96HA7 1378 aa36.42■■■■□ 3.42
REXO4-201ENST00000371935 PZPP20742 1482 aa36.41■■■■□ 3.42
REXO4-201ENST00000371935 ARAP3Q8WWN8 1544 aa36.41■■■■□ 3.42
REXO4-201ENST00000371935 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP36.37■■■■□ 3.41
REXO4-201ENST00000371935 KIF15Q9NS87 1388 aa36.37■■■■□ 3.41
REXO4-201ENST00000371935 ABCA9Q8IUA7 1624 aa36.37■■■■□ 3.41
REXO4-201ENST00000371935 ABCC1P33527 1531 aa36.36■■■■□ 3.41
REXO4-201ENST00000371935 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa36.36■■■■□ 3.41
REXO4-201ENST00000371935 ASXL2Q76L83 1435 aa36.33■■■■□ 3.41
REXO4-201ENST00000371935 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa36.33■■■■□ 3.41
REXO4-201ENST00000371935 PLXNC1O60486 1568 aa36.31■■■■□ 3.4
REXO4-201ENST00000371935 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa36.31■■■■□ 3.4
REXO4-201ENST00000371935 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP36.31■■■■□ 3.4
REXO4-201ENST00000371935 KDM5DQ9BY66 1539 aa36.29■■■■□ 3.4
REXO4-201ENST00000371935 FOXD1Q16676 465 aa36.28■■■■□ 3.4
REXO4-201ENST00000371935 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.26■■■■□ 3.39
REXO4-201ENST00000371935 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP36.2■■■■□ 3.39
REXO4-201ENST00000371935 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP36.18■■■■□ 3.38
REXO4-201ENST00000371935 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa36.17■■■■□ 3.38
REXO4-201ENST00000371935 NUP155O75694 1391 aa36.16■■■■□ 3.38
REXO4-201ENST00000371935 FANCAO15360 1455 aa36.15■■■■□ 3.38
REXO4-201ENST00000371935 UNC13BO14795 1591 aa36.14■■■■□ 3.38
REXO4-201ENST00000371935 DUOX2Q9NRD8 1548 aa36.12■■■■□ 3.37
REXO4-201ENST00000371935 PKD2Q13563 968 aa36.09■■■■□ 3.37
REXO4-201ENST00000371935 TEX14Q8IWB6 1497 aa36.07■■■■□ 3.37
REXO4-201ENST00000371935 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa36.06■■■■□ 3.36
REXO4-201ENST00000371935 FAM135AQ9P2D6 1515 aa36.04■■■■□ 3.36
REXO4-201ENST00000371935 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa36.04■■■■□ 3.36
REXO4-201ENST00000371935 ERBINQ96RT1 1412 aa36.04■■■■□ 3.36
REXO4-201ENST00000371935 L3MBTL2Q969R5 705 aa36.01■■■■□ 3.36
REXO4-201ENST00000371935 ADGRL1O94910 1474 aa36.01■■■■□ 3.35
REXO4-201ENST00000371935 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP36■■■■□ 3.35
REXO4-201ENST00000371935 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.99■■■■□ 3.35
REXO4-201ENST00000371935 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.99■■■■□ 3.35
REXO4-201ENST00000371935 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.99■■■■□ 3.35
REXO4-201ENST00000371935 IQGAP3Q86VI3 1631 aa35.99■■■■□ 3.35
REXO4-201ENST00000371935 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP35.98■■■■□ 3.35
REXO4-201ENST00000371935 MAGI2Q86UL8 1455 aa35.98■■■■□ 3.35
REXO4-201ENST00000371935 AFAP1Q8N556 730 aa35.96■■■■□ 3.35
REXO4-201ENST00000371935 CFAP74Q9C0B2 1584 aa35.96■■■■□ 3.35
REXO4-201ENST00000371935 SCAPERQ9BY12 1400 aa35.95■■■■□ 3.34
REXO4-201ENST00000371935 MIER1Q8N108 512 aa35.94■■■■□ 3.34
REXO4-201ENST00000371935 ATP7AQ04656 1500 aa35.94■■■■□ 3.34
REXO4-201ENST00000371935 CD109Q6YHK3 1445 aa35.91■■■■□ 3.34
REXO4-201ENST00000371935 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.81■■■■□ 3.32
REXO4-201ENST00000371935 DEPDC5O75140 1603 aa35.81■■■■□ 3.32
REXO4-201ENST00000371935 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP35.8■■■■□ 3.322e-6■■■□□ 15.2
REXO4-201ENST00000371935 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP35.8■■■■□ 3.32
REXO4-201ENST00000371935 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa35.79■■■■□ 3.32
REXO4-201ENST00000371935 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa35.78■■■■□ 3.32
REXO4-201ENST00000371935 NBPF8Q3BBV2 869 aa35.78■■■■□ 3.32
REXO4-201ENST00000371935 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP35.76■■■■□ 3.31
REXO4-201ENST00000371935 KDM5CP41229 1560 aa35.75■■■■□ 3.31
REXO4-201ENST00000371935 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa35.74■■■■□ 3.31
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