RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357365.7

SDCCAG3-202, Transcript of Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

APPRIS P4 TSL 5 BASIC

Gene SDCCAG3, Length 2,304 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3-202ENST00000357365 AKNAQ7Z591 1439 aa41.51■■■■■ 4.24
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SDCCAG3-202ENST00000357365 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.45■■■■■ 4.23
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SDCCAG3-202ENST00000357365 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP41.34■■■■■ 4.21
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SDCCAG3-202ENST00000357365 TONSLQ96HA7 1378 aa41.17■■■■■ 4.18
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SDCCAG3-202ENST00000357365 PREX2Q70Z35 1606 aa41.08■■■■■ 4.17
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SDCCAG3-202ENST00000357365 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41■■■■■ 4.15
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SDCCAG3-202ENST00000357365 TSPY10P0CW01 314 aa40.92■■■■■ 4.14
SDCCAG3-202ENST00000357365 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP40.92■■■■■ 4.14
SDCCAG3-202ENST00000357365 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa40.92■■■■■ 4.14
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SDCCAG3-202ENST00000357365 CCDC141Q6ZP82 1450 aa40.85■■■■■ 4.13
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SDCCAG3-202ENST00000357365 PLCH2O75038 1416 aa40.71■■■■■ 4.11
SDCCAG3-202ENST00000357365 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa40.7■■■■■ 4.11
SDCCAG3-202ENST00000357365 PKD2Q13563 968 aa40.7■■■■■ 4.11
SDCCAG3-202ENST00000357365 RSPH4AQ5TD94 716 aa40.7■■■■■ 4.11
SDCCAG3-202ENST00000357365 NUP155O75694 1391 aa40.69■■■■■ 4.1
SDCCAG3-202ENST00000357365 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa40.67■■■■■ 4.1
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SDCCAG3-202ENST00000357365 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.59■■■■■ 4.09
SDCCAG3-202ENST00000357365 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa40.59■■■■■ 4.09
SDCCAG3-202ENST00000357365 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP40.58■■■■■ 4.09
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SDCCAG3-202ENST00000357365 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP40.52■■■■■ 4.08
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SDCCAG3-202ENST00000357365 PLXNC1O60486 1568 aa40.47■■■■■ 4.07
SDCCAG3-202ENST00000357365 ASXL2Q76L83 1435 aa40.45■■■■■ 4.07
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SDCCAG3-202ENST00000357365 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.39■■■■■ 4.06
SDCCAG3-202ENST00000357365 AFAP1Q8N556 730 aa40.37■■■■■ 4.05
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SDCCAG3-202ENST00000357365 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP40.33■■■■■ 4.05
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SDCCAG3-202ENST00000357365 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP40.16■■■■■ 4.02
SDCCAG3-202ENST00000357365 SCAPERQ9BY12 1400 aa40.16■■■■■ 4.02
SDCCAG3-202ENST00000357365 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa40.15■■■■■ 4.02
SDCCAG3-202ENST00000357365 PLA2R1Q13018 1463 aa40.14■■■■■ 4.02
SDCCAG3-202ENST00000357365 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa40.13■■■■■ 4.01
SDCCAG3-202ENST00000357365 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa40.1■■■■■ 4.01
SDCCAG3-202ENST00000357365 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa40.09■■■■■ 4.01
SDCCAG3-202ENST00000357365 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP40.09■■■■■ 4.01
SDCCAG3-202ENST00000357365 ATP7AQ04656 1500 aa40.09■■■■■ 4.01
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