RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323081.12

SPNS1-202, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SPNS1, Length 2,102 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-202ENST00000323081 ABCC5O15440 1437 aa25.23■■□□□ 1.63
SPNS1-202ENST00000323081 CHD1O14646 1710 aa25.23■■□□□ 1.63
SPNS1-202ENST00000323081 TONSLQ96HA7 1378 aa25.22■■□□□ 1.63
SPNS1-202ENST00000323081 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
SPNS1-202ENST00000323081 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.22■■□□□ 1.63
SPNS1-202ENST00000323081 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
SPNS1-202ENST00000323081 ROCK1Q13464 1354 aa25.19■■□□□ 1.62
SPNS1-202ENST00000323081 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.16■■□□□ 1.62
SPNS1-202ENST00000323081 ATP10BO94823 1461 aa25.15■■□□□ 1.62
SPNS1-202ENST00000323081 TRIM52Q96A61 297 aa25.14■■□□□ 1.62
SPNS1-202ENST00000323081 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
SPNS1-202ENST00000323081 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.11■■□□□ 1.61
SPNS1-202ENST00000323081 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
SPNS1-202ENST00000323081 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.09■■□□□ 1.61
SPNS1-202ENST00000323081 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
SPNS1-202ENST00000323081 PTPRGP23470 1445 aa25.08■■□□□ 1.61
SPNS1-202ENST00000323081 SHROOM2Q13796 1616 aa25.08■■□□□ 1.61
SPNS1-202ENST00000323081 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.08■■□□□ 1.6
SPNS1-202ENST00000323081 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.07■■□□□ 1.6
SPNS1-202ENST00000323081 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.07■■□□□ 1.6
SPNS1-202ENST00000323081 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.06■■□□□ 1.6
SPNS1-202ENST00000323081 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.06■■□□□ 1.6
SPNS1-202ENST00000323081 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
SPNS1-202ENST00000323081 NCOA1Q15788 1441 aa25.01■■□□□ 1.59
SPNS1-202ENST00000323081 ADGRL2O95490 1459 aa25■■□□□ 1.59
SPNS1-202ENST00000323081 FOXD1Q16676 465 aa24.97■■□□□ 1.59
SPNS1-202ENST00000323081 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.97■■□□□ 1.59
SPNS1-202ENST00000323081 KCNH8Q96L42 1107 aa24.95■■□□□ 1.59
SPNS1-202ENST00000323081 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.93■■□□□ 1.58
SPNS1-202ENST00000323081 PZPP20742 1482 aa24.91■■□□□ 1.58
SPNS1-202ENST00000323081 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.9■■□□□ 1.58
SPNS1-202ENST00000323081 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.89■■□□□ 1.58
SPNS1-202ENST00000323081 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
SPNS1-202ENST00000323081 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
SPNS1-202ENST00000323081 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.88■■□□□ 1.57
SPNS1-202ENST00000323081 PREX2Q70Z35 1606 aa24.87■■□□□ 1.57
SPNS1-202ENST00000323081 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.87■■□□□ 1.57
SPNS1-202ENST00000323081 ABCC2Q92887 1545 aa24.86■■□□□ 1.57
SPNS1-202ENST00000323081 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.86■■□□□ 1.57
SPNS1-202ENST00000323081 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.85■■□□□ 1.57
SPNS1-202ENST00000323081 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa24.84■■□□□ 1.57
SPNS1-202ENST00000323081 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.84■■□□□ 1.57
SPNS1-202ENST00000323081 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.84■■□□□ 1.57
SPNS1-202ENST00000323081 ANP32CO43423 234 aa24.83■■□□□ 1.57
SPNS1-202ENST00000323081 MBD5Q9P267 1494 aa24.83■■□□□ 1.57
SPNS1-202ENST00000323081 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.82■■□□□ 1.56
SPNS1-202ENST00000323081 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.81■■□□□ 1.56
SPNS1-202ENST00000323081 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.79■■□□□ 1.56
SPNS1-202ENST00000323081 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.78■■□□□ 1.563e-6■■□□□ 13.1
SPNS1-202ENST00000323081 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
SPNS1-202ENST00000323081 CCER2I3L3R5 266 aa24.77■■□□□ 1.56
SPNS1-202ENST00000323081 TSPY4P0CV99 314 aa24.76■■□□□ 1.55
SPNS1-202ENST00000323081 TSPY10P0CW01 314 aa24.76■■□□□ 1.55
SPNS1-202ENST00000323081 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.76■■□□□ 1.55
SPNS1-202ENST00000323081 MYT1Q01538 1121 aa24.76■■□□□ 1.55
SPNS1-202ENST00000323081 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP24.75■■□□□ 1.55
SPNS1-202ENST00000323081 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.74■■□□□ 1.55
SPNS1-202ENST00000323081 KIF15Q9NS87 1388 aa24.72■■□□□ 1.55
SPNS1-202ENST00000323081 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
SPNS1-202ENST00000323081 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.71■■□□□ 1.55
SPNS1-202ENST00000323081 PKD2Q13563 968 aa24.71■■□□□ 1.55
SPNS1-202ENST00000323081 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.71■■□□□ 1.55
SPNS1-202ENST00000323081 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.71■■□□□ 1.55
SPNS1-202ENST00000323081 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.71■■□□□ 1.55
SPNS1-202ENST00000323081 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.7■■□□□ 1.54
SPNS1-202ENST00000323081 WASHC2AQ641Q2 1341 aa24.69■■□□□ 1.54
SPNS1-202ENST00000323081 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.69■■□□□ 1.54
SPNS1-202ENST00000323081 NUP155O75694 1391 aa24.68■■□□□ 1.54
SPNS1-202ENST00000323081 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.66■■□□□ 1.54
SPNS1-202ENST00000323081 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.64■■□□□ 1.54
SPNS1-202ENST00000323081 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
SPNS1-202ENST00000323081 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.58■■□□□ 1.53
SPNS1-202ENST00000323081 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.58■■□□□ 1.53
SPNS1-202ENST00000323081 PLCH2O75038 1416 aa24.57■■□□□ 1.52
SPNS1-202ENST00000323081 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa24.57■■□□□ 1.52
SPNS1-202ENST00000323081 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
SPNS1-202ENST00000323081 PLXNC1O60486 1568 aa24.55■■□□□ 1.52
SPNS1-202ENST00000323081 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.55■■□□□ 1.52
SPNS1-202ENST00000323081 CCDC7Q96M83 1385 aa24.53■■□□□ 1.52
SPNS1-202ENST00000323081 UNC13BO14795 1591 aa24.52■■□□□ 1.52
SPNS1-202ENST00000323081 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.51■■□□□ 1.51
SPNS1-202ENST00000323081 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
SPNS1-202ENST00000323081 ABCC1P33527 1531 aa24.5■■□□□ 1.51
SPNS1-202ENST00000323081 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
SPNS1-202ENST00000323081 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa24.47■■□□□ 1.51
SPNS1-202ENST00000323081 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.46■■□□□ 1.51
SPNS1-202ENST00000323081 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24.44■■□□□ 1.5
SPNS1-202ENST00000323081 KIF7Q2M1P5 1343 aa24.44■■□□□ 1.5
SPNS1-202ENST00000323081 IQGAP3Q86VI3 1631 aa24.43■■□□□ 1.5
SPNS1-202ENST00000323081 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.43■■□□□ 1.5
SPNS1-202ENST00000323081 ARAP3Q8WWN8 1544 aa24.42■■□□□ 1.5
SPNS1-202ENST00000323081 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.42■■□□□ 1.5
SPNS1-202ENST00000323081 KDM5CP41229 1560 aa24.42■■□□□ 1.5
SPNS1-202ENST00000323081 RALGAPBQ86X10 1494 aa24.4■■□□□ 1.5
SPNS1-202ENST00000323081 ERBINQ96RT1 1412 aa24.4■■□□□ 1.5
SPNS1-202ENST00000323081 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.4■■□□□ 1.5
SPNS1-202ENST00000323081 USP47Q96K76 1375 aa24.4■■□□□ 1.5
SPNS1-202ENST00000323081 BCORL1Q5H9F3 1711 aa24.39■■□□□ 1.49
SPNS1-202ENST00000323081 PLA2R1Q13018 1463 aa24.38■■□□□ 1.49
SPNS1-202ENST00000323081 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.2 ms