RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316097.12

SCAMP4-201, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP4, Length 2,684 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4-201ENST00000316097 ANP32EQ9BTT0 268 aa24.48■■□□□ 1.51
SCAMP4-201ENST00000316097 NAIPQ13075 1403 aa24.48■■□□□ 1.51
SCAMP4-201ENST00000316097 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
SCAMP4-201ENST00000316097 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.48■■□□□ 1.51
SCAMP4-201ENST00000316097 HFM1A2PYH4 1435 aa24.47■■□□□ 1.51
SCAMP4-201ENST00000316097 KCNH8Q96L42 1107 aa24.46■■□□□ 1.51
SCAMP4-201ENST00000316097 MAPKBP1O60336 1514 aa24.45■■□□□ 1.5
SCAMP4-201ENST00000316097 OSCARQ8IYS5 282 aa24.42■■□□□ 1.5
SCAMP4-201ENST00000316097 ABCC5O15440 1437 aa24.41■■□□□ 1.5
SCAMP4-201ENST00000316097 DAPK1P53355 1430 aa24.4■■□□□ 1.5
SCAMP4-201ENST00000316097 BCANQ96GW7 911 aa24.38■■□□□ 1.49
SCAMP4-201ENST00000316097 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.38■■□□□ 1.49
SCAMP4-201ENST00000316097 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.38■■□□□ 1.49
SCAMP4-201ENST00000316097 ABCC2Q92887 1545 aa24.37■■□□□ 1.49
SCAMP4-201ENST00000316097 TRIM52Q96A61 297 aa24.37■■□□□ 1.49
SCAMP4-201ENST00000316097 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.37■■□□□ 1.49
SCAMP4-201ENST00000316097 KDM6BO15054 1643 aa24.35■■□□□ 1.49
SCAMP4-201ENST00000316097 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.34■■□□□ 1.492e-12■■□□□ 14.5
SCAMP4-201ENST00000316097 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.29■■□□□ 1.48
SCAMP4-201ENST00000316097 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
SCAMP4-201ENST00000316097 FKBP8Q14318 412 aa24.28■■□□□ 1.48
SCAMP4-201ENST00000316097 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.28■■□□□ 1.48
SCAMP4-201ENST00000316097 FOXD1Q16676 465 aa24.27■■□□□ 1.48
SCAMP4-201ENST00000316097 AKNAQ7Z591 1439 aa24.25■■□□□ 1.47
SCAMP4-201ENST00000316097 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
SCAMP4-201ENST00000316097 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.22■■□□□ 1.476e-6■■■■■ 38.2
SCAMP4-201ENST00000316097 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
SCAMP4-201ENST00000316097 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.22■■□□□ 1.47
SCAMP4-201ENST00000316097 ROCK1Q13464 1354 aa24.22■■□□□ 1.47
SCAMP4-201ENST00000316097 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.21■■□□□ 1.47
SCAMP4-201ENST00000316097 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.21■■□□□ 1.47
SCAMP4-201ENST00000316097 NCOA1Q15788 1441 aa24.2■■□□□ 1.46
SCAMP4-201ENST00000316097 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.2■■□□□ 1.46
SCAMP4-201ENST00000316097 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.2■■□□□ 1.46
SCAMP4-201ENST00000316097 TSPY4P0CV99 314 aa24.18■■□□□ 1.46
SCAMP4-201ENST00000316097 TSPY10P0CW01 314 aa24.18■■□□□ 1.46
SCAMP4-201ENST00000316097 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
SCAMP4-201ENST00000316097 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.16■■□□□ 1.46
SCAMP4-201ENST00000316097 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.15■■□□□ 1.46
SCAMP4-201ENST00000316097 BCL11AQ9H165 835 aa24.14■■□□□ 1.45
SCAMP4-201ENST00000316097 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.13■■□□□ 1.45
SCAMP4-201ENST00000316097 MBD5Q9P267 1494 aa24.13■■□□□ 1.45
SCAMP4-201ENST00000316097 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.12■■□□□ 1.45
SCAMP4-201ENST00000316097 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.12■■□□□ 1.45
SCAMP4-201ENST00000316097 NEFLP07196 543 aa24.12■■□□□ 1.45
SCAMP4-201ENST00000316097 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
SCAMP4-201ENST00000316097 PREX2Q70Z35 1606 aa24.11■■□□□ 1.45
SCAMP4-201ENST00000316097 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
SCAMP4-201ENST00000316097 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.07■■□□□ 1.44
SCAMP4-201ENST00000316097 CROCC2H7BZ55 1655 aa24.07■■□□□ 1.44
SCAMP4-201ENST00000316097 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
SCAMP4-201ENST00000316097 TONSLQ96HA7 1378 aa24.06■■□□□ 1.44
SCAMP4-201ENST00000316097 ADGRL2O95490 1459 aa24.05■■□□□ 1.44
SCAMP4-201ENST00000316097 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa24.05■■□□□ 1.44
SCAMP4-201ENST00000316097 PLCH2O75038 1416 aa24.05■■□□□ 1.44
SCAMP4-201ENST00000316097 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa24.04■■□□□ 1.44
SCAMP4-201ENST00000316097 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP24.03■■□□□ 1.44
SCAMP4-201ENST00000316097 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.03■■□□□ 1.44
SCAMP4-201ENST00000316097 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
SCAMP4-201ENST00000316097 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.02■■□□□ 1.44
SCAMP4-201ENST00000316097 KIF15Q9NS87 1388 aa24.02■■□□□ 1.44
SCAMP4-201ENST00000316097 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.02■■□□□ 1.44
SCAMP4-201ENST00000316097 ASXL2Q76L83 1435 aa24.02■■□□□ 1.44
SCAMP4-201ENST00000316097 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.02■■□□□ 1.44
SCAMP4-201ENST00000316097 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.01■■□□□ 1.43
SCAMP4-201ENST00000316097 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.99■■□□□ 1.43
SCAMP4-201ENST00000316097 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.99■■□□□ 1.43
SCAMP4-201ENST00000316097 AFAP1Q8N556 730 aa23.98■■□□□ 1.43
SCAMP4-201ENST00000316097 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.98■■□□□ 1.43
SCAMP4-201ENST00000316097 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.98■■□□□ 1.43
SCAMP4-201ENST00000316097 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.98■■□□□ 1.43
SCAMP4-201ENST00000316097 CCER2I3L3R5 266 aa23.97■■□□□ 1.43
SCAMP4-201ENST00000316097 ANP32CO43423 234 aa23.97■■□□□ 1.43
SCAMP4-201ENST00000316097 PZPP20742 1482 aa23.97■■□□□ 1.43
SCAMP4-201ENST00000316097 PKD2Q13563 968 aa23.97■■□□□ 1.43
SCAMP4-201ENST00000316097 NUP155O75694 1391 aa23.96■■□□□ 1.43
SCAMP4-201ENST00000316097 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.95■■□□□ 1.42
SCAMP4-201ENST00000316097 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.94■■□□□ 1.42
SCAMP4-201ENST00000316097 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.92■■□□□ 1.42
SCAMP4-201ENST00000316097 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.92■■□□□ 1.42
SCAMP4-201ENST00000316097 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.91■■□□□ 1.42
SCAMP4-201ENST00000316097 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.87■■□□□ 1.41
SCAMP4-201ENST00000316097 FANCAO15360 1455 aa23.86■■□□□ 1.41
SCAMP4-201ENST00000316097 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.86■■□□□ 1.41
SCAMP4-201ENST00000316097 ABCC1P33527 1531 aa23.85■■□□□ 1.41
SCAMP4-201ENST00000316097 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
SCAMP4-201ENST00000316097 MSH5O43196 834 aa23.82■■□□□ 1.4
SCAMP4-201ENST00000316097 ABCA9Q8IUA7 1624 aa23.81■■□□□ 1.4
SCAMP4-201ENST00000316097 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.8■■□□□ 1.4
SCAMP4-201ENST00000316097 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
SCAMP4-201ENST00000316097 MAST1Q9Y2H9 1570 aa23.77■■□□□ 1.4
SCAMP4-201ENST00000316097 ADGRL1O94910 1474 aa23.76■■□□□ 1.39
SCAMP4-201ENST00000316097 NBPF8Q3BBV2 869 aa23.76■■□□□ 1.39
SCAMP4-201ENST00000316097 CD109Q6YHK3 1445 aa23.76■■□□□ 1.39
SCAMP4-201ENST00000316097 ARAP3Q8WWN8 1544 aa23.73■■□□□ 1.39
SCAMP4-201ENST00000316097 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
SCAMP4-201ENST00000316097 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.72■■□□□ 1.39
SCAMP4-201ENST00000316097 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.72■■□□□ 1.39
SCAMP4-201ENST00000316097 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.72■■□□□ 1.39
SCAMP4-201ENST00000316097 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
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